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Gene

EDC3

enhancer of mRNA decapping 3

Sintesi

Localizzazione citogenetica
15q24.1
Coordinate
Cromosoma 15: 74.630.558–74.696.024 (GRCh38)
Esoni
7 esoni su 65,5 kb
Proteina
508 amminoacidi
Noto anche come
FLJ21128, hYjeF_N2-15q23, YJEFN2, LSM16
Simboli precedenti
YJDC
Trascritto MANE Select
ENST00000315127.9NM_025083.5
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora EDC3. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di EDC3

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 15, con una parentesi dove si trova EDC3. EDC3 e 21 geni nelle vicinanze sul cromosoma 15, da 74.163.291 a 75.163.290.Cromosoma 1515q24.1p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q14q15.1q15.2q15.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26.1q26.2q26.374,2 Mb74,4 Mb74,6 Mb74,8 Mb75 MbISLR: 74.172.414–74.176.872, filamento direttoISLRSTRA6: 74.179.466–74.212.267, filamento inversoSTRA6CCDC33: 74.202.705–74.336.472, filamento direttoCCDC33CYP11A1: 74.337.746–74.367.884, filamento inversoCYP11A1SEMA7A: 74.409.289–74.433.965, filamento inversoSEMA7AUBL7: 74.445.187–74.461.189, filamento inversoUBL7ARID3B: 74.541.188–74.598.131, filamento direttoARID3BCLK3: 74.598.500–74.645.468, filamento direttoCLK3EDC3: 74.630.558–74.696.024, filamento inversoEDC3CYP1A1: 74.719.542–74.738.469, filamento inversoCYP1A1CYP1A2: 74.748.795–74.756.607, filamento direttoCYP1A2CSK: 74.782.023–74.804.177, filamento direttoCSKLMAN1L: 74.812.716–74.825.758, filamento direttoLMAN1LCPLX3: 74.826.594–74.831.802, filamento direttoCPLX3ULK3: 74.836.116–74.843.346, filamento inversoULK3SCAMP2: 74.843.728–74.873.374, filamento inversoSCAMP2MPI: 74.890.005–74.902.219, filamento direttoMPIFAM219B: 74.892.175–74.907.331, filamento inversoFAM219BCOX5A: 74.919.594–74.939.351, filamento inversoCOX5ARPP25: 74.954.418–74.956.772, filamento inversoRPP25SCAMP5: 74.957.219–75.021.497, filamento direttoSCAMP5PPCDC: 75.023.550–75.117.462, filamento direttoPPCDCDiagramma di EDC3: 7 esoni sul filamento inverso del cromosoma 15Esone 4: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 7: 74.630.558–74.632.946, 2389 basiEsone 6: 74.635.409–74.635.626, 218 basiEsone 5: 74.640.466–74.640.619, 154 basiEsone 4: 74.655.733–74.656.068, 336 basiEsone 3: 74.671.455–74.671.774, 320 basiEsone 2: 74.674.961–74.675.142, 182 basiEsone 1: 74.695.880–74.696.024, 145 basi76543215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 3,7 kb dei 65,5 kb del gene; 1527 di queste basi codificano la proteina.

Come un test genomico legge EDC3

1

posizione in EDC3 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 65,5 kb di EDC3, introni inclusi, non solo i 3,7 kb di esoni.

Tratti collegati a EDC3

L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che EDC3 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gene EDC3: enhancer of mRNA decapping 3. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/edc3

Vancouver

Dante Labs. Gene EDC3: enhancer of mRNA decapping 3 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/edc3

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