Gen
EPHA3
EPH receptor A3
- HGNC 3387↗(öffnet sich in einem neuen Tab)
- Ensembl-Gen ENSG00000044524↗(öffnet sich in einem neuen Tab)
- NCBI Gene 2042↗(öffnet sich in einem neuen Tab)
Zusammenfassung
- Zytogenetische Lage
- 3p11.1
- Koordinaten
- Chromosom 3: 89.107.621–89.482.134 (GRCh38)
- Exons
- 17 Exons über 374,5 kb
- Protein
- 983 Aminosäuren
- Auch bekannt als
- HEK, HEK4
- Frühere Symbole
- ETK, ETK1, TYRO4
- MANE-Select-Transkript
- ENST00000336596.7NM_005233.6
- Locus-Typ
- Proteinkodierend
- Sehr hoch
- Zuversichtlich
- Niedrig
- Sehr niedrig
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Aufbau von EPHA3
- Kodierende Sequenz
- Nicht translatierte Region
- Intron
- Transkriptionsrichtung
- Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.
Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).
Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.
Exons machen 5,7 kb der 374,5 kb des Gens aus; 2.952 dieser Basen kodieren für das Protein.
Sequenzierung von EPHA3
1Leicht
Wie schwer sich EPHA3 mit Short Reads sequenzieren lässt, von 100
0 · Easy100 · Hard
Almost all of EPHA3's exons sit where short reads map cleanly.
What adds to it: the share of EPHA3's exons in each kind of hard region
- MappabilityAbschnitte, in denen Reads mit 100 oder 250 bp nicht eindeutig platziert werden können, sodass ein Befund dort fehlen oder falsch sein kann. Gewichtung 35 %.0 %
- HomologieSegmentale Duplikationen: Kopien an anderer Stelle im Genom, etwa Paralogen und Pseudogene, mit 90 % Identität oder mehr. Gewichtung 30 %.0 %
- WiederholungenTandemwiederholungen und Folgen gleicher Basen, auf denen Reads verrutschen und die sie möglicherweise nicht vollständig überspannen. Gewichtung 15 %.1,7 %
- GC-GehaltFenster mit unter 25 % oder über 65 % G und C, die bei der Bibliotheksvorbereitung nur dünn abgedeckt werden. Gewichtung 10 %.5,8 %
- ReferenzabdeckungLücken in der Referenzassemblierung in der Nähe, an denen es keine Sequenz gibt, an die sich Reads anlagern können. Gewichtung 10 %.0 %
A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scoredJeder Balken zeigt den Anteil der Exonbasen von EPHA3 in dieser Art schwieriger Region. Der Score gewichtet sie danach, wie stark jede einen Short-Read-Befund belastet: 0, wenn keine Base in einer solchen Region liegt, 100, wenn jede Base in allen liegt.
Externe Links
Gendatensätze
Transkript
Protein
Herkunft der Daten
- HGNC: das Gensymbol, der Name, weitere Symbole und die Lage des Gens.
- MANE Select v1.5 von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
- Die Genome-in-a-Bottle-Genomstratifizierungen des NIST: der Schwierigkeitswert der Sequenzierung.
Diese Seite zitieren
Dante Labs. (o. J.). EPHA3-Gen: EPH receptor A3. Abgerufen am 18. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/epha3
Dante Labs. EPHA3-Gen: EPH receptor A3 [Internet]. [zitiert am 18. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/epha3
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