Gene
KRTAP21-3
keratin associated protein 21-3
- HGNC 34216↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000231068↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 100288323↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 21q22.11
- Coordinate
- Cromosoma 21: 30.718.525–30.718.777 (GRCh38)
- Esoni
- 1 esone su 0,3 kb
- Proteina
- 58 amminoacidi
- Trascritto MANE Select
- ENST00000444335.1NM_001164435.1
- Tipo di locus
- Codificanti per proteine
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
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page$gene$nameLegga KRTAP21-3 e il resto del suo genoma con un unico test.
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Nessun report del Genome Test legge ancora KRTAP21-3. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.
Struttura di KRTAP21-3
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 0,3 kb dei 0,3 kb del gene; 177 di queste basi codificano la proteina.
Sequenziamento di KRTAP21-3
3Bassa
Quanto è difficile sequenziare KRTAP21-3 con letture corte, su 100Ogni barra indica la quota di basi degli esoni di KRTAP21-3 che si trovano in quel tipo di regione difficile. Il punteggio le pondera in base a quanto ciascuna pesa su una chiamata con letture corte: 0 quando nessuna base si trova in una regione di questo tipo, 100 quando ogni base si trova in tutte.
- MappabilitàTratti in cui le letture da 100 o 250 bp non possono essere collocate in modo univoco, quindi una chiamata in quelle zone potrebbe mancare o essere errata. Peso 35%.0%
- OmologiaDuplicazioni segmentali: copie altrove nel genoma, come paraloghi e pseudogeni, con identità del 90% o superiore. Peso 30%.0%
- RipetizioniRipetizioni in tandem e sequenze di una stessa base ripetuta, su cui le letture tendono a scivolare e che potrebbero non essere coperte per intero. Peso 15%.20%
- Contenuto di GCFinestre con meno del 25% o più del 65% di G e C, che la preparazione della libreria copre con difficoltà. Peso 10%.0%
- Copertura di riferimentoLacune nell'assemblaggio di riferimento vicine, dove non c'è una sequenza a cui le letture possano allinearsi. Peso 10%.0%
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene KRTAP21-3: keratin associated protein 21-3. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/krtap21-3
Dante Labs. Gene KRTAP21-3: keratin associated protein 21-3 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/krtap21-3
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