Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

ETV3L

ETS variant transcription factor 3 like

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
1q23.1
Koordináták
1. kromoszóma: 157 092 043–157 099 808 (GRCh38)
Exonok
5 exon, összesen 7,8 kb
Fehérje
361 aminosav
Más néven ismert
FLJ16478
MANE Select transzkriptum
ENST00000454449.3NM_001004341.2
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) ETV3L gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A ETV3L felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
1. kromoszóma, a ETV3L helyét zárójel jelöli. A ETV3L és környékén 20 gén a 1. kromoszómán, 156 595 926–157 595 925 között.1. kromoszóma1q23.1p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44156,6 Mb156,8 Mb157 Mb157,2 Mb157,4 MbNAXE: 156 591 738–156 609 507, előre szálNAXEGPATCH4: 156 594 301–156 601 496, fordított szálGPATCH4HAPLN2: 156 619 331–156 626 590, előre szálHAPLN2BCAN: 156 641 390–156 659 532, előre szálBCANNES: 156 668 763–156 677 415, fordított szálNESCRABP2: 156 699 592–156 708 094, fordított szálISG20L2: 156 720 651–156 728 836, fordított szálMETTL25B: 156 728 442–156 736 960, előre szálMETTL25BMRPL24: 156 737 292–156 741 590, fordított szálMRPL24HDGF: 156 742 109–156 766 925, fordított szálHDGFPRCC: 156 750 610–156 800 818, előre szálPRCCSH2D2A: 156 806 235–156 817 014, fordított szálSH2D2ANTRK1: 156 815 636–156 881 850, előre szálNTRK1INSRR: 156 840 063–156 859 122, fordított szálINSRRPEAR1: 156 893 656–156 916 432, előre szálPEAR1LRRC71: 156 920 631–156 934 915, előre szálLRRC71ARHGEF11: 156 934 840–157 046 903, fordított szálARHGEF11ETV3L: 157 092 043–157 099 808, fordított szálETV3LETV3: 157 121 191–157 138 952, fordított szálETV3FCRL5: 157 513 377–157 552 515, fordított szálFCRL5FCRL4: 157 573 747–157 598 085, fordított szálFCRL4A ETV3L ábrája: 5 exon a(z) 1. kromoszóma fordított szálán5. exon: 157 092 043–157 093 127, 1085 bázis4. exon: 157 097 868–157 097 988, 121 bázis3. exon: 157 098 706–157 098 895, 190 bázis2. exon: 157 099 141–157 099 378, 238 bázis1. exon: 157 099 466–157 099 808, 343 bázis543215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 7,8 kb-jából 2 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1086 bázis kódolja a fehérjét.

ETV3L szekvenálása

12Könnyű

Mennyire nehéz a ETV3L rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A ETV3L exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a ETV3L exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség5,4%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések6,1%
  • GC-tartalom26%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). ETV3L gén: ETS variant transcription factor 3 like. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/etv3l

Vancouver

Dante Labs. ETV3L gén: ETS variant transcription factor 3 like [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/etv3l

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet