Gå til indhold
Brug dine HSA- eller FSA-midler
Sekvenér dit genom (åbnes i en ny fane)

Gen

SUMF2

sulfatase modifying factor 2

Oversigt

Cytogenetisk placering
7p11.2
Koordinater
Kromosom 7: 56.064.286–56.080.670 (GRCh38)
Exoner
9 exoner fordelt over 16,4 kb
Protein
301 aminosyrer
Også kendt som
DKFZp566I1024
MANE Select-transkript
ENST00000434526.8NM_015411.4
Lokustype
Proteinkodende
  • Meget høj
  • Sikker
  • Lav
  • Meget lav

Kurerede rapporter relevant for dette gen

Ingen Genome Test-rapport læser SUMF2 endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.

Sådan er SUMF2 opbygget

  • Kodende sekvens
  • Utranslateret region
  • Intron
  • Transkriptionsretning
  • Regioner, som korte læsninger har svært ved
Kromosom 7, med en klamme ved SUMF2. SUMF2 og 11 gener i nærheden på kromosom 7, fra 55.572.478 til 56.572.477.Kromosom 77p11.2p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.31q31.32q31.33q32.1q32.2q32.3q33q34q35q36.1q36.2q36.355,6 Mb55,8 Mb56 Mb56,2 Mb56,4 MbVOPP1: 55.427.766–55.572.988, omvendt-strengVOPP1SEPTIN14: 55.793.540–55.862.755, omvendt-strengSEPTIN14ZNF713: 55.887.260–55.942.530, fremadrettet-strengZNF713: 55.887.277–55.955.239, fremadrettet-strengMRPS17: 55.950.705–55.956.500, fremadrettet-strengMRPS17NIPSNAP2: 55.951.793–56.000.184, fremadrettet-strengNIPSNAP2PSPH: 56.010.119–56.051.609, omvendt-strengPSPHCCT6A: 56.051.685–56.063.992, fremadrettet-strengCCT6ASUMF2: 56.064.286–56.080.670, fremadrettet-strengSUMF2PHKG1: 56.079.923–56.093.012, omvendt-strengPHKG1CHCHD2: 56.094.567–56.106.531, omvendt-strengCHCHD2NUPR2: 56.114.681–56.116.422, omvendt-strengNUPR2Diagram af SUMF2: 9 exoner på fremadrettet-strengen af kromosom 7Exon 1: 56.064.286–56.064.378, 93 baserExon 2: 56.068.482–56.068.638, 157 baserExon 3: 56.072.997–56.073.111, 115 baserExon 4: 56.074.174–56.074.218, 45 baserExon 5: 56.074.586–56.074.736, 151 baserExon 6: 56.076.834–56.076.889, 56 baserExon 7: 56.078.102–56.078.186, 85 baserExon 8: 56.078.364–56.078.508, 145 baserExon 9: 56.079.528–56.080.670, 1.143 baser1234567895′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.

Eksoner udgør 2 kb af genets 16,4 kb; 906 af disse baser koder for proteinet.

Sekventering af SUMF2

14Moderat

Hvor svær SUMF2 er at sekventere med korte reads, ud af 100

Nogle af SUMF2s exons ligger, hvor korte reads kan overse eller fejlplacere en ændring.

Det, der lægger oven i: andelen af SUMF2s exons i hver type svær region

  • Kortlægbarhed0,4 %
  • Homologi45 %
  • Gentagelser1,7 %
  • GC-indhold4,7 %
  • Referencedækning0 %

En Dante Labs-score baseret på vores egen forskning, bygget på NIST's Genome in a Bottle-kort over svært sekventerbare regioner.Sådan scores det

Eksterne links

Hvor det kommer fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
  • Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.

Citér denne side

APA

Dante Labs. (u.d.). SUMF2-genet: sulfatase modifying factor 2. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/sumf2

Vancouver

Dante Labs. SUMF2-genet: sulfatase modifying factor 2 [Internet]. [citeret 18. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/sumf2

Én test. Svar for hele livet.

Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger

Bestil min Genome Test