Gen
KRTAP5-11
keratin associated protein 5-11
- HGNC 23606↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000204571↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 440051↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 11q13.4
- Koordinater
- Kromosom 11: 71.581.855–71.582.875 (GRCh38)
- Exoner
- 1 exon fordelt over 1 kb
- Protein
- 156 aminosyrer
- Også kendt som
- KRTAP5.11, KRTAP5-6
- MANE Select-transkript
- ENST00000398530.1NM_001005405.3
- Lokustype
- Proteinkodende
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/krtap5-11.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs KRTAP5-11 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Ingen Genome Test-rapport læser KRTAP5-11 endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.
Sådan er KRTAP5-11 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 1 kb af genets 1 kb; 471 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af KRTAP5-11
36Svær
Hvor svær KRTAP5-11 er at sekventere med korte reads, ud af 100
0 · Let100 · Svær
Meget af KRTAP5-11 ligger, hvor korte reads kan overse eller fejlplacere en ændring.
Det, der lægger til: andelen af eksonerne i KRTAP5-11 i hver type svær region
- KortlægningsbarhedStrækninger, hvor reads på 100 eller 250 bp ikke kan placeres entydigt, så et kald dér kan mangle eller være forkert. Vægt 35 %.1,4 %
- HomologiSegmentale duplikationer: kopier andre steder i genomet, fx paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mere. Vægt 30 %.100 %
- GentagelserTandem-gentagelser og serier af én base, som reads glider på og måske ikke kan spænde over. Vægt 15 %.36 %
- GC-indholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dækker tyndt. Vægt 10 %.0 %
- ReferencedækningHuller i den nærliggende referencesamling, hvor der ikke findes nogen sekvens, som reads kan tilpasses til. Vægt 10 %.0 %
En Dante Labs-score baseret på vores egen forskning, bygget på NIST's Genome in a Bottle-kort over svært sekventerbare regioner.Sådan beregnes scorenHver søjle er andelen af eksonbaserne i KRTAP5-11 i den pågældende type svær region. Scoren vægter dem efter, hvor meget hver koster et kald med korte reads: 0, når ingen base ligger i nogen, 100, når alle baser ligger i alle.
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Klinisk
Hvor det kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). KRTAP5-11-genet: keratin associated protein 5-11. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/krtap5-11
Dante Labs. KRTAP5-11-genet: keratin associated protein 5-11 [Internet]. [citeret 18. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/krtap5-11
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger