Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

OR4F17

olfactory receptor family 4 subfamily F member 17

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
19p13.3
Koordináták
19. kromoszóma: 107 104–113 156 (GRCh38)
Exonok
3 exon, összesen 6,1 kb
Fehérje
305 aminosav
Korábbi jelölések
OR4F19, OR4F11P, OR4F18
MANE Select transzkriptum
ENST00000585993.3NM_001005240.3
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) OR4F17 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A OR4F17 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
19. kromoszóma, a OR4F17 helyét zárójel jelöli. A OR4F17 és környékén 12 gén a 19. kromoszómán, 1–610 129 között.19. kromoszóma19p13.3p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.430,1 Mb0,2 Mb0,3 Mb0,4 Mb0,5 Mb0,6 MbOR4F17: 107 104–113 156, előre szálOR4F17PLPP2: 278 504–291 421, fordított szálPLPP2MIER2: 305 573–344 824, fordított szálMIER2SPMAP2: 361 747–376 026, fordított szálSPMAP2C2CD4C: 405 443–409 214, fordított szálC2CD4CSHC2: 416 315–461 100, fordított szálSHC2CIMAP1D: 462 728–474 983, fordított szálCIMAP1DMADCAM1: 489 176–505 343, előre szálMADCAM1TPGS1: 507 488–520 846, előre szálTPGS1CDC34: 531 435–542 092, előre szálCDC34GZMM: 544 034–549 924, előre szálGZMMBSG: 571 277–583 498, előre szálBSGHCN2: 589 881–617 159, előre szálHCN2A OR4F17 ábrája: 3 exon a(z) 19. kromoszóma előre szálán1. exon: 107 104–107 157, 54 bázis2. exon: 107 473–107 555, 83 bázis3. exon: 110 625–113 156, 2532 bázis1235′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 6,1 kb-jából 2,7 kb-ot tesznek ki; ezek közül 918 bázis kódolja a fehérjét.

OR4F17 szekvenálása

100Nehéz

Mennyire nehéz a OR4F17 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A OR4F17 nagy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok elronthatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.

Ehhez hozzájárul: a OR4F17 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség100%
  • Homológia100%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések2,1%
  • GC-tartalom1,8%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). OR4F17 gén: olfactory receptor family 4 subfamily F member 17. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/or4f17

Vancouver

Dante Labs. OR4F17 gén: olfactory receptor family 4 subfamily F member 17 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/or4f17

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet