Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

SNX19

sorting nexin 19

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
11q24.3-q25
Koordináták
11. kromoszóma: 130 866 250–130 916 479 (GRCh38)
Exonok
11 exon, összesen 50,2 kb
Fehérje
992 aminosav
Más néven ismert
KIAA0254, CHET8
MANE Select transzkriptum
ENST00000265909.9NM_014758.3
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) SNX19 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A SNX19 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
11. kromoszóma, a SNX19 helyét zárójel jelöli. A SNX19 és környékén 3 gén a 11. kromoszómán, 130 391 365–131 391 364 között.11. kromoszóma11q24.3-q25p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25130,4 Mb130,6 Mb130,8 Mb131 Mb131,2 MbADAMTS8: 130 404 923–130 428 732, fordított szálADAMTS8ADAMTS15: 130 448 635–130 476 645, előre szálADAMTS15SNX19: 130 866 250–130 916 479, fordított szálSNX19NTM: 131 370 478–132 336 822, előre szálNTMA SNX19 ábrája: 11 exon a(z) 11. kromoszóma fordított szálán11. exon: 130 866 250–130 878 554, 12 305 bázis10. exon: 130 879 624–130 879 711, 88 bázis9. exon: 130 880 622–130 880 806, 185 bázis8. exon: 130 903 255–130 903 384, 130 bázis7. exon: 130 905 953–130 906 133, 181 bázis6. exon: 130 906 625–130 906 721, 97 bázis5. exon: 130 907 953–130 908 083, 131 bázis4. exon: 130 910 018–130 910 137, 120 bázis3. exon: 130 910 270–130 910 370, 101 bázis2. exon: 130 911 633–130 911 771, 139 bázis1. exon: 130 914 266–130 916 479, 2214 bázis1110864215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 50,2 kb-jából 15,7 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2979 bázis kódolja a fehérjét.

SNX19 szekvenálása

15Közepes

Mennyire nehéz a SNX19 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A SNX19 exonjainak egy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok elronthatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.

Ehhez hozzájárul: a SNX19 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0,4%
  • Homológia24%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések1,9%
  • GC-tartalom2,3%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). SNX19 gén: sorting nexin 19. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/snx19

Vancouver

Dante Labs. SNX19 gén: sorting nexin 19 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/snx19

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet