Peutz-Jeghers Sendromu — altı organ sisteminde %85'in üzerinde kümülatif kanser riski taşıyan kalıtsal bir hamartom sendromu olup, izleme protokollerinin çocukluk döneminde başlatılması gerekmektedir.
STK11, ACMG SF v3.2 ikincil bulgular listesinde yer almaktadır. Tam genom dizilemesi, PJS vakalarının yaklaşık %30’unu oluşturan ve standart dizileme panelleriyle güvenilir bir şekilde tespit edilemeyen büyük genomik delesyonlar da dahil olmak üzere, STK11 geninin eksiksiz bir karakterizasyonunu sağlar.
Peutz-Jeghers Sendromu
Peutz-Jeghers sendromu (PJS), 19p13.3 kromozomundaki STK11 (serin/treonin kinaz 11, LKB1 olarak da bilinir) genindeki germ hattı patojenik varyantlarının neden olduğu, otozomal dominant kalıtsal bir gastrointestinal polipozis ve kansere yatkınlık sendromudur. STK11, AMPK’yi aktive eden ve hücre polaritesini ile enerji metabolizmasını düzenleyen bir tümör baskılayıcı kinazı kodlar. PJS, gastrointestinal sistemin tamamında (en belirgin olarak ince bağırsakta) karakteristik hamartomatöz poliplerin gelişmesi, belirgin mukokutanöz pigmentasyon (dudaklarda, ağız mukozasında, parmaklarda ve perianal bölgede melanin lekeleri) ve birçok organda önemli ölçüde artmış kanser riski ile karakterizedir. PJS'nin prevalansı yaklaşık 50.000-200.000'de 1'dir.
PJS'de yaşam boyu kümülatif kanser riski olağanüstü derecede yüksektir — herhangi bir kanser türü için 70 yaşına kadar bu risk %85'in üzerinde olduğu tahmin edilmektedir. Kişisel yaşam boyu kanser riskleri arasında şunlar yer almaktadır: gastrointestinal kanserler (ince bağırsak ~%13, kolorektal ~%40, mide ~%29), pankreas kanseri (~%36), meme kanseri (kadınlarda ~%54), jinekolojik kanserler (servikal adenokarsinom ~%10, uterus ~%9, annüler tübüllü yumurtalık seks kord tümörü ~%21) ve akciğer kanseri (~%15). Gözetim çocukluk döneminde başlamalı ve aynı anda birden fazla organ sistemini kapsamalıdır. İnce bağırsak polipleri çocukluk çağında tekrarlayan intussepsiyona neden olur ve sıklıkla acil cerrahi gerektirir — bu durum, düzenli ince bağırsak izlemi ve büyük polipler tespit edildiğinde profilaktik polipektomi ile önlenebilir.
Sendromik tanı kriterlerini karşılayan PJS vakalarının yaklaşık %94-96’sında tanımlanabilir bir STK11 patojenik varyantı bulunmaktadır. MLPA veya kopya sayısı varyantı analizi ile saptanabilen büyük delesyonlar veya duplikasyonlar, STK11 patojenik varyantlarının yaklaşık %30’unu oluşturmaktadır — bunlar, yalnızca ekzon dizilemesi içeren standart panellerde gözden kaçmaktadır. Tespit edilebilir STK11 varyantları bulunmayan klinik PJS vakalarının geri kalan ~%4-6'sı, somatik mozaiklik, derin intronik varyantlar veya genetik heterojeniteyi temsil edebilir. STK11, ACMG SF v3.2 ikincil bulgular listesinde yer almaktadır; bu, teyit edilmiş taşıyıcılarda kanser mortalitesini önemli ölçüde azaltan etkili gözetim müdahalelerinin mevcudiyetini yansıtmaktadır.
STK11 genindeki patojenik varyantların %30’u, standart sekanslama panellerinde gözden kaçan büyük delesyonlardır. Kanser taramasının çocukluk döneminde başlaması gereken bir sendromda, gözden kaçan bir tanı ömür boyu sürecek sonuçlar doğurur.
PJS'ye yol açan STK11 varyantlarının üçte biri delesyonlardır — standart sekanslama panelleri bunları tespit edememektedir
Doğrulanmış STK11 patojenik varyantlarının yaklaşık %30’u, bir veya daha fazla ekzonu kapsayan geniş genomik delesyonlardır. STK11 kodlayıcı ekzonlarını sekanslayan standart yeni nesil sekanslama panelleri, özel kopya sayısı varyantı analizi yapılmadıkça geniş delesyonları güvenilir bir şekilde tespit edememektedir. Tam klinik fenotipi (mukokutanöz pigmentasyon, çoklu hamartomatöz polipler ve karakteristik aile öyküsü) olan ve hakkında yayınlanmış birkaç PJS ailesinde, panel sonuçlarının negatif çıkmasından aylar hatta yıllar önce STK11 delesyonları olduğu saptanmıştır. Pediatrik ince bağırsak taramasının 8 yaşında (NCCN önerisi) ve pankreas taramasının 35 yaşında başladığı bir sendromda, bu büyüklükte bir tanı gecikmesi, kanser önleme açısından doğrudan sonuçlar doğurur.
PJS taraması aynı anda altı farklı kanser türünü kapsamaktadır — tam protokolün başlatılması için tek bir kesin tanı yeterlidir
STK11 moleküler tanısının konulması, standart kanser tarama önerilerinden önemli ölçüde farklılık gösteren çoklu organ izleme protokolünü devreye sokar. NCCN PJS kılavuzları şunları önermektedir: 8-10 yaş arasında üst gastrointestinal endoskopi ve kolonoskopi; 8-10 yaş arasında ince bağırsak/kapsül endoskopisi; 25 yaşından itibaren yıllık meme MRG'si ve 30 yaşından itibaren mamografi; 18 yaşından itibaren yıllık pelvik ultrason veya endometrial değerlendirme; 35 yaşından itibaren pankreas izlemesi (endoskopik ultrason/MRG); ve erkeklerde doğumdan itibaren testis muayenesi (SCTAT riski). Hiçbir standart kanser tarama programı bunların hepsini kapsamaz — teyit edilmiş bir PJS moleküler tanısı, izlemeyi anlamlı kılan kapsamlı protokolü başlatmak için ön koşuldur.
DNA'nızın tamamı (sadece bir kısmı değil)
Geleneksel genetik testler, genomunuzun büyük bir kısmını göz ardı ederek sınırlı gen gruplarını inceler. Biz ise genomunuzun tamamını — her geni ve genler arasındaki her bölgeyi — dizilendiriyoruz.
Kapsamlı analizler ve uzmanlık raporları
Okuması kolay ve hem sizin hem de doktorunuzun harekete geçebileceği çözümler sunuyor. Yorumlanması gereken bir dosya değil — 200'den fazla klinik rapor, kategorilere göre düzenlenmiş.
Sınavınız her yıl daha da değer kazanıyor
DNA'nız değişmez, ancak genom bilimi hızla gelişiyor. Her ay, yeni varyant-hastalık ilişkileri keşfediliyor. Bu bulguları doğruluyor ve raporlarınızı otomatik olarak güncelliyoruz. Testiniz her yıl daha da değer kazanıyor.
Doktorların en zor vakalarında elde ettikleri sonuçlar.
Kırk yıllık belirsizlik. Tek bir test.
Bir hasta, Birleşik Krallık sağlık sisteminde onlarca yıl boyunca teşhis konulamadan yaşamıştı. Glasgow Queen Elizabeth Üniversite Hastanesi’ndeki NHS klinik ekipleri tarafından kabul edilen Dante verileri, Noonan Sendromu’nu ve daha önce tespit edilememiş bir RUNX1 lösemiye bağlı varyantını ortaya çıkardı. 40 yıl sonra, nihayet bir cevap buldular.
Kitabı baştan sona okumak, konuyla ilgili tam bir fikir verir.
Bir hasta, periyodik felç şikayetiyle Dante'ye başvurdu. Genomun tamamının incelenmesi sonucunda, eşzamanlı bir kalıtsal kalp bulgusu — Brugada sendromu — tespit edildi; hastanın doktoru da bunu bir EKG ile doğruladı. Bu sonuç, bir aile ferdinin açıklanamayan kalp öyküsünü de aydınlattı. Tek bir test. İçinde tüm cevaplar.
2019 yılında dizilendi. Veriler 2021 yılında işlendi.
Jennifer, meme kanseri teşhisi konmadan iki yıl önce Dante ile genom dizilimini yaptırdı. Tedaviye başlandığında, Dante’nin farmakogenomik verileri, kendisine reçete edilen kemoterapinin ciddi yan etkilere yol açacağını gösterdi. Doktoru alternatif bir tedavi yöntemi seçti ve Jennifer, ilk günden itibaren etkili bir tedaviye başladı.
Her genetik soru, kapsamlı bir yanıtı hak eder.
İster bugün cevaplar arıyor olun, ister yarın için sağlığınızı korumaya çalışıyor olun, başlangıç noktası ancak genomunuzun tamamını kapsamlı bir şekilde incelemektir.
Bu, ailenizde görülen bir durum. Artık bunun genlerinizde olup olmadığını öğrenebilirsiniz.
Genomunuzda kalp hastalıkları, kanser ve nörolojik rahatsızlıklar gibi tıbbi durumlarla ilişkili kalıtsal varyantlar bulunmaktadır. Sonuçlara anlam kazandıracak klinik derinlikte bir yaklaşımla bunların hepsini inceliyoruz.
Daha fazla bilgi edinin →Geleneksel laboratuvar testleri her şeyin yolunda olduğunu söylese de, siz durumun öyle olmadığını biliyorsunuz.
Standart tanı testleri, önceden belirlenmiş bir dizi yanıtı kontrol eder. Biz ise DNA’nızın tamamını diziliyoruz — hiçbir testin kontrol etmek üzere tasarlanmadığı kısımlar da dahil. Cevap genomunuzda saklıysa, onu bulmanıza yardımcı olacağız.
Daha fazla bilgi edinin →Teşhisiniz doğru olabilir. Tedavi planınız eksik olabilir.
Genleriniz, hangi tedavilerin işe yarama olasılığının yüksek olduğunu — ve hangilerinin yaramayacağını belirler. Biz, doktorunuza tedavi planınızı şekillendirmek için gerekli araçları ve bilgileri sağlıyoruz.
Daha fazla bilgi edinin →Bir şey seni bu soruyu sormaya zorlamadan önce bilmek istiyorsun.
Bazı insanlar harekete geçmek için bir tanı veya aile öyküsü beklemez. Tam genom dizilemesi size genetik durumun tam resmini hemen sunar — böylece siz ve doktorunuz durum acil hale gelmeden önce bilgiye dayalı kararlar alabilirsiniz.
Daha fazla bilgi edinin →Zaten bir DNA testi yaptırdınız. İşte bu testin size söyleyemediği şeyler.
Çoğu tüketiciye yönelik DNA testi, genomunuzun %0,1'inden azını analiz eder. Biz ise genomunuzun tamamını analiz ediyoruz.
Daha fazla bilgi edinin →Klinik düzeyde sonuçlar. Bireyler tarafından tercih edilen, doktorlar tarafından en karmaşık vakalarda güvenilen bir ürün.
Dante Genom Testi, Birleşik Krallık’taki bir ulusal acil hastanesindeki uzmanların Noonan Sendromu’nu ve daha önce tespit edilememiş, lösemiye bağlı nadir bir genetik varyantı tanımlamasına yardımcı oldu. Bu sonuç, hastanın tedavisini değiştirdi.
Onaylayan ve yayınlayan
Tüm genom dizilemesi hakkında sık sorulan sorular.
Tüm genom dizilemesi ile hedefli genetik test arasındaki fark nedir?
Hedefli genetik testler — standart kalıtsal kanser panelleri dahil — belirli bir gen grubundaki bilinen varyantların önceden tanımlanmış bir listesini inceler. Bu testler, önceden belirlenmiş hedefleri tespit etmek üzere tasarlanmıştır. Tam genom dizilemesi ise tüm genomunuzu inceler: 6 milyar baz çifti, her geni ve genler arasındaki her bölgeyi. JAMA Oncology dergisinde yayınlanan bir Mayo Clinic çalışması, standart test kılavuzlarının kalıtsal kanser mutasyonları olan hastaların yarısından fazlasını gözden kaçırdığını ortaya koydu. Genom Testi'nin sabit bir listesi yoktur.
Sonuçlarım hazır olduğunda ne alacağım?
Dante Genome, kalıtsal kanser, kalp rahatsızlıkları, nadir hastalıklar, farmakogenomik, taşıyıcı durumu ve daha fazlası gibi klinik kategorilere göre düzenlenmiş 200'den fazla hekimlere hazır rapor sunar. Raporlar, güvenli Genome Manager hesabınıza gönderilir ve doğrudan klinik kullanım için uygun biçimde düzenlenir. Genom verileriniz kalıcı olarak saklanır ve bilimsel gelişmeler doğrultusunda otomatik olarak yeniden analiz edilir.
Klinik açıdan önemli bir varyant tespit edilirse ne olur?
Patojenik veya patojenik olasılığı yüksek bir varyant tespit edilirse, bu durum klinik bağlam, yayınlanmış kanıtlar ve önerilen sonraki adımlarla birlikte doktorlara sunuma hazır raporunuzda açıkça belirtilecektir. Klinik açıdan önemli tüm bulguları, aile üyeleri için izleme, risk azaltma veya kaskad testlerine ilişkin kararlar konusunda size rehberlik edebilecek doktorunuzla veya bir genetik danışmanla paylaşmanızı öneririz.
Bu, 23andMe veya AncestryDNA gibi tüketici DNA testlerinden ne farkı var?
Tüketiciye yönelik DNA testleri, genomunuzun %0,1’inden daha azını okuyan genotipleme çipleri kullanır — bu, önceden seçilmiş, yaygın varyantlardan oluşan çok küçük bir kümedir. Bu testler, klinik genetik bulgular için değil, soy ve popülasyon düzeyindeki özellikler için optimize edilmiştir. Dante Genom Testi, genomunuzun %100'ünü 30X kapsama ile diziler; bu, klinik tanı ortamlarında kullanılan standartla aynıdır. Bu iki testin kapsamı, metodolojisi veya klinik yararı açısından karşılaştırılması mümkün değildir.
Sonuçların alınması ne kadar sürer ve nasıl iletilir?
Örnek alma setiniz, siparişinizden sonraki 48 saat içinde kargoya verilir. Örneğiniz CLIA sertifikalı laboratuvarımıza ulaştığında, dizileme ve analiz işlemleri 6–8 hafta sürer. Sonuçlar güvenli bir şekilde Genome Manager hesabınıza gönderilir; burada raporlarınıza erişebilir, bunları doktorunuzla paylaşabilir ve genomunuzla karşılaştırılarak doğrulanmış yeni bulgular hakkında otomatik güncellemeler alabilirsiniz.
Dünya çapında hasta hakları savunucusu gruplarla işbirliği yapıyoruz.
Dante Labs, her büyüklükteki hasta hakları savunucusu gruplarla işbirliği yapmaktadır — Peutz-Jeghers Sendromu ve diğer nadir ya da yaygın hastalıklar için. Sanal hasta hakları savunucusu gruplar da dahil olmak üzere, her ülkedeki gruplara destek veriyoruz.
Üyelerinize özel raporlar, grup indirimleri ve paketler sunabiliriz. Lütfen formu kullanarak bize ulaşın; iki iş günü içinde sizinle iletişime geçeceğiz.
- Üyeleriniz için kişiye özel genom raporları
- Grup indirimleri ve kişiye özel paketler
- Herhangi bir ülke — sanal gruplar dahil
- Kapsam dahilindeki nadir ve yaygın hastalıklar
Mesaj alındı.
2 iş günü içinde sizinle iletişime geçeceğiz. Doğrudan takip etmek isterseniz: hello@dantelabs.com
Tek bir test.
Bir ömür boyu cevaplar.
Evinize gönderilen tek bir kit. Tüm genomunuz, tanı kararlarında kullanılan klinik standartlara göre dizilenir. 6–8 hafta içinde Genome Manager hesabınıza gönderilen 200'den fazla hekimlere uygun rapor — kalıcı ve bilimsel gelişmelerle birlikte güncellenir.
48 saat içinde gönderilir · 6–8 hafta içinde sonuçlanır
