Gen
XYLB
xylulokinase
- HGNC 12839↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000093217↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 9942↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 3p22.2
- Koordinater
- Kromosom 3: 38.346.785–38.414.985 (GRCh38)
- Exoner
- 19 exoner fordelt over 68,2 kb
- Protein
- 536 aminosyrer
- Også kendt som
- FLJ10343, FLJ12539
- MANE Select-transkript
- ENST00000207870.8NM_005108.4
- Lokustype
- Proteinkodende
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/xylb.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs XYLB og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Ingen Genome Test-rapport læser XYLB endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.
Sådan er XYLB opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 3,7 kb af genets 68,2 kb; 1.611 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af XYLB
1Let
Hvor svært XYLB er at sekventere med korte reads, ud af 100
0 · Easy100 · Hard
Almost all of XYLB's exons sit where short reads map cleanly.
What adds to it: the share of XYLB's exons in each kind of hard region
- MappabilityStrækninger, hvor reads på 100 eller 250 bp ikke kan placeres entydigt, så et kald der kan mangle eller være forkert. Vægt 35 %.0 %
- HomologiSegmentale duplikationer: kopier andre steder i genomet, fx paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mere. Vægt 30 %.0 %
- GentagelserTandemgentagelser og løb af en enkelt base, som reads glider på og måske ikke spænder over. Vægt 15 %.3 %
- GC-indholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dækker tyndt. Vægt 10 %.7,4 %
- ReferencedækningHuller i referenceassemblyet i nærheden, hvor der ikke er nogen sekvens, reads kan justeres op mod. Vægt 10 %.0 %
A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scoredHver søjle er andelen af XYLBs eksonbaser i den pågældende type svært område. Scoren vægter dem efter, hvor meget hver enkelt koster et kald med korte reads: 0, når ingen base er i nogen, 100, når alle baser er i alle.
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor det kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). XYLB-genet: xylulokinase. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/xylb
Dante Labs. XYLB-genet: xylulokinase [Internet]. [citeret 18. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/xylb
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger