Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

PALM2AKAP2

PALM2 and AKAP2 fusion

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
9q31.3
Koordináták
9. kromoszóma: 109 780 198–110 172 512 (GRCh38)
Exonok
11 exon, összesen 392,3 kb
Fehérje
1103 aminosav
Korábbi jelölések
PALM2-AKAP2
MANE Select transzkriptum
ENST00000374530.8NM_007203.5
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) PALM2AKAP2 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A PALM2AKAP2 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
9. kromoszóma, a PALM2AKAP2 helyét zárójel jelöli. A PALM2AKAP2 és környékén 5 gén a 9. kromoszómán, 109 387 883–110 564 827 között.9. kromoszóma9q31.3p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.3109,4 Mb109,6 Mb109,8 Mb110 Mb110,2 Mb110,4 MbPTPN3: 109 375 464–109 498 343, fordított szálPTPN3PALM2AKAP2: 109 780 198–110 172 512, előre szálPALM2AKAP2C9orf152: 110 190 048–110 208 178, fordított szálC9orf152TXN: 110 243 810–110 256 636, fordított szálTXNTXNDC8: 110 303 476–110 337 891, fordított szálTXNDC8SVEP1: 110 365 248–110 580 170, fordított szálSVEP1A PALM2AKAP2 ábrája: 11 exon a(z) 9. kromoszóma előre szálán1. exon: 109 780 198–109 780 533, 336 bázis2. exon: 109 867 491–109 867 571, 81 bázis3. exon: 109 880 551–109 880 681, 131 bázis4. exon: 109 923 735–109 923 849, 115 bázis5. exon: 109 925 061–109 925 082, 22 bázis6. exon: 109 931 927–109 932 028, 102 bázis7. exon: 110 015 954–110 016 039, 86 bázis8. exon: 110 136 127–110 138 539, 2413 bázis9. exon: 110 156 319–110 156 497, 179 bázis10. exon: 110 162 094–110 162 132, 39 bázis11. exon: 110 168 399–110 172 512, 4114 bázis1115′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 392,3 kb-jából 7,6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 3312 bázis kódolja a fehérjét.

PALM2AKAP2 szekvenálása

3Könnyű

Mennyire nehéz a PALM2AKAP2 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A PALM2AKAP2 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a PALM2AKAP2 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések5,7%
  • GC-tartalom6,3%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). PALM2AKAP2 gén: PALM2 and AKAP2 fusion. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/palm2akap2

Vancouver

Dante Labs. PALM2AKAP2 gén: PALM2 and AKAP2 fusion [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/palm2akap2

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet