Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

LRRCC1

leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
8q21.2
Koordináták
8. kromoszóma: 85 107 238–85 146 080 (GRCh38)
Exonok
19 exon, összesen 38,8 kb
Fehérje
1032 aminosav
Más néven ismert
KIAA1764, CLERC, VFL1
MANE Select transzkriptum
ENST00000360375.8NM_033402.5
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) LRRCC1 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A LRRCC1 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
8. kromoszóma, a LRRCC1 helyét zárójel jelöli. A LRRCC1 és környékén 7 gén a 8. kromoszómán, 84 626 659–85 626 658 között.8. kromoszóma8q21.2p23.3p23.2p23.1p22p21.3p21.2p21.1p12p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.384,8 Mb85 Mb85,2 Mb85,4 Mb85,6 MbRALYL: 84 182 787–84 921 844, előre szálRALYLLRRCC1: 85 107 238–85 146 080, előre szálLRRCC1E2F5: 85 177 107–85 217 158, előre szálE2F5RBIS: 85 213 641–85 220 793, fordított szálRBISCA13: 85 220 587–85 312 091, előre szálCA13CA1: 85 327 608–85 379 014, fordított szálCA1CA3: 85 373 436–85 449 045, előre szálCA3CA2: 85 463 860–85 481 493, előre szálCA2A LRRCC1 ábrája: 19 exon a(z) 8. kromoszóma előre szálán1. exon: 85 107 238–85 107 399, 162 bázis2. exon: 85 109 595–85 109 800, 206 bázis3. exon: 85 110 115–85 110 180, 66 bázis4. exon: 85 112 932–85 113 099, 168 bázis5. exon: 85 115 100–85 115 275, 176 bázis6. exon: 85 115 375–85 115 584, 210 bázis7. exon: 85 123 413–85 123 606, 194 bázis8. exon: 85 124 792–85 124 939, 148 bázis9. exon: 85 126 689–85 126 837, 149 bázis10. exon: 85 129 175–85 129 379, 205 bázis11. exon: 85 129 919–85 130 058, 140 bázis12. exon: 85 131 760–85 131 961, 202 bázis13. exon: 85 134 847–85 135 032, 186 bázis14. exon: 85 135 789–85 135 963, 175 bázis15. exon: 85 137 464–85 137 627, 164 bázis16. exon: 85 138 035–85 138 243, 209 bázis17. exon: 85 138 338–85 138 475, 138 bázis18. exon: 85 141 382–85 141 517, 136 bázis19. exon: 85 145 389–85 146 080, 692 bázis124681012141618195′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 38,8 kb-jából 3,7 kb-ot tesznek ki; ezek közül 3099 bázis kódolja a fehérjét.

LRRCC1 szekvenálása

5Könnyű

Mennyire nehéz a LRRCC1 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A LRRCC1 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ami tovább nehezíti: a LRRCC1 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Shared with chrY0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések3%
  • GC-tartalom22%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). LRRCC1 gén: leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/lrrcc1

Vancouver

Dante Labs. LRRCC1 gén: leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/lrrcc1

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet