Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

PABPC1L2B

poly(A) binding protein cytoplasmic 1 like 2B

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
Xq13.2
Koordináták
X. kromoszóma: 73 002 939–73 006 106 (GRCh38)
Exonok
1 exon, összesen 3,2 kb
Fehérje
200 aminosav
Korábbi jelölések
RBM32B
MANE Select transzkriptum
ENST00000373521.4NM_001042506.2
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) PABPC1L2B gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A PABPC1L2B felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
X. kromoszóma, a PABPC1L2B helyét zárójel jelöli. A PABPC1L2B és környékén 12 gén a X. kromoszómán, 72 504 523–73 504 522 között.X. kromoszómaXq13.2p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q2872,6 Mb72,8 Mb73 Mb73,2 Mb73,4 Mb: 72 301 691–72 572 843, fordított szálHDAC8: 72 329 516–72 573 101, fordított szálHDAC8PHKA1: 72 578 814–72 714 332, fordított szálPHKA1DMRTC1B: 72 776 874–72 848 803, előre szálDMRTC1BFAM236B: 72 781 858–72 782 798, fordított szálFAM236BFAM236D: 72 807 425–72 808 210, fordított szálFAM236DDMRTC1: 72 872 025–72 943 837, fordított szálDMRTC1FAM236C: 72 912 615–72 913 401, előre szálFAM236CFAM236A: 72 938 163–72 938 958, előre szálFAM236APABPC1L2B: 73 002 939–73 006 106, előre szálPABPC1L2BPABPC1L2A: 73 077 276–73 079 512, fordított szálPABPC1L2ANAP1L2: 73 212 299–73 215 239, fordított szálNAP1L2CDX4: 73 447 053–73 455 171, előre szálCDX4A PABPC1L2B ábrája: egy exon a(z) X. kromoszóma előre szálán1. exon: 73 002 939–73 006 106, 3168 bázis15′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 3,2 kb-jából 3,2 kb-ot tesznek ki; ezek közül 603 bázis kódolja a fehérjét.

PABPC1L2B szekvenálása

87Nehéz

Mennyire nehéz a PABPC1L2B rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A PABPC1L2B nagy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok elronthatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.

Ehhez hozzájárul: a PABPC1L2B exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség71%
  • Homológia83%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések19%
  • GC-tartalom32%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). PABPC1L2B gén: poly(A) binding protein cytoplasmic 1 like 2B. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/pabpc1l2b

Vancouver

Dante Labs. PABPC1L2B gén: poly(A) binding protein cytoplasmic 1 like 2B [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/pabpc1l2b

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet