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Gene

MT3

metallothionein 3

Sintesi

Localizzazione citogenetica
16q13
Coordinate
Cromosoma 16: 56.589.528–56.591.085 (GRCh38)
Esoni
3 esoni su 1,6 kb
Proteina
68 amminoacidi
Noto anche come
GIF
Trascritto MANE Select
ENST00000200691.5NM_005954.4
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora MT3. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di MT3

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
Cromosoma 16, con una parentesi dove si trova MT3. MT3 e 21 geni nelle vicinanze sul cromosoma 16, da 56.090.307 a 57.090.306.Cromosoma 1616q13p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.356,2 Mb56,4 Mb56,6 Mb56,8 Mb57 MbGNAO1: 56.189.660–56.357.444, filamento direttoGNAO1AMFR: 56.361.449–56.425.598, filamento inversoAMFRNUDT21: 56.428.473–56.452.199, filamento inversoNUDT21: 56.430.556–56.501.497, filamento inversoOGFOD1: 56.451.508–56.479.122, filamento direttoOGFOD1BBS2: 56.465.640–56.582.667, filamento inversoBBS2MT4: 56.565.073–56.569.108, filamento direttoMT4MT3: 56.589.528–56.591.085, filamento direttoMT3MT2A: 56.608.130–56.609.503, filamento direttoMT2AMT1E: 56.625.475–56.627.112, filamento direttoMT1EMT1M: 56.632.485–56.633.986, filamento direttoMT1MMT1A: 56.638.202–56.640.087, filamento direttoMT1AMT1B: 56.651.885–56.653.204, filamento direttoMT1F: 56.657.640–56.660.698, filamento direttoMT1FMT1G: 56.666.730–56.668.072, filamento inversoMT1H: 56.669.660–56.671.135, filamento direttoMT1HMT1X: 56.682.058–56.686.110, filamento direttoMT1XNUP93: 56.730.095–56.850.286, filamento direttoNUP93SLC12A3: 56.865.203–56.915.850, filamento direttoSLC12A3HERPUD1: 56.930.815–56.946.491, filamento direttoHERPUD1CETP: 56.961.922–56.983.845, filamento direttoCETPNLRC5: 56.989.485–57.084.238, filamento direttoNLRC5Diagramma di MT3: 3 esoni sul filamento diretto del cromosoma 16Esone 1: 56.589.528–56.589.621, 94 basiEsone 2: 56.589.870–56.589.935, 66 basiEsone 3: 56.590.840–56.591.085, 246 basi1235′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 0,4 kb dei 1,6 kb del gene; 207 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di MT3

2Facile

Quanto è difficile sequenziare MT3 con letture corte, su 100

Quasi tutti gli esoni di MT3 si trovano in regioni in cui le letture corte si allineano in modo chiaro.

A ciò si aggiunge: la quota di esoni di MT3 in ciascun tipo di regione difficile

  • Mappabilità0%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni0%
  • Contenuto GC23%
  • Copertura del riferimento0%

Un punteggio di Dante Labs basato su nostre ricerche, costruito sulle mappe delle regioni difficili da sequenziare di NIST Genome in a Bottle.Come viene calcolato

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene MT3: metallothionein 3. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/mt3

Vancouver

Dante Labs. Gene MT3: metallothionein 3 [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/mt3

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