Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

CNTNAP3

contactin associated protein family member 3

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
9p12
Koordináták
9. kromoszóma: 39 064 710–39 288 167 (GRCh38)
Exonok
24 exon, összesen 223,5 kb
Fehérje
1288 aminosav
Más néven ismert
CASPR3, KIAA1714, FLJ14195, CNTNAP3A
MANE Select transzkriptum
ENST00000297668.11NM_033655.5
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) CNTNAP3 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A CNTNAP3 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
9. kromoszóma, a CNTNAP3 helyét zárójel jelöli. A CNTNAP3 és környékén 2 gén a 9. kromoszómán, 38 676 439–39 676 438 között.9. kromoszóma9p12p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.338,8 Mb39 Mb39,2 Mb39,4 Mb39,6 MbFAM240B: 38 694 266–38 720 133, fordított szálFAM240BCNTNAP3: 39 064 710–39 288 167, fordított szálCNTNAP3SPATA31A1: 39 355 669–39 361 962, előre szálSPATA31A1A CNTNAP3 ábrája: 24 exon a(z) 9. kromoszóma fordított szálán24. exon: 39 064 710–39 074 011, 9302 bázis23. exon: 39 078 385–39 078 456, 72 bázis22. exon: 39 078 690–39 078 920, 231 bázis21. exon: 39 085 736–39 085 823, 88 bázis20. exon: 39 086 716–39 086 849, 134 bázis19. exon: 39 088 423–39 088 647, 225 bázis18. exon: 39 099 911–39 100 150, 240 bázis17. exon: 39 102 497–39 102 715, 219 bázis16. exon: 39 103 744–39 103 914, 171 bázis15. exon: 39 109 160–39 109 287, 128 bázis14. exon: 39 118 103–39 118 259, 157 bázis13. exon: 39 132 932–39 133 135, 204 bázis12. exon: 39 140 519–39 140 638, 120 bázis11. exon: 39 144 240–39 144 346, 107 bázis10. exon: 39 149 806–39 149 977, 172 bázis9. exon: 39 165 933–39 166 076, 144 bázis8. exon: 39 171 369–39 171 630, 262 bázis7. exon: 39 175 949–39 176 092, 144 bázis6. exon: 39 177 318–39 177 502, 185 bázis5. exon: 39 178 157–39 178 360, 204 bázis4. exon: 39 193 128–39 193 275, 148 bázis3. exon: 39 238 993–39 239 186, 194 bázis2. exon: 39 266 896–39 267 006, 111 bázis1. exon: 39 287 980–39 288 167, 188 bázis24201510515′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 223,5 kb-jából 13,2 kb-ot tesznek ki; ezek közül 3867 bázis kódolja a fehérjét.

CNTNAP3 szekvenálása

97Nehéz

Mennyire nehéz a CNTNAP3 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A CNTNAP3 nagy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok elronthatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.

Ehhez hozzájárul: a CNTNAP3 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség93%
  • Homológia100%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések4,6%
  • GC-tartalom9,2%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). CNTNAP3 gén: contactin associated protein family member 3. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/cntnap3

Vancouver

Dante Labs. CNTNAP3 gén: contactin associated protein family member 3 [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/cntnap3

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet