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Gen

ST8SIA4

ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
5q21.1
Koordinaten
Chromosom 5: 100.806.933–100.903.282 (GRCh38)
Exons
5 Exons über 96,4 kb
Protein
359 Aminosäuren
Auch bekannt als
PST, PST1
Frühere Symbole
SIAT8D
MANE-Select-Transkript
ENST00000231461.10NM_005668.6
Locus-Typ
Proteinkodierend
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet ST8SIA4 bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von ST8SIA4

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 5, mit einer Klammer, an der ST8SIA4 liegt. ST8SIA4 und 2 Gene in der Nähe auf Chromosom 5, von 100.355.108 bis 101.355.107.Chromosom 55q21.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3100,4 Mb100,6 Mb100,8 Mb101 Mb101,2 Mb: 100.388.975–100.392.895, Plus-StrangFAM174A: 100.535.301–100.637.897, Plus-StrangFAM174AST8SIA4: 100.806.933–100.903.282, Minus-StrangST8SIA4Diagramm von ST8SIA4: 5 Exons auf dem Minus-Strang von Chromosom 5Exon 5: 100.806.933–100.812.129, 5.197 BasenExon 4: 100.856.103–100.856.396, 294 BasenExon 3: 100.886.343–100.886.600, 258 BasenExon 2: 100.895.654–100.895.785, 132 BasenExon 1: 100.902.843–100.903.282, 440 Basen543215′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 6,3 kb der 96,4 kb des Gens aus; 1.080 dieser Basen kodieren für das Protein.

Sequenzierung von ST8SIA4

2Leicht

Wie schwer sich ST8SIA4 mit Short Reads sequenzieren lässt, von 100

Almost all of ST8SIA4's exons sit where short reads map cleanly.

What adds to it: the share of ST8SIA4's exons in each kind of hard region

  • Mappability0,1 %
  • Homologie0 %
  • Wiederholungen5 %
  • GC-Gehalt13 %
  • Referenzabdeckung0 %

A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scored

Externe Links

Herkunft der Daten

  • HGNC: das Gensymbol, der Name, weitere Symbole und die Lage des Gens.
  • MANE Select v1.5 von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
  • Die Genome-in-a-Bottle-Genomstratifizierungen des NIST: der Schwierigkeitswert der Sequenzierung.

Diese Seite zitieren

APA

Dante Labs. (o. J.). ST8SIA4-Gen: ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4. Abgerufen am 18. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/st8sia4

Vancouver

Dante Labs. ST8SIA4-Gen: ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 [Internet]. [zitiert am 18. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/st8sia4

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