Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

UBQLN1

ubiquilin 1

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
9q21.32
Koordináták
9. kromoszóma: 83 659 968–83 707 958 (GRCh38)
Exonok
11 exon, összesen 48 kb
Fehérje
589 aminosav
Más néven ismert
DSK2, PLIC-1, XDRP1, DA41
MANE Select transzkriptum
ENST00000376395.9NM_013438.5
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) UBQLN1 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A UBQLN1 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
9. kromoszóma, a UBQLN1 helyét zárójel jelöli. A UBQLN1 és környékén 7 gén a 9. kromoszómán, 83 183 963–84 183 962 között.9. kromoszóma9q21.32p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.383,2 Mb83,4 Mb83,6 Mb83,8 Mb84 MbFRMD3: 83 242 990–83 538 737, fordított szálFRMD3IDNK: 83 623 049–83 644 138, előre szálIDNKUBQLN1: 83 659 968–83 707 958, fordított szálUBQLN1GKAP1: 83 737 881–83 829 516, fordított szálGKAP1KIF27: 83 833 760–83 921 558, fordított szálKIF27QNG1: 83 936 360–83 956 986, fordított szálQNG1HNRNPK: 83 966 674–83 981 586, fordított szálHNRNPKRMI1: 83 980 355–84 004 078, előre szálRMI1A UBQLN1 ábrája: 11 exon a(z) 9. kromoszóma fordított szálán11. exon: 83 659 968–83 661 939, 1972 bázis10. exon: 83 663 875–83 664 043, 169 bázis9. exon: 83 665 030–83 665 145, 116 bázis8. exon: 83 666 350–83 666 433, 84 bázis7. exon: 83 669 185–83 669 327, 143 bázis6. exon: 83 677 727–83 677 961, 235 bázis5. exon: 83 678 441–83 678 599, 159 bázis4. exon: 83 679 775–83 680 037, 263 bázis3. exon: 83 682 951–83 683 066, 116 bázis2. exon: 83 686 004–83 686 155, 152 bázis1. exon: 83 707 500–83 707 958, 459 bázis1110864215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 48 kb-jából 3,9 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1770 bázis kódolja a fehérjét.

UBQLN1 szekvenálása

5Könnyű

Mennyire nehéz a UBQLN1 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A UBQLN1 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a UBQLN1 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia3%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések3,4%
  • GC-tartalom12%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). UBQLN1 gén: ubiquilin 1. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/ubqln1

Vancouver

Dante Labs. UBQLN1 gén: ubiquilin 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/ubqln1

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet