Gå til indhold
Brug dine HSA- eller FSA-midler
Sekvenér dit genom (åbnes i en ny fane)

Gen

ST6GALNAC1

ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 1

Oversigt

Cytogenetisk placering
17q25.1
Koordinater
Kromosom 17: 76.624.763–76.643.757 (GRCh38)
Exoner
9 exoner fordelt over 19 kb
Protein
600 aminosyrer
Også kendt som
ST6GalNAcI
Tidligere symboler
SIAT7A
MANE Select-transkript
ENST00000156626.12NM_018414.5
Lokustype
Proteinkodende
  • Meget høj
  • Sikker
  • Lav
  • Meget lav

Kurerede rapporter relevant for dette gen

Ingen Genome Test-rapport læser ST6GALNAC1 endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.

Sådan er ST6GALNAC1 opbygget

  • Kodende sekvens
  • Utranslateret region
  • Intron
  • Transkriptionsretning
  • Regioner, som korte læsninger har svært ved
Kromosom 17, med en klamme ved ST6GALNAC1. ST6GALNAC1 og 21 gener i nærheden på kromosom 17, fra 76.134.260 til 77.134.259.Kromosom 1717q25.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.376,2 Mb76,4 Mb76,6 Mb76,8 Mb77 MbFOXJ1: 76.136.333–76.141.256, omvendt-strengFOXJ1RNF157: 76.142.460–76.240.662, omvendt-strengRNF157UBALD2: 76.265.197–76.271.298, fremadrettet-strengUBALD2QRICH2: 76.274.049–76.308.282, omvendt-strengQRICH2PRPSAP1: 76.309.478–76.384.521, omvendt-strengPRPSAP1SPHK1: 76.376.584–76.387.860, fremadrettet-strengSPHK1UBE2O: 76.389.456–76.453.226, omvendt-strengUBE2OAANAT: 76.452.749–76.470.122, fremadrettet-strengAANATRHBDF2: 76.470.884–76.501.790, omvendt-strengRHBDF2CYGB: 76.527.356–76.551.175, omvendt-strengCYGBPRCD: 76.527.586–76.553.578, fremadrettet-strengPRCD: 76.563.710–76.569.724, omvendt-strengST6GALNAC2: 76.564.424–76.586.956, omvendt-strengST6GALNAC2ST6GALNAC1: 76.624.763–76.643.757, omvendt-strengST6GALNAC1MXRA7: 76.672.551–76.711.091, omvendt-strengMXRA7JMJD6: 76.712.830–76.726.784, omvendt-strengJMJD6METTL23: 76.725.981–76.735.416, fremadrettet-strengMETTL23: 76.732.978–76.738.522, fremadrettet-strengSRSF2: 76.734.115–76.737.919, omvendt-strengSRSF2MFSD11: 76.735.865–76.789.874, fremadrettet-strengMGAT5B: 76.868.134–76.950.393, fremadrettet-strengMGAT5BSEC14L1: 77.088.749–77.217.101, fremadrettet-strengSEC14L1Diagram af ST6GALNAC1: 9 exoner på omvendt-strengen af kromosom 17Exon 9: 76.624.763–76.625.527, 765 baserExon 8: 76.625.819–76.625.918, 100 baserExon 7: 76.626.006–76.626.095, 90 baserExon 6: 76.626.289–76.626.392, 104 baserExon 5: 76.626.651–76.626.789, 139 baserExon 4: 76.627.067–76.627.238, 172 baserExon 3: 76.627.415–76.627.583, 169 baserExon 2: 76.629.012–76.629.711, 700 baserExon 1: 76.643.508–76.643.757, 250 baser9864215′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.

Eksoner udgør 2,5 kb af genets 19 kb; 1.803 af disse baser koder for proteinet.

Sekventering af ST6GALNAC1

0Let

Hvor svær ST6GALNAC1 er at sekventere med korte reads, ud af 100

Næsten alle eksonerne i ST6GALNAC1 ligger, hvor korte reads kan kortlægges uden problemer.

Det der forstærker det: andelen af ST6GALNAC1s eksoner i hver type svært område

  • Mappability0 %
  • Homologi0 %
  • Delt med chrY0 %
  • Referencedækning0 %
  • Gentagelser0 %
  • GC-indhold0 %

En Dante Labs-score baseret på vores egen forskning, bygget på NIST's Genome in a Bottle-kort over svært sekventerbare regioner.Sådan scores det

Eksterne links

Hvor det kommer fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
  • Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.

Citér denne side

APA

Dante Labs. (u.d.). ST6GALNAC1-genet: ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 1. Hentet 20. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/st6galnac1

Vancouver

Dante Labs. ST6GALNAC1-genet: ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 1 [Internet]. [citeret 20. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/st6galnac1

Én test. Svar for hele livet.

Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger

Bestil min Genome Test