Retinoblastom — çocukluk çağındaki en yaygın göz içi kanseridir; bu hastalıkta, RB1 geninin germ hattı durumu, hayatta kalan hastanın hayatının geri kalanı boyunca ikinci bir kanser gelişip gelişmediğinin izlenmesini belirler.
Tüm genom dizilemesi, standart kan tabanlı testlerin gözden kaçırabileceği mozaik mutasyonlar da dahil olmak üzere tüm RB1 varyant türlerini tespit eder ve yaşam boyu kanser izleme ihtiyaçlarını belirleyen germ hattı ile somatik hücreler arasındaki ayrımı netleştirir.
Retinoblastom
Retinoblastom (Rb), çocukluk çağındaki en sık görülen göz içi kötü huylu tümördür; yaklaşık 15.000-20.000 canlı doğumdan 1'ini etkiler ve dünya çapında her yıl yaklaşık 8.000 yeni vaka teşhis edilmektedir. Retinoblastom, moleküler düzeyde karakterize edilen ilk tümör baskılayıcı gen olan 13q14.2 kromozomundaki RB1 tümör baskılayıcı genin biallelik inaktivasyonu nedeniyle, retinanın olgunlaşmamış öncü hücreleri olan retinoblastlardan kaynaklanır. Retinoblastom, genellikle 5 yaşın altındaki çocuklarda lökokori (beyaz pupil refleksi), şaşılık ve görme kaybı ile kendini gösterir. Mevcut tedavilerle, yüksek gelirli ülkelerde genel sağkalım oranı %95'in üzerindedir, ancak sonuçlar hastalığın evresine ve kaynakların mevcudiyetine göre önemli ölçüde değişiklik göstermektedir.
Retinoblastom vakalarının yaklaşık %40’u kalıtsaldır — bu vakalar, RB1 genindeki germ hattı (konstitüsyonel) patojenik varyanttan kaynaklanır. Kalıtsal retinoblastom genellikle iki taraflıdır (%75-80) veya multifokaldir ve tanı konulan ortalama yaş, sporadik vakalara göre daha düşüktür. Geri kalan ~%60 oranındaki vakalar sporadiktir (kalıtsal değildir) ve tek bir retina hücresindeki iki somatik RB1 mutasyonundan kaynaklanır. Tek taraflı retinoblastom kalıtsal veya sporadik olabilir — tek taraflı vakaların yaklaşık %15'inde germ hattı RB1 varyantları bulunurken, bu oran bilateral vakalarda neredeyse %100'e çıkar. Tespit edilebilir germ hattı varyantı olmayan tek taraflı retinoblastom vakalarının yaklaşık %10-15'i, yalnızca tümörde veya derin kan sekanslamasında tespit edilebilen somatik mozaik RB1 mutasyonları taşır.
Kalıtsal ve kalıtsal olmayan retinoblastom arasındaki en önemli fark, göz tümörünün prognozunda değil, yaşam boyu ikinci bir kansere yakalanma riskinde yatmaktadır. Kalıtsal RB1 taşıyıcılarının 50 yaşına kadar ikinci bir primer kansere yakalanma riski tahmini olarak %50’dir; bu kanserler ağırlıklı olarak radyasyon alanıyla ilişkili osteosarkomlar, yumuşak doku sarkomları ve melanomlardır. Bu risk, radyasyon tedavisi ile önemli ölçüde artmaktadır; bu nedenle germ hattı RB1 taşıyıcılarında mümkün olduğunca radyasyon tedavisinden kaçınılmaktadır. Kalıtsal retinoblastomdan sağ kurtulanlar için ömür boyu bir izleme protokolü uygulanır: yumuşak doku ve kemik tümörleri için düzenli görüntüleme, UV radyasyonundan kaçınma ve bebeklik döneminde oftalmik muayene ile birlikte çocuklarda kademeli genetik testler. Gen terapisi ve hedefe yönelik RB1 yolak yaklaşımları araştırılmaktadır.
Mozaik RB1 mutasyonları — yani germ hattı varyantının hücrelerin yalnızca bir kısmında bulunduğu durumlar — kalıtsal retinoblastom vakalarının yaklaşık %10-12’sinde görülür ve standart kan bazlı sekanslama yöntemleriyle tespit edilemeyebilir. Derin sekanslama ve tümör dokusu analizi, bu mutasyonların saptanma oranını artırır.
Germ hattı ile somatik mozaik RB1 durumunun ayırt edilmesi, standart panellerin ulaşamayabileceği sekanslama derinliklerinde hem kan hem de tümör dokusu analizini gerektirir. Kanda %5-20 allel fraksiyonuna sahip mozaik varyantlar, geleneksel testlerde gözden kaçmaktadır.
Mosaik RB1 varyantları, standart germ hattı testlerinde tespit edilememektedir — ve bu durum tüm aile için klinik sonuçlar doğurmaktadır
Retinoblastomda somatik mozaiklik — yani RB1 patojenik varyantının zigot oluşumundan sonra ortaya çıktığı ve hücrelerin yalnızca bir alt kümesinde bulunduğu durum — kalıtsal vakaların yaklaşık %10-12’sini etkilemektedir. Mozaik RB1'li bir indeks hastanın ebeveynleri, çok düşük varyant alel fraksiyonlarında kendileri de mozaik mozaikizme sahip olabilir. Standart ekzom ve panel sekanslaması, ~%50 alel fraksiyonundaki germ hattı heterozigot varyantları için kalibre edilmiştir; %10-20 oranında mevcut olan mozaik varyantlar, varyant belirleme eşiğinin altına düşebilir. Düşük alel fraksiyonlu varyantlar için geliştirilmiş hassasiyete sahip derin tüm genom sekanslaması, mozaik tespitini iyileştirir. Ebeveynlerde mozaik germ hattı RB1 varyantının gözden kaçırılması, yanlış tekrarlama riski danışmanlığına yol açar — ebeveynin aslında varyantı aktarabileceği halde, bir sonraki hamileliğin risksiz olduğu şeklinde sunulmasına neden olur.
Tümör tedavisi sırasında radyasyon tedavisi kararları, RB1 geninin germ hattı durumuna göre belirlenir
Retinoblastom için uygulanan dış ışın radyasyon tedavisi, ışınlama alanındaki germ hattı RB1 taşıyıcılarında ikincil primer kanser riskini önemli ölçüde artırmaktadır — özellikle de göz çukuru bölgesinde osteosarkom riskini. Bu nedenle, kalıtsal retinoblastomun güncel tedavisinde, özellikle radyasyona bağlı ikincil kanser riskinden kaçınmak amacıyla, mümkün olduğunda radyasyon içermeyen yaklaşımlar (intraarteriyel kemoterapi, intravitreus melphalan, fokal tedaviler) şiddetle tercih edilmektedir. Bu tedavi kararını vermek için, ikinci bir kanser geliştiğinde yıllar sonra değil, ilk tedavi sırasında germ hattı RB1 durumunun bilinmesi gerekir. Tam genom dizilemesi, mozaik tespiti de dahil olmak üzere eksiksiz RB1 genotipini sağlar ve böylece tedavinin ilk günden itibaren planlanmasına yardımcı olur.
DNA'nızın tamamı (sadece bir kısmı değil)
Geleneksel genetik testler, genomunuzun büyük bir kısmını göz ardı ederek sınırlı gen gruplarını inceler. Biz ise genomunuzun tamamını — her geni ve genler arasındaki her bölgeyi — dizilendiriyoruz.
Kapsamlı analizler ve uzmanlık raporları
Okuması kolay ve hem sizin hem de doktorunuzun harekete geçebileceği çözümler sunuyor. Yorumlanması gereken bir dosya değil — 200'den fazla klinik rapor, kategorilere göre düzenlenmiş.
Sınavınız her yıl daha da değer kazanıyor
DNA'nız değişmez, ancak genom bilimi hızla gelişiyor. Her ay, yeni varyant-hastalık ilişkileri keşfediliyor. Bu bulguları doğruluyor ve raporlarınızı otomatik olarak güncelliyoruz. Testiniz her yıl daha da değer kazanıyor.
Doktorların en zor vakalarında elde ettikleri sonuçlar.
Kırk yıllık belirsizlik. Tek bir test.
Bir hasta, Birleşik Krallık sağlık sisteminde onlarca yıl boyunca teşhis konulamadan yaşamıştı. Glasgow Queen Elizabeth Üniversite Hastanesi’ndeki NHS klinik ekipleri tarafından kabul edilen Dante verileri, Noonan Sendromu’nu ve daha önce tespit edilememiş bir RUNX1 lösemiye bağlı varyantını ortaya çıkardı. 40 yıl sonra, nihayet bir cevap buldular.
Kitabı baştan sona okumak, konuyla ilgili tam bir fikir verir.
Bir hasta, periyodik felç şikayetiyle Dante'ye başvurdu. Genomun tamamının incelenmesi sonucunda, eşzamanlı bir kalıtsal kalp bulgusu — Brugada sendromu — tespit edildi; hastanın doktoru da bunu bir EKG ile doğruladı. Bu sonuç, bir aile ferdinin açıklanamayan kalp öyküsünü de aydınlattı. Tek bir test. İçinde tüm cevaplar.
2019 yılında dizilendi. Veriler 2021 yılında işlendi.
Jennifer, meme kanseri teşhisi konmadan iki yıl önce Dante ile genom dizilimini yaptırdı. Tedaviye başlandığında, Dante’nin farmakogenomik verileri, kendisine reçete edilen kemoterapinin ciddi yan etkilere yol açacağını gösterdi. Doktoru alternatif bir tedavi yöntemi seçti ve Jennifer, ilk günden itibaren etkili bir tedaviye başladı.
Her genetik soru, kapsamlı bir yanıtı hak eder.
İster bugün cevaplar arıyor olun, ister yarın için sağlığınızı korumaya çalışıyor olun, başlangıç noktası ancak genomunuzun tamamını kapsamlı bir şekilde incelemektir.
Bu, ailenizde görülen bir durum. Artık bunun genlerinizde olup olmadığını öğrenebilirsiniz.
Genomunuzda kalp hastalıkları, kanser ve nörolojik rahatsızlıklar gibi tıbbi durumlarla ilişkili kalıtsal varyantlar bulunmaktadır. Sonuçlara anlam kazandıracak klinik derinlikte bir yaklaşımla bunların hepsini inceliyoruz.
Daha fazla bilgi edinin →Geleneksel laboratuvar testleri her şeyin yolunda olduğunu söylese de, siz durumun öyle olmadığını biliyorsunuz.
Standart tanı testleri, önceden belirlenmiş bir dizi yanıtı kontrol eder. Biz ise DNA’nızın tamamını diziliyoruz — hiçbir testin kontrol etmek üzere tasarlanmadığı kısımlar da dahil. Cevap genomunuzda saklıysa, onu bulmanıza yardımcı olacağız.
Daha fazla bilgi edinin →Teşhisiniz doğru olabilir. Tedavi planınız eksik olabilir.
Genleriniz, hangi tedavilerin işe yarama olasılığının yüksek olduğunu — ve hangilerinin yaramayacağını belirler. Biz, doktorunuza tedavi planınızı şekillendirmek için gerekli araçları ve bilgileri sağlıyoruz.
Daha fazla bilgi edinin →Bir şey seni bu soruyu sormaya zorlamadan önce bilmek istiyorsun.
Bazı insanlar harekete geçmek için bir tanı veya aile öyküsü beklemez. Tam genom dizilemesi size genetik durumun tam resmini hemen sunar — böylece siz ve doktorunuz durum acil hale gelmeden önce bilgiye dayalı kararlar alabilirsiniz.
Daha fazla bilgi edinin →Zaten bir DNA testi yaptırdınız. İşte bu testin size söyleyemediği şeyler.
Çoğu tüketiciye yönelik DNA testi, genomunuzun %0,1'inden azını analiz eder. Biz ise genomunuzun tamamını analiz ediyoruz.
Daha fazla bilgi edinin →Klinik düzeyde sonuçlar. Bireyler tarafından tercih edilen, doktorlar tarafından en karmaşık vakalarda güvenilen bir ürün.
Dante Genom Testi, Birleşik Krallık’taki bir ulusal acil hastanesindeki uzmanların Noonan Sendromu’nu ve daha önce tespit edilememiş, lösemiye bağlı nadir bir genetik varyantı tanımlamasına yardımcı oldu. Bu sonuç, hastanın tedavisini değiştirdi.
Onaylayan ve yayınlayan
Tüm genom dizilemesi hakkında sık sorulan sorular.
Tüm genom dizilemesi ile hedefli genetik test arasındaki fark nedir?
Hedefli genetik testler — standart kalıtsal kanser panelleri dahil — belirli bir gen grubundaki bilinen varyantların önceden tanımlanmış bir listesini inceler. Bu testler, önceden belirlenmiş hedefleri tespit etmek üzere tasarlanmıştır. Tam genom dizilemesi ise tüm genomunuzu inceler: 6 milyar baz çifti, her geni ve genler arasındaki her bölgeyi. JAMA Oncology dergisinde yayınlanan bir Mayo Clinic çalışması, standart test kılavuzlarının kalıtsal kanser mutasyonları olan hastaların yarısından fazlasını gözden kaçırdığını ortaya koydu. Genom Testi'nin sabit bir listesi yoktur.
Sonuçlarım hazır olduğunda ne alacağım?
Dante Genome, kalıtsal kanser, kalp rahatsızlıkları, nadir hastalıklar, farmakogenomik, taşıyıcı durumu ve daha fazlası gibi klinik kategorilere göre düzenlenmiş 200'den fazla hekimlere hazır rapor sunar. Raporlar, güvenli Genome Manager hesabınıza gönderilir ve doğrudan klinik kullanım için uygun biçimde düzenlenir. Genom verileriniz kalıcı olarak saklanır ve bilimsel gelişmeler doğrultusunda otomatik olarak yeniden analiz edilir.
Klinik açıdan önemli bir varyant tespit edilirse ne olur?
Patojenik veya patojenik olasılığı yüksek bir varyant tespit edilirse, bu durum klinik bağlam, yayınlanmış kanıtlar ve önerilen sonraki adımlarla birlikte doktorlara sunuma hazır raporunuzda açıkça belirtilecektir. Klinik açıdan önemli tüm bulguları, aile üyeleri için izleme, risk azaltma veya kaskad testlerine ilişkin kararlar konusunda size rehberlik edebilecek doktorunuzla veya bir genetik danışmanla paylaşmanızı öneririz.
Bu, 23andMe veya AncestryDNA gibi tüketici DNA testlerinden ne farkı var?
Tüketiciye yönelik DNA testleri, genomunuzun %0,1’inden daha azını okuyan genotipleme çipleri kullanır — bu, önceden seçilmiş, yaygın varyantlardan oluşan çok küçük bir kümedir. Bu testler, klinik genetik bulgular için değil, soy ve popülasyon düzeyindeki özellikler için optimize edilmiştir. Dante Genom Testi, genomunuzun %100'ünü 30X kapsama ile diziler; bu, klinik tanı ortamlarında kullanılan standartla aynıdır. Bu iki testin kapsamı, metodolojisi veya klinik yararı açısından karşılaştırılması mümkün değildir.
Sonuçların alınması ne kadar sürer ve nasıl iletilir?
Örnek alma setiniz, siparişinizden sonraki 48 saat içinde kargoya verilir. Örneğiniz CLIA sertifikalı laboratuvarımıza ulaştığında, dizileme ve analiz işlemleri 6–8 hafta sürer. Sonuçlar güvenli bir şekilde Genome Manager hesabınıza gönderilir; burada raporlarınıza erişebilir, bunları doktorunuzla paylaşabilir ve genomunuzla karşılaştırılarak doğrulanmış yeni bulgular hakkında otomatik güncellemeler alabilirsiniz.
Dünya çapında hasta hakları savunucusu gruplarla işbirliği yapıyoruz.
Dante Labs, her büyüklükteki hasta hakları savunuculuğu gruplarıyla işbirliği yapmaktadır — retinoblastom ve diğer nadir ya da yaygın hastalıklar için. Sanal hasta hakları savunuculuğu grupları da dahil olmak üzere, dünyanın her ülkesindeki gruplara destek veriyoruz.
Üyelerinize özel raporlar, grup indirimleri ve paketler sunabiliriz. Lütfen formu kullanarak bize ulaşın; iki iş günü içinde sizinle iletişime geçeceğiz.
- Üyeleriniz için kişiye özel genom raporları
- Grup indirimleri ve kişiye özel paketler
- Herhangi bir ülke — sanal gruplar dahil
- Kapsam dahilindeki nadir ve yaygın hastalıklar
Mesaj alındı.
2 iş günü içinde sizinle iletişime geçeceğiz. Doğrudan takip etmek isterseniz: hello@dantelabs.com
Tek bir test.
Bir ömür boyu cevaplar.
Evinize gönderilen tek bir kit. Tüm genomunuz, tanı kararlarında kullanılan klinik standartlara göre dizilenir. 6–8 hafta içinde Genome Manager hesabınıza gönderilen 200'den fazla hekimlere uygun rapor — kalıcı ve bilimsel gelişmelerle birlikte güncellenir.
48 saat içinde gönderilir · 6–8 hafta içinde sonuçlanır
