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Gene

SSBP3

single stranded DNA binding protein 3

Sintesi

Localizzazione citogenetica
1p32.3
Coordinate
Cromosoma 1: 54.225.432–54.406.394 (GRCh38)
Esoni
18 esoni su 181 kb
Proteina
388 amminoacidi
Noto anche come
CSDP, SSDP, FLJ10355, SSDP1
Trascritto MANE Select
ENST00000610401.6NM_145716.4
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora SSBP3. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di SSBP3

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 1, con una parentesi dove si trova SSBP3. SSBP3 e 20 geni nelle vicinanze sul cromosoma 1, da 53.815.913 a 54.815.912.Cromosoma 11p32.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4454 Mb54,2 Mb54,4 Mb54,6 Mb54,8 MbNDC1: 53.765.460–53.838.582, filamento inversoNDC1YIPF1: 53.847.531–53.890.683, filamento inversoYIPF1DIO1: 53.891.239–53.911.086, filamento direttoDIO1IFT25: 53.911.573–53.946.588, filamento inversoIFT25LRRC42: 53.946.045–53.968.168, filamento direttoLRRC42LDLRAD1: 54.007.298–54.018.194, filamento inversoLDLRAD1TMEM59: 54.026.681–54.053.504, filamento inversoTMEM59TCEANC2: 54.052.867–54.112.524, filamento direttoTCEANC2: 54.132.686–54.200.073, filamento inversoCDCP2: 54.132.687–54.153.770, filamento inversoCDCP2CYB5RL: 54.169.646–54.200.073, filamento inversoCYB5RLMRPL37: 54.184.041–54.225.489, filamento direttoMRPL37SSBP3: 54.225.432–54.406.394, filamento inversoSSBP3ACOT11: 54.542.257–54.639.215, filamento direttoACOT11FAM151A: 54.609.177–54.623.556, filamento inversoFAM151AMROH7: 54.641.754–54.710.266, filamento direttoMROH7MROH7-TTC4: 54.641.786–54.742.308, filamento direttoMROH7-TTC4TTC4: 54.715.818–54.743.465, filamento direttoTTC4PARS2: 54.756.591–54.764.549, filamento inversoPARS2TTC22: 54.779.712–54.801.508, filamento inversoTTC22CIMAP2: 54.806.063–54.842.542, filamento direttoCIMAP2Diagramma di SSBP3: 18 esoni sul filamento inverso del cromosoma 1Esone 18: 54.225.432–54.227.160, 1729 basiEsone 17: 54.228.255–54.228.356, 102 basiEsone 16: 54.228.449–54.228.477, 29 basiEsone 15: 54.228.748–54.228.826, 79 basiEsone 14: 54.239.129–54.239.199, 71 basiEsone 13: 54.240.905–54.240.959, 55 basiEsone 12: 54.241.474–54.241.509, 36 basiEsone 11: 54.242.164–54.242.212, 49 basiEsone 10: 54.243.235–54.243.299, 65 basiEsone 9: 54.251.616–54.251.692, 77 basiEsone 8: 54.251.794–54.251.860, 67 basiEsone 7: 54.257.127–54.257.186, 60 basiEsone 6: 54.258.069–54.258.149, 81 basiEsone 5: 54.281.438–54.281.527, 90 basiEsone 4: 54.401.861–54.401.945, 85 basiEsone 3: 54.404.576–54.404.637, 62 basiEsone 2: 54.404.858–54.404.930, 73 basiEsone 1: 54.405.953–54.406.394, 442 basi181015′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 3,3 kb dei 181 kb del gene; 1167 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di SSBP3

6Bassa

Quanto è difficile sequenziare SSBP3 con letture corte, su 100

  • Mappabilità2,6%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni14%
  • Contenuto di GC31%
  • Copertura di riferimento0%

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene SSBP3: single stranded DNA binding protein 3. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/ssbp3

Vancouver

Dante Labs. Gene SSBP3: single stranded DNA binding protein 3 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/ssbp3

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