Gå til indhold
Brug dine HSA- eller FSA-midler
Sekvenér dit genom (åbnes i en ny fane)

Gen

SOBP

sine oculis binding protein homolog

Oversigt

Cytogenetisk placering
6q21
Koordinater
Kromosom 6: 107.490.117–107.661.306 (GRCh38)
Exoner
7 exoner fordelt over 171,2 kb
Protein
873 aminosyrer
Også kendt som
FLJ10159
MANE Select-transkript
ENST00000317357.10NM_018013.4
Lokustype
Proteinkodende
  • Meget høj
  • Sikker
  • Lav
  • Meget lav

Kurerede rapporter relevant for dette gen

Ingen Genome Test-rapport læser SOBP endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.

Sådan er SOBP opbygget

  • Kodende sekvens
  • Utranslateret region
  • Intron
  • Transkriptionsretning
  • Regioner, som korte læsninger har svært ved
Kromosom 6, med en klamme ved SOBP. SOBP og 5 gener i nærheden på kromosom 6, fra 107.075.712 til 108.075.711.Kromosom 66q21p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q27107,2 Mb107,4 Mb107,6 Mb107,8 Mb108 MbBEND3: 107.065.138–107.116.234, omvendt-strengBEND3PDSS2: 107.152.556–107.459.582, omvendt-strengPDSS2SOBP: 107.490.117–107.661.306, fremadrettet-strengSOBPSCML4: 107.701.722–107.824.328, omvendt-strengSCML4SEC63: 107.867.756–107.958.311, omvendt-strengSEC63OSTM1: 108.029.245–108.165.854, omvendt-strengOSTM1Diagram af SOBP: 7 exoner på fremadrettet-strengen af kromosom 6Exon 1: 107.490.117–107.490.712, 596 baserExon 2: 107.503.657–107.503.795, 139 baserExon 3: 107.506.242–107.506.427, 186 baserExon 4: 107.533.459–107.533.610, 152 baserExon 5: 107.587.080–107.587.175, 96 baserExon 6: 107.633.514–107.635.469, 1.956 baserExon 7: 107.658.207–107.661.306, 3.100 baser124675′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.

Eksoner udgør 6,2 kb af genets 171,2 kb; 2.622 af disse baser koder for proteinet.

Sekventering af SOBP

4Lav

Hvor svært SOBP er at sekventere med korte læsninger, på en skala fra 0 til 100

  • Mappabilitet0 %
  • Homologi0 %
  • Gentagelser8,4 %
  • GC-indhold32 %
  • Referencedækning0 %

Træk knyttet til SOBP

Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, SOBP kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.

Eksterne links

Hvor det kommer fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
  • Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.
  • Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.

Citér denne side

APA

Dante Labs. (u.d.). SOBP-genet: sine oculis binding protein homolog. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/sobp

Vancouver

Dante Labs. SOBP-genet: sine oculis binding protein homolog [Internet]. [citeret 18. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/sobp

Én test. Svar for hele livet.

Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger

Bestil min Genome Test