Gene
JAK2
Janus kinase 2
- HGNC 6192↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000096968↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 3717↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 9p24.1
- Coordinate
- Cromosoma 9: 4.985.272–5.129.948 (GRCh38)
- Esoni
- 25 esoni su 144,7 kb
- Proteina
- 1132 amminoacidi, 130,7 kDa
- Noto anche come
- JTK10
- Trascritto MANE Select
- ENST00000381652.4NM_004972.4
- Tipo di locus
- Codificanti per proteine
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
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Ottieni il mio Genome TestReport curato rilevante per questo gene
Trombocitemia ereditaria (JAK2)
- Trombocitemia 3Autosomica dominante
Causata da una variante ereditaria di JAK2, che produce una proteina di segnalazione che controlla la produzione delle cellule del sangue. Le varianti descritte si trovano nelle parti della proteina che ne controllano l'attività e la rendono più attiva, il che aumenta la produzione di piastrine. La prima descritta, JAK2 R564Q, è stata riscontrata in una famiglia con trombocitemia a trasmissione autosomica dominante.
- GenCC 22 submitter GenCC valutano come definitiva o forte
▶Azionabilità
Controlli periodici con un ematologo, incluso il monitoraggio della conta ematica, poiché in alcune famiglie colpite si sono verificati tumori del sangue. Le evidenze sono limitate e, per i bambini, non esistono linee guida condivise. Poiché la condizione si trasmette con modalità autosomica dominante, ogni figlio di un genitore affetto ha una probabilità di 1 su 2 di ereditare la variante, e il test sui familiari può indicare chi altro la porta.
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Ottieni il mio Genome TestStruttura di JAK2
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 7 kb dei 144,7 kb del gene; 3399 di queste basi codificano la proteina.
Sequenziamento di JAK2
3Facile
Quanto è difficile sequenziare JAK2 con letture corte, su 100
0 · Facile100 · Difficile
Quasi tutti gli esoni di JAK2 si trovano in punti in cui le letture corte si allineano con chiarezza.
A questo si aggiunge la quota degli esoni di JAK2 in ciascun tipo di regione difficile
- MappabilitàTratti in cui letture da 100 o 250 bp non possono essere collocate in modo univoco, quindi una chiamata in quel punto potrebbe mancare o essere errata. Preso da solo, un gene interamente compreso in questo tipo di regione otterrebbe un punteggio di 100.0%
- OmologiaDuplicazioni segmentali: copie altrove nel genoma, come paraloghi e pseudogeni, con identità del 90% o superiore. Preso da solo, un gene interamente compreso in questo tipo di regione otterrebbe un punteggio di 60.0%
- Condiviso con chrYLe regioni pseudoautosomiche e la regione X-trasposta, dove chrX e chrY portano la stessa sequenza o una quasi identica, per cui una lettura proveniente da uno dei due può essere collocata sull'altro. Preso da solo, un gene interamente compreso in questo tipo di regione otterrebbe un punteggio di 60.0%
- Copertura del riferimentoLacune nell'assemblaggio di riferimento nelle vicinanze, dove non c'è sequenza a cui le letture possano allinearsi. Preso da solo, un gene interamente compreso in questo tipo di regione otterrebbe un punteggio di 50.0%
- RipetizioniRipetizioni in tandem e tratti di una sola base, su cui le letture scivolano e che potrebbero non coprire per intero. Preso da solo, un gene interamente compreso in questo tipo di regione otterrebbe un punteggio di 30.2,7%
- Contenuto di GCFinestre con meno del 25% o più del 65% di G e C, che la preparazione della libreria copre in modo scarso. Preso da solo, un gene interamente compreso in questo tipo di regione otterrebbe un punteggio di 20.11%
Un punteggio di Dante Labs basato su nostre ricerche, costruito sulle mappe Genome in a Bottle del NIST delle regioni difficili da sequenziare.Come viene calcolato il punteggioOgni barra indica la quota delle basi esoniche di JAK2 in quel tipo di regione difficile. Ciascun tipo può da solo rendere difficile un gene, e ogni tipo aggiuntivo incide sempre meno: 0 quando nessuna base ricade in alcuna regione, 100 quando ogni base si trova in un punto in cui le letture non possono essere collocate in modo univoco.
5
posizioni in JAK2 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse rientra in una regione che le letture corte faticano a sequenziare.
Un genoma intero copre tutti i 144,7 kb di JAK2, introni inclusi, e non solo i 7 kb di esoni.
Varianti patogeniche ClinVar (5)
Le varianti JAK2 che ClinVar classifica come patogene o probabilmente patogene per qualsiasi condizione, esaminate da almeno un soggetto che le ha inviate con criteri, e le più esaminate tra queste. È il registro pubblico di ClinVar sul gene, non un risultato.
- Patogena 1
- Probabilmente patogena 4
| Variante | Condizioni | Classificazione ClinVar | Stato di revisione |
|---|---|---|---|
| NM_004972.4(JAK2):c.1849G>T (p.Val617Phe) | Budd-Chiari syndrome e altre 5 | Patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto |
| NM_004972.4(JAK2):c.1691G>A (p.Arg564Gln) | Budd-Chiari syndrome e altre 5 | Probabilmente patogena | ★★★★1 stella su 4 criteri forniti, singolo sottomittente |
| NM_004972.4(JAK2):c.2600G>A (p.Arg867Gln) | Budd-Chiari syndrome e altre 5 | Probabilmente patogena | ★★★★1 stella su 4 criteri forniti, singolo sottomittente |
| NM_004972.4(JAK2):c.2813G>A (p.Arg938Gln) | thrombocythemia 3 | Probabilmente patogena | ★★★★1 stella su 4 criteri forniti, singolo sottomittente |
| NM_004972.4(JAK2):c.3284C>T (p.Pro1095Leu) | acquired polycythemia vera | Probabilmente patogena | ★★★★1 stella su 4 criteri forniti, singolo sottomittente |
Tratti collegati a JAK2
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che JAK2 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Extramedullary hematopoiesis
- Increased circulating hemoglobin concentration
- Increased hematocrit
- Increased number of platelets in blood
- Myelofibrosis
- Abnormal shape of platelets
- Acute blood cancer
- Bleeding gums
Mostra altri 36 tratti
- Bleeding tendency
- Blood clot in artery
- Blood clot in vein
- Bloody nose
- Bone marrow disease
- Bruising susceptibility
- Increased megakaryocyte count
- Increased red blood cells
- Megakaryocyte nucleus hyperlobulation
- Myelodysplasia
- Platelet abnormalities
- Prolonged bleeding time
- Abnormal megakaryocyte morphology
- Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Blood clot in liver vein
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Low platelet count
- Abnormal blood clot
- Acute myeloid leukemia
- Blood clot in portal vein
- Blood spots
- Bone marrow hypercellularity
- Chronic myelogenous leukemia
- Ecchymosis
- Elevated white blood count
- Gastrointestinal bleeding
- Low blood cell count
- Petechiae
- Poikilocytosis
- Blood tumor
- Bleeding in brain
- Increased micromegakaryocyte count
- Increased red blood cell mass
- Myeloproliferative disorder
- Peripheral blood clot
- Thromboembolism
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la localizzazione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, pubblicati il 2026-10-23: a quali condizioni il gene è associato e con quale grado di evidenza.
- L'elenco ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte faticano a sequenziare.
- Le stratificazioni genomiche di Genome in a Bottle, dal NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Modello AlphaFold DB AF-O60674-F1, versione 6, di Google DeepMind ed EMBL-EBI (CC BY 4.0): la struttura della proteina come prevista da AlphaFold, non come misurata, e il relativo livello di confidenza in ciascuna parte.
- Rilascio dei dati 2026.10.23-dc0c0517.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene JAK2: Janus kinase 2. Consultato il 24 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/jak2
Dante Labs. Gene JAK2: Janus kinase 2 [Internet]. [citato il 24 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/jak2
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