Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

SPATA31A5

SPATA31 subfamily A member 5

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
9q12
Koordináták
9. kromoszóma: 60 914 407–60 920 653 (GRCh38)
Exonok
4 exon, összesen 6,2 kb
Fehérje
1347 aminosav
Más néven ismert
OTTHUMG00000013204
Korábbi jelölések
FAM75A5
MANE Select transzkriptum
ENST00000437823.5NM_001113541.3
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) SPATA31A5 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A SPATA31A5 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
9. kromoszóma, a SPATA31A5 helyét zárójel jelöli. A SPATA31A5 és környékén 2 gén a 9. kromoszómán, 60 417 530–61 417 529 között.9. kromoszóma9q12p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.360,6 Mb60,8 Mb61 Mb61,2 Mb61,4 MbSPATA31A5: 60 914 407–60 920 653, előre szálSPATA31A5SPATA31A7: 61 190 036–61 196 280, előre szálSPATA31A7CNTNAP3C: 61 330 717–61 453 030, előre szálCNTNAP3CA SPATA31A5 ábrája: 4 exon a(z) 9. kromoszóma előre szálán1. exon: 60 914 407–60 914 624, 218 bázis2. exon: 60 915 823–60 915 880, 58 bázis3. exon: 60 916 449–60 916 509, 61 bázis4. exon: 60 916 765–60 920 653, 3889 bázis12345′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 6,2 kb-jából 4,2 kb-ot tesznek ki; ezek közül 4044 bázis kódolja a fehérjét.

SPATA31A5 szekvenálása

100Nehéz

Mennyire nehéz a SPATA31A5 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A SPATA31A5 nagy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok elronthatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.

Ehhez hozzájárul: a SPATA31A5 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség100%
  • Homológia100%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések1,9%
  • GC-tartalom1,5%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). SPATA31A5 gén: SPATA31 subfamily A member 5. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/spata31a5

Vancouver

Dante Labs. SPATA31A5 gén: SPATA31 subfamily A member 5 [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/spata31a5

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet