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Gene

IFFO2

intermediate filament family orphan 2

Sintesi

Localizzazione citogenetica
1p36.13
Coordinate
Cromosoma 1: 18.904.280–18.956.676 (GRCh38)
Esoni
9 esoni su 52,4 kb
Proteina
517 amminoacidi
Trascritto MANE Select
ENST00000455833.7NM_001136265.2
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora IFFO2. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di IFFO2

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 1, con una parentesi dove si trova IFFO2. IFFO2 e 12 geni nelle vicinanze sul cromosoma 1, da 18.430.478 a 19.430.477.Cromosoma 11p36.13p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4418,6 Mb18,8 Mb19 Mb19,2 Mb19,4 MbKLHDC7A: 18.480.930–18.485.974, filamento direttoKLHDC7APAX7: 18.630.846–18.748.876, filamento direttoPAX7TAS1R2: 18.839.599–18.859.660, filamento inversoTAS1R2ALDH4A1: 18.871.425–18.902.799, filamento inversoALDH4A1IFFO2: 18.904.280–18.956.676, filamento inversoIFFO2UBR4: 19.074.510–19.210.329, filamento inversoUBR4EMC1: 19.215.660–19.251.552, filamento inversoEMC1MRTO4: 19.251.555–19.260.128, filamento direttoMRTO4AKR7L: 19.265.982–19.274.194, filamento inversoAKR7LAKR7A3: 19.281.056–19.288.823, filamento inversoAKR7A3SLC66A1: 19.288.044–19.332.427, filamento direttoAKR7A2: 19.291.523–19.312.149, filamento inversoAKR7A2CAPZB: 19.338.775–19.485.650, filamento inversoCAPZBDiagramma di IFFO2: 9 esoni sul filamento inverso del cromosoma 1Esone 9: 18.904.280–18.908.666, 4387 basiEsone 8: 18.910.342–18.910.472, 131 basiEsone 7: 18.911.384–18.911.476, 93 basiEsone 6: 18.911.963–18.912.083, 121 basiEsone 5: 18.916.903–18.917.042, 140 basiEsone 4: 18.918.362–18.918.502, 141 basiEsone 3: 18.919.678–18.919.773, 96 basiEsone 2: 18.921.061–18.921.121, 61 basiEsone 1: 18.955.668–18.956.676, 1009 basi9864215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 6,2 kb dei 52,4 kb del gene; 1554 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di IFFO2

3Bassa

Quanto è difficile sequenziare IFFO2 con letture corte, su 100

  • Mappabilità0%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni9,8%
  • Contenuto di GC17%
  • Copertura di riferimento0%

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene IFFO2: intermediate filament family orphan 2. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/iffo2

Vancouver

Dante Labs. Gene IFFO2: intermediate filament family orphan 2 [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/iffo2

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