Gen

SPATA31A1

SPATA31 subfamily A member 1

Zytogenetische Lage: 9p12
Koordinaten: Chromosom 9: 39.355.669–39.361.962 (GRCh38)
Exons: 4 Exons über 6,3 kb
Protein: 1.347 Aminosäuren
Auch bekannt als: DKFZP434B204, C9orf36A
Frühere Symbole: C9orf36, FAM75A1, SPATA31A2, FAM75A2
MANE-Select-Transkript: ENST00000377647.6NM_001085452.4
Locus-Typ: Proteinkodierend

Sehr hoch
Zuversichtlich
Niedrig
Sehr niedrig

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Aufbau von SPATA31A1

Kodierende Sequenz
Nicht translatierte Region
Intron
Transkriptionsrichtung
Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 4,3 kb der 6,3 kb des Gens aus; 4.044 dieser Basen kodieren für das Protein.

Sequenzierung von SPATA31A1

65Schwer

Wie schwer sich SPATA31A1 mit Short Reads sequenzieren lässt, auf einer Skala von 100

Ein großer Teil von SPATA31A1 liegt in Bereichen, in denen Short Reads eine Veränderung übersehen oder falsch zuordnen können.

Dazu kommt der Anteil der Exons von SPATA31A1 in jeder Art schwieriger Region

Mappability100 %
Homologie100 %
Wiederholungen1,6 %
GC-Gehalt1,5 %
Referenzabdeckung0 %

Ein Dante-Labs-Score aus unserer eigenen Forschung, basierend auf den Karten schwer sequenzierbarer Regionen aus Genome in a Bottle des NIST.So wird bewertet

Externe Links

Gendatensätze

Transkript

Protein

Varianten

Klinik

Herkunft der Daten

HGNC: das Gensymbol, der Name, weitere Symbole und die Lage des Gens.
MANE Select v1.5 von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
Die Genome-in-a-Bottle-Genomstratifizierungen des NIST: der Schwierigkeitswert der Sequenzierung.

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APA

Dante Labs. (o. J.). SPATA31A1-Gen: SPATA31 subfamily A member 1. Abgerufen am 18. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/spata31a1

Vancouver

Dante Labs. SPATA31A1-Gen: SPATA31 subfamily A member 1 [Internet]. [zitiert am 18. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/spata31a1

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