Gå til indhold
Brug dine HSA- eller FSA-midler
Sekvenér dit genom (åbnes i en ny fane)

Gen

PHYKPL

5-phosphohydroxy-L-lysine phospho-lyase

Oversigt

Cytogenetisk placering
5q35.3
Koordinater
Kromosom 5: 178.208.471–178.232.802 (GRCh38)
Exoner
13 exoner fordelt over 24,3 kb
Protein
450 aminosyrer
Også kendt som
MGC15875
Tidligere symboler
AGXT2L2
MANE Select-transkript
ENST00000308158.10NM_153373.4
Lokustype
Proteinkodende
  • Meget høj
  • Sikker
  • Lav
  • Meget lav

Kurerede rapporter relevant for dette gen

Ingen Genome Test-rapport læser PHYKPL endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.

Sådan er PHYKPL opbygget

  • Kodende sekvens
  • Utranslateret region
  • Intron
  • Transkriptionsretning
  • Regioner, som korte læsninger har svært ved
Kromosom 5, med en klamme ved PHYKPL. PHYKPL og 13 gener i nærheden på kromosom 5, fra 177.720.637 til 178.720.636.Kromosom 55q35.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3177,8 Mb178 Mb178,2 Mb178,4 Mb178,6 MbFAM153A: 177.707.981–177.784.435, omvendt-strengFAM153APROP1: 177.992.235–177.996.242, omvendt-strengPROP1FAM153CP: 178.006.348–178.086.529, fremadrettet-strengFAM153CPN4BP3: 178.113.167–178.127.034, fremadrettet-strengN4BP3RMND5B: 178.129.068–178.152.762, fremadrettet-strengRMND5BNHP2: 178.139.872–178.153.968, omvendt-strengNHP2GMCL2: 178.184.505–178.187.371, omvendt-strengGMCL2HNRNPAB: 178.204.479–178.216.389, fremadrettet-strengHNRNPABPHYKPL: 178.208.471–178.232.802, omvendt-strengPHYKPLCOL23A1: 178.237.476–178.590.393, omvendt-strengCOL23A1CLK4: 178.602.659–178.630.615, omvendt-strengCLK4MSANTD5: 178.694.559–178.697.761, omvendt-strengMSANTD5: 178.694.605–178.729.335, omvendt-strengZNF354A: 178.711.510–178.732.381, omvendt-strengZNF354ADiagram af PHYKPL: 13 exoner på omvendt-strengen af kromosom 5Exon 13: 178.208.471–178.208.915, 445 baserExon 12: 178.211.890–178.211.970, 81 baserExon 11: 178.212.973–178.213.103, 131 baserExon 10: 178.214.796–178.214.885, 90 baserExon 9: 178.215.276–178.215.430, 155 baserExon 8: 178.222.355–178.222.580, 226 baserExon 7: 178.222.852–178.222.934, 83 baserExon 6: 178.224.448–178.224.564, 117 baserExon 5: 178.224.642–178.224.729, 88 baserExon 4: 178.225.355–178.225.429, 75 baserExon 3: 178.229.940–178.230.099, 160 baserExon 2: 178.231.405–178.231.523, 119 baserExon 1: 178.232.492–178.232.802, 311 baser131210864215′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.

Eksoner udgør 2,1 kb af genets 24,3 kb; 1.353 af disse baser koder for proteinet.

Sekventering af PHYKPL

2Let

Hvor svært PHYKPL er at sekventere med korte reads, ud af 100

Almost all of PHYKPL's exons sit where short reads map cleanly.

What adds to it: the share of PHYKPL's exons in each kind of hard region

  • Mappability0 %
  • Homologi0 %
  • Gentagelser0,8 %
  • GC-indhold15 %
  • Referencedækning0 %

A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scored

Træk knyttet til PHYKPL

Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, PHYKPL kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.

Eksterne links

Hvor det kommer fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
  • Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.
  • Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.

Citér denne side

APA

Dante Labs. (u.d.). PHYKPL-genet: 5-phosphohydroxy-L-lysine phospho-lyase. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/phykpl

Vancouver

Dante Labs. PHYKPL-genet: 5-phosphohydroxy-L-lysine phospho-lyase [Internet]. [citeret 18. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/phykpl

Én test. Svar for hele livet.

Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger

Bestil min Genome Test