Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

OR5F1

olfactory receptor family 5 subfamily F member 1

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
11q12.1
Koordináták
11. kromoszóma: 55 993 681–55 994 625 (GRCh38)
Exonok
1 exon, összesen 0,9 kb
Fehérje
314 aminosav
Más néven ismert
OR11-10
MANE Select transzkriptum
ENST00000278409.1NM_003697.1
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) OR5F1 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A OR5F1 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
11. kromoszóma, a OR5F1 helyét zárójel jelöli. A OR5F1 és környékén 39 gén a 11. kromoszómán, 55 494 153–56 494 152 között.11. kromoszóma11q12.1p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q2555,6 Mb55,8 Mb56 Mb56,2 Mb56,4 MbOR4C15: 55 554 307–55 555 419, előre szálOR4C15OR4C16: 55 572 128–55 573 060, előre szálOR4C16OR4C11: 55 602 360–55 607 645, fordított szálOR4C11OR4P4: 55 635 113–55 640 309, előre szálOR4P4OR4S2: 55 648 327–55 652 854, előre szálOR4S2OR4C6: 55 662 201–55 666 195, előre szálOR4C6OR5D3: 55 723 776–55 729 621, előre szálOR5D3OR5D13: 55 773 438–55 774 382, előre szálOR5D14: 55 795 556–55 796 500, előre szálOR5L1: 55 811 367–55 812 476, előre szálOR5L1OR5D18: 55 819 630–55 820 571, előre szálOR5D18OR5L2: 55 827 219–55 828 154, előre szálOR5L2OR5D16: 55 838 752–55 839 738, előre szálOR5D16TRIM51: 55 883 297–55 891 810, előre szálTRIM51OR5W2: 55 913 650–55 914 582, fordított szálOR5W2OR5I1: 55 935 456–55 936 400, fordított szálOR5I1OR10AG1: 55 965 755–55 969 945, fordított szálOR10AG1OR5F1: 55 993 681–55 994 625, fordított szálOR5F1OR5AS1: 56 027 654–56 038 191, előre szálOR5AS1OR8I2: 56 093 308–56 094 240, előre szálOR8I2OR8H2: 56 103 687–56 107 658, előre szálOR8H2OR8H3: 56 122 373–56 123 311, előre szálOR8H3OR8J3: 56 134 721–56 140 201, fordított szálOR8J3OR8K5: 56 159 394–56 160 317, fordított szálOR8K5OR5J2: 56 176 618–56 177 556, előre szálOR5J2OR8J2: 56 208 985–56 215 222, fordított szálOR8J2OR5T2: 56 231 282–56 234 255, fordított szálOR5T2OR5T3: 56 252 254–56 253 222, előre szálOR5T3OR5T1: 56 274 154–56 276 819, előre szálOR5T1OR8H1: 56 288 462–56 292 254, fordított szálOR8H1OR8K3: 56 315 144–56 320 639, előre szálOR8K3OR8K1: 56 346 039–56 346 998, előre szálOR8K1OR8J1: 56 354 291–56 361 511, előre szálOR8J1OR8U1: 56 375 624–56 376 553, előre szálOR8U1OR5AL1: 56 412 696–56 413 683, előre szálOR5AL1OR8U3: 56 417 258–56 418 232, fordított szálOR8U3: 56 459 221–56 473 352, fordított szálOR5M9: 56 462 469–56 463 401, fordított szálOR5M9OR5M3: 56 469 274–56 473 352, fordított szálOR5M3OR5M8: 56 490 435–56 491 370, fordított szálOR5M8A OR5F1 ábrája: egy exon a(z) 11. kromoszóma fordított szálán1. exon: 55 993 681–55 994 625, 945 bázis15′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 0,9 kb-jából 0,9 kb-ot tesznek ki; ezek közül 945 bázis kódolja a fehérjét.

OR5F1 szekvenálása

33Nehéz

Mennyire nehéz a OR5F1 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A OR5F1 nagy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok kihagyhatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.

Ami tovább nehezíti: a OR5F1 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség5,6%
  • Homológia100%
  • Ismétlődések2,3%
  • GC-tartalom7,3%
  • Referencia-lefedettség0%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). OR5F1 gén: olfactory receptor family 5 subfamily F member 1. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/or5f1

Vancouver

Dante Labs. OR5F1 gén: olfactory receptor family 5 subfamily F member 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/or5f1

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet