Gå til indhold
Brug dine HSA- eller FSA-midler
Sekvenér dit genom (åbnes i en ny fane)

Gen

SCGB1C1

secretoglobin family 1C member 1

Oversigt

Cytogenetisk placering
11p15.5
Koordinater
Kromosom 11: 193.078–194.575 (GRCh38)
Exoner
3 exoner fordelt over 1,5 kb
Protein
95 aminosyrer
Også kendt som
RYD5
MANE Select-transkript
ENST00000342878.3NM_145651.3
Lokustype
Proteinkodende
  • Meget høj
  • Sikker
  • Lav
  • Meget lav

Kurerede rapporter relevant for dette gen

Ingen Genome Test-rapport læser SCGB1C1 endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.

Sådan er SCGB1C1 opbygget

  • Kodende sekvens
  • Utranslateret region
  • Intron
  • Transkriptionsretning
  • Regioner, som korte læsninger har svært ved
Kromosom 11, med en klamme ved SCGB1C1. SCGB1C1 og 28 gener i nærheden på kromosom 11, fra 1 til 693.826.Kromosom 1111p15.5p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q250,1 Mb0,2 Mb0,3 Mb0,4 Mb0,5 Mb0,6 MbBET1L: 167.784–208.695, omvendt-strengBET1LSCGB1C1: 193.078–194.575, fremadrettet-strengSCGB1C1CIMAP1A: 196.761–200.261, fremadrettet-strengCIMAP1ARIC8A: 207.478–215.164, fremadrettet-strengRIC8ASIRT3: 215.026–236.931, omvendt-strengPSMD13: 236.948–252.986, fremadrettet-strengPSMD13NLRP6: 278.407–286.691, fremadrettet-strengNLRP6PGGHG: 289.078–297.510, fremadrettet-strengPGGHGIFITM5: 298.200–299.533, omvendt-strengIFITM5IFITM2: 303.655–309.410, fremadrettet-strengIFITM2: 308.408–315.272, fremadrettet-strengIFITM3: 309.010–329.475, omvendt-strengIFITM1: 309.997–315.275, fremadrettet-strengB4GALNT4: 369.457–382.117, fremadrettet-strengB4GALNT4PKP3: 392.574–404.908, fremadrettet-strengPKP3SIGIRR: 405.711–417.473, omvendt-strengSIGIRRANO9: 417.921–442.072, omvendt-strengANO9PTDSS2: 448.268–501.142, fremadrettet-strengPTDSS2RNH1: 494.510–507.395, omvendt-strengRNH1HRAS: 532.242–537.343, omvendt-strengHRASLRRC56: 536.841–554.925, fremadrettet-strengLRRC56LMNTD2: 554.850–560.743, omvendt-strengLMNTD2RASSF7: 560.207–564.067, fremadrettet-strengRASSF7PHRF1: 576.170–612.263, fremadrettet-strengPHRF1IRF7: 612.551–615.983, omvendt-strengIRF7CDHR5: 616.405–626.078, omvendt-strengCDHR5SCT: 626.309–627.236, omvendt-strengSCTDRD4: 637.269–640.706, fremadrettet-strengDRD4DEAF1: 644.220–707.118, omvendt-strengDEAF1Diagram af SCGB1C1: 3 exoner på fremadrettet-strengen af kromosom 11Exon 1: 193.078–193.154, 77 baserExon 2: 193.712–193.911, 200 baserExon 3: 194.418–194.575, 158 baser1235′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.

Eksoner udgør 0,4 kb af genets 1,5 kb; 288 af disse baser koder for proteinet.

Sekventering af SCGB1C1

100Svær

Hvor svær SCGB1C1 er at sekventere med korte reads, ud af 100

En stor del af SCGB1C1 ligger, hvor korte reads kan overse eller fejlplacere en ændring.

Det, der lægger oven i: andelen af SCGB1C1s exons i hver type svær region

  • Kortlægbarhed100 %
  • Homologi100 %
  • Shared with chrY0 %
  • Referencedækning0 %
  • Gentagelser0 %
  • GC-indhold0 %

En Dante Labs-score baseret på vores egen forskning, bygget på NIST's Genome in a Bottle-kort over svært sekventerbare regioner.Sådan scores det

Eksterne links

Hvor det kommer fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
  • Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.

Citér denne side

APA

Dante Labs. (u.d.). SCGB1C1-genet: secretoglobin family 1C member 1. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/scgb1c1

Vancouver

Dante Labs. SCGB1C1-genet: secretoglobin family 1C member 1 [Internet]. [citeret 19. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/scgb1c1

Én test. Svar for hele livet.

Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger

Bestil min Genome Test