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Gen

PJA2

praja ring finger ubiquitin ligase 2

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
5q21.3
Koordinaten
Chromosom 5: 109.334.722–109.409.974 (GRCh38)
Exons
10 Exons über 75,3 kb
Protein
708 Aminosäuren
Auch bekannt als
KIAA0438, Neurodap1, PRAJA2
Frühere Symbole
RNF131
MANE-Select-Transkript
ENST00000361189.7NM_014819.5
Locus-Typ
Proteinkodierend
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet PJA2 bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von PJA2

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 5, mit einer Klammer, an der PJA2 liegt. PJA2 und 2 Gene in der Nähe auf Chromosom 5, von 108.872.348 bis 109.872.347.Chromosom 55q21.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3109 Mb109,2 Mb109,4 Mb109,6 Mb109,8 MbFER: 108.747.841–109.196.841, Plus-StrangFERPJA2: 109.334.722–109.409.974, Minus-StrangPJA2MAN2A1: 109.689.367–109.869.625, Plus-StrangMAN2A1Diagramm von PJA2: 10 Exons auf dem Minus-Strang von Chromosom 5Exon 10: 109.334.722–109.337.356, 2.635 BasenExon 9: 109.344.190–109.344.311, 122 BasenExon 8: 109.344.705–109.344.819, 115 BasenExon 7: 109.355.915–109.356.026, 112 BasenExon 6: 109.362.840–109.363.022, 183 BasenExon 5: 109.368.561–109.368.746, 186 BasenExon 4: 109.378.204–109.379.254, 1.051 BasenExon 3: 109.381.503–109.381.703, 201 BasenExon 2: 109.383.403–109.383.520, 118 BasenExon 1: 109.409.842–109.409.974, 133 Basen10864215′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 4,9 kb der 75,3 kb des Gens aus; 2.127 dieser Basen kodieren für das Protein.

Sequenzierung von PJA2

2Leicht

Wie schwer sich PJA2 mit Short Reads sequenzieren lässt, auf einer Skala von 100

Fast alle Exons von PJA2 liegen in Bereichen, die Short Reads sauber abbilden.

Dazu kommt der Anteil der Exons von PJA2 in jeder Art schwieriger Region

  • Mappability0 %
  • Homologie0 %
  • Wiederholungen5,4 %
  • GC-Gehalt14 %
  • Referenzabdeckung0 %

Ein Dante-Labs-Score aus unserer eigenen Forschung, basierend auf den Karten schwer sequenzierbarer Regionen aus Genome in a Bottle des NIST.So wird bewertet

Externe Links

Herkunft der Daten

  • HGNC: das Gensymbol, der Name, weitere Symbole und die Lage des Gens.
  • MANE Select v1.5 von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
  • Die Genome-in-a-Bottle-Genomstratifizierungen des NIST: der Schwierigkeitswert der Sequenzierung.

Diese Seite zitieren

APA

Dante Labs. (o. J.). PJA2-Gen: praja ring finger ubiquitin ligase 2. Abgerufen am 18. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/pja2

Vancouver

Dante Labs. PJA2-Gen: praja ring finger ubiquitin ligase 2 [Internet]. [zitiert am 18. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/pja2

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