LUPUS (LES) — RISCHIO GENETICO

Rischio genetico di lupus (LES) — Il lupus presenta un’ereditabilità pari a circa il 50%, e le forme monogeniche causate da deficit del complemento o da varianti dei geni TREX1 o DNASE1L3 richiedono strategie terapeutiche diverse rispetto al LES autoimmune tipico.

Il sequenziamento dell'intero genoma consente di analizzare i geni del sistema del complemento (C1Q, C2, C4), i geni associati all'interferonopatia (TREX1, DNASE1L3, RNASEH2A/B/C), gli aplotipi HLA (DRB1) e tutte le altre varianti associate al lupus, distinguendo così il lupus monogenico da quello poligenico.

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INFORMAZIONI SUL LUPUS (SLE) — RISCHIO GENETICO

Lupus (LES) — Rischio genetico

Il lupus eritematoso sistemico (LES) è una malattia autoimmune cronica che colpisce circa 200.000-300.000 persone negli Stati Uniti, con un’ereditabilità pari a circa il 50%. L'architettura genetica comprende sia la suscettibilità poligenica (HLA-DR2, HLA-DR3, ITGAM, STAT4, IRF5, BLK, TNFAIP3 e >100 loci GWAS aggiuntivi) sia forme monogeniche rare. Il fattore di rischio genetico comune più forte è la regione HLA di classe II: HLA-DRB1*03:01 e HLA-DRB1*15:01 conferiscono ciascuno un aumento del rischio di circa 2-3 volte. La variazione del numero di copie di C4 (componente del complemento 4) è un determinante genetico importante: un basso numero di copie di C4 aumenta sostanzialmente il rischio di lupus.

Il lupus monogenico rappresenta circa l'1-3% di tutti i casi di LES ed è di fondamentale importanza individuarlo. La carenza di complement — in particolare la carenza omozigote di C1q (>90% dei casi sviluppa il lupus), C1r/C1s, C2 e C4 — causa un lupus grave a esordio precoce a causa di una ridotta eliminazione dei detriti apoptotici e dei complessi immunitari. La carenza di TREX1 causa la sindrome di Aicardi-Goutières/lupus familiare da geloni attraverso l'accumulo di acidi nucleici endogeni che attivano la via dell'interferone di tipo I. La carenza di DNASE1L3 causa un lupus ipocomplementemico con anticorpi anti-dsDNA. Queste forme monogeniche presentano meccanismi patogenici specifici che influenzano la scelta del trattamento.

Stanno emergendo le implicazioni terapeutiche della classificazione genetica del lupus. L'anifrolumab (Saphnelo), un anticorpo anti-recettore dell'interferone di tipo I, è approvato dalla FDA per il LES da moderato a grave ed è, dal punto di vista meccanicistico, particolarmente indicato nei pazienti con elevate firme dell'interferone — compresi quelli con varianti del percorso dell'interferonopatia (TREX1, IFIH1, RNASEH2). Il lupus con deficit del complemento può rispondere al plasma fresco congelato (che sostituisce il componente del complemento mancante) o agli inibitori del complemento, ma NON risponde alla terapia immunosoppressiva standard mirata alle vie autoimmuni. Belimumab (anti-BLyS) agisce sull'attivazione delle cellule B e può essere particolarmente efficace nei pazienti con varianti di rischio BLK o BANK1.

La carenza di C1q causa il lupus in oltre il 90% dei portatori: si tratta della penetranza più elevata tra tutti i geni associati al lupus. Questo lupus da carenza del complemento presenta un meccanismo patogenetico diverso rispetto al LES autoimmune e potrebbe non rispondere alla terapia immunosoppressiva standard.

PERCHÉ IL SEQUENZIAMENTO DEL GENOMA COMPLETO

Il lupus monogenico (deficit del complemento, interferonopatia) non risponde alla terapia immunosoppressiva standard. La diagnosi molecolare consente di identificare quell’1-3% di pazienti affetti da lupus che necessitano di un trattamento diverso, nonché i biomarcatori genetici emergenti per terapie mirate come l’anifrolumab.

Il lupus con deficit del complemento richiede una terapia sostitutiva del complemento, non una terapia immunosoppressiva: un trattamento errato ritarda di anni l'inizio di una terapia efficace

I pazienti con deficit di C1q sviluppano una malattia simile al lupus a causa di una ridotta eliminazione delle cellule apoptotiche e dei complessi immunitari: si tratta di un problema di smaltimento dei rifiuti, non di un attacco autoimmune primario. La terapia immunosoppressiva standard per il lupus (micofenolato, ciclofosfamide) agisce sul meccanismo sbagliato. L'infusione di plasma fresco congelato (che fornisce C1q funzionale) può produrre un notevole miglioramento clinico. Senza test genetici per la carenza del complemento, questi pazienti ricevono una terapia immunosoppressiva sempre più aggressiva per il "lupus resistente al trattamento", mentre una diagnosi corretta reindirizzerebbe completamente la terapia.

La variazione del numero di copie del gene C4 è il fattore genetico comune più determinante per il rischio di lupus — Il sequenziamento dell'intero genoma (WGS) quantifica il numero di copie dei geni C4A e C4B

Il locus C4 sul cromosoma 6 è una delle regioni strutturalmente più complesse del genoma umano: i geni C4A e C4B presentano un numero di copie variabile (da 0 a 6 copie ciascuno). Un basso numero di copie di C4 (in particolare un basso numero di copie di C4A) aumenta notevolmente il rischio di lupus, mentre un numero elevato di copie ha un effetto protettivo. I test genetici standard non valutano il numero di copie di C4. Il WGS analizza l'intero locus C4, consentendo la quantificazione del numero di copie che fornisce la più importante valutazione genetica comune del rischio di lupus.

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DOMANDE FREQUENTI

Domande frequenti sul sequenziamento dell'intero genoma.

Qual è la differenza tra il sequenziamento dell'intero genoma e un test genetico mirato?

I test genetici mirati — compresi i pannelli standard per il cancro ereditario — analizzano un elenco predefinito di varianti note in un insieme specifico di geni. Sono progettati per individuare ciò che già sanno di dover cercare. Il sequenziamento dell’intero genoma analizza l’intero genoma: tutti i 6 miliardi di coppie di basi, ogni gene, ogni regione tra i geni. Uno studio della Mayo Clinic pubblicato su JAMA Oncology ha rilevato che le linee guida standard per i test trascuravano più della metà dei pazienti con mutazioni tumorali ereditarie. Genome Test non ha un elenco fisso.

Cosa riceverò quando i miei risultati saranno pronti?

Il tuo Dante Genome fornisce oltre 200 referti pronti per i medici, organizzati per categoria clinica: tumori ereditari, patologie cardiache, malattie rare, farmacogenomica, stato di portatore e altro ancora. I referti vengono inviati al tuo Genome Manager protetto e sono formattati per un utilizzo clinico immediato. I tuoi dati genomici vengono conservati in modo permanente e rianalizzati automaticamente man mano che la scienza progredisce.

Cosa succede se viene individuata una variante clinicamente significativa?

Se viene individuata una variante patogena o potenzialmente patogena, questa verrà chiaramente segnalata nel vostro referto pronto per il medico, corredato dal contesto clinico, dalle evidenze scientifiche pubblicate e dalle azioni consigliate. Vi consigliamo di condividere qualsiasi risultato clinicamente significativo con il vostro medico o con un consulente genetico, che potrà guidarvi nelle decisioni relative alla sorveglianza, alla riduzione del rischio o ai test a cascata per i membri della famiglia.

In che cosa si differenzia da un test del DNA per privati come 23andMe o AncestryDNA?

I test del DNA per il grande pubblico utilizzano chip di genotipizzazione che analizzano meno dello 0,1% del genoma, ovvero un minuscolo insieme preselezionato di varianti comuni. Sono ottimizzati per l’ascendenza e i tratti a livello di popolazione, non per risultati genetici clinici. Il Dante Genome Test sequenzia il 100% del tuo genoma con una copertura di 30X, lo stesso standard utilizzato in ambito diagnostico clinico. I due test non sono comparabili in termini di portata, metodologia o utilità clinica.

Quanto tempo ci vuole per ottenere i risultati e in che modo vengono comunicati?

Il kit per il prelievo viene spedito entro 48 ore dall'ordine. Una volta che il campione arriva al nostro laboratorio certificato CLIA, il sequenziamento e l'analisi richiedono 6–8 settimane. I risultati vengono inviati in modo sicuro al tuo Genome Manager, dove potrai accedere ai tuoi referti, condividerli con il tuo medico e ricevere aggiornamenti automatici man mano che vengono convalidati nuovi risultati rispetto al tuo genoma.

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Dante Labs collabora con associazioni di pazienti di qualsiasi dimensione — per il lupus (LES) — il rischio genetico e altre patologie, sia rare che comuni. Supportiamo associazioni in qualsiasi paese, comprese quelle virtuali.

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