Gen
JAK2
Janus kinase 2
- HGNC 6192↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000096968↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 3717↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 9p24.1
- Koordinatlar
- Kromozom 9: 4.985.272–5.129.948 (GRCh38)
- Eksonlar
- 144,7 kb boyunca 25 ekson
- Protein
- 1.132 amino asit, 130,7 kDa
- Diğer adları
- JTK10
- MANE Select transkripti
- ENST00000381652.4NM_004972.4
- Lokus türü
- Protein kodlayan
- Çok yüksek
- Yüksek
- Düşük
- Çok düşük
Bu sayfayı paylaş
Bu sayfa veri olarak
Sayfanın adresine .json ekleyin veya application/json isteyin; böylece sayfayı JSON olarak okuyabilirsiniz.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/jak2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameJAK2 ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili rapor
Kalıtsal Trombositemi (JAK2)
- Trombositemi 3Otozomal dominant
Kan hücresi üretimini kontrol eden bir sinyal proteini üreten JAK2'deki kalıtsal bir değişiklikten kaynaklanır. Bildirilen değişiklikler, proteinin aktivitesini kontrol eden ve onu daha aktif hale getiren bölgelerde yer alır; bu da trombosit üretimini artırır. Tanımlanan ilk değişiklik olan JAK2 R564Q, baskın kalıtılan trombositemisi olan bir ailede bulunmuştur.
- GenCC 22 GenCC değerlendiricisi bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
▶Eyleme geçirilebilirlik
Kan kanserleri etkilenen bazı ailelerde görüldüğü için, kan sayımlarının izlenmesi de dahil olmak üzere bir hematolog ile takip. Kanıtlar sınırlıdır ve çocuklar için üzerinde uzlaşılmış bir kılavuz yoktur. Otozomal baskın yolla kalıtıldığından, etkilenen bir ebeveynin her çocuğunun değişikliği miras alma olasılığı 1/2'dir ve akrabaların test edilmesi, değişikliği kimin taşıdığını gösterebilir.
JAK2 ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alJAK2 geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Bilinen hastalığa yol açan bölgeler
- Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 144,7 kb uzunluğunun 7 kb'sini oluşturur; bu bazların 3.399 tanesi proteini kodlar.
JAK2 Dizilemesi
3Kolay
JAK2 geninin kısa okumalarla dizilenmesinin ne kadar zor olduğu, 100 üzerinden
0 · Kolay100 · Zor
JAK2 geninin ekzonlarının neredeyse tamamı, kısa okumaların temiz biçimde eşleştiği yerlerde bulunuyor.
Buna eklenen etken: JAK2 geninin ekzonlarının her bir zor bölge türündeki payı
- Eşlenebilirlik100 veya 250 bp'lik okumaların tek bir yere yerleştirilemediği bölgeler; bu bölgelerdeki bir çağrı eksik veya yanlış olabilir. Tek başına, tamamı bu türde bir bölgede bulunan bir gen 100 puan alırdı.%0
- HomolojiGenomun başka yerlerindeki, paralog ve psödogenler gibi, %90 veya daha yüksek özdeşlikle kopyalanmış segmental duplikasyonlar. Tek başına, tamamı bu türde bir bölgede bulunan bir gen 60 puan alırdı.%0
- chrY ile ortak bölgelerchrX ve chrY'nin aynı veya neredeyse aynı diziyi taşıdığı pseudoautosomal bölgeler ve X'e transpoze olmuş bölge; bu nedenle bir chrX okuması chrY'ye yerleştirilmiş olabilir. Tek başına, tamamı bu türde bir bölgede bulunan bir gen 60 puan alırdı.%0
- Referans kapsamıYakınlardaki referans birleştirmesindeki boşluklar; okumaların hizalanacağı bir dizinin bulunmadığı yerler. Tek başına, tamamı bu türde bir bölgede bulunan bir gen 50 puan alırdı.%0
- TekrarlarOkumaların kaydığı ve tamamını kapsayamayabildiği ardışık tekrarlar ve tek bazın tekrarladığı diziler. Tek başına, tamamı bu türde bir bölgede bulunan bir gen 30 puan alırdı.%2,7
- GC içeriğiG ve C oranı %25'in altında veya %65'in üzerinde olan pencereler; kütüphane hazırlığı bu pencereleri seyrek kapsar. Tek başına, tamamı bu türde bir bölgede bulunan bir gen 20 puan alırdı.%11
Dante Labs'in, NIST'in zor dizilenen bölgelerin Genome in a Bottle haritaları üzerine kurulu kendi araştırmasından elde edilen bir Dante Labs puanı.Puanın hesaplanma biçimiHer çubuk, JAK2 geninin ekzon bazlarının o zor bölge türündeki payını gösterir. Her tür tek başına bir geni zor hale getirebilir ve her ek tür daha az katkı yapar: hiçbir bazın hiçbirinde yer almadığı durumda 0, her bazın tek bir yere yerleştirilemediği bölgede olduğu durumda 100.
5
ClinVar'ın bir değişikliği patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı JAK2 içindeki konumlar
Bunların hiçbiri, kısa okumaların zorlandığı bir bölgeye düşmüyor.
Tam genom dizilemesi, intronlar dahil olmak üzere JAK2 geninin tamamını, yani 144,7 kb'ın tamamını kapsar; yalnızca 7 kb'lık ekzonları değil.
ClinVar patojenik varyantlar (5)
ClinVar'ın JAK2 geninde patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı, herhangi bir hastalıkla ilişkili ve en az bir gönderen tarafından kriterlere göre incelenmiş varyantlar ile bunların arasında en çok incelenenler. Bu, ClinVar'ın genin herkese açık kaydıdır, hiçbir zaman bir test sonucu değildir.
- Patojenik 1
- Muhtemelen patojenik 4
| Varyant | Hastalıklar | ClinVar sınıflandırması | İnceleme durumu |
|---|---|---|---|
| NM_004972.4(JAK2):c.1849G>T (p.Val617Phe) | Budd-Chiari syndrome ve 5 diğer | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| NM_004972.4(JAK2):c.1691G>A (p.Arg564Gln) | Budd-Chiari syndrome ve 5 diğer | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_004972.4(JAK2):c.2600G>A (p.Arg867Gln) | Budd-Chiari syndrome ve 5 diğer | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_004972.4(JAK2):c.2813G>A (p.Arg938Gln) | thrombocythemia 3 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_004972.4(JAK2):c.3284C>T (p.Pro1095Leu) | acquired polycythemia vera | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
JAK2 ile bağlantılı özellikler
Human Phenotype Ontology, JAK2 geninin neden olabileceği nadir hastalıklarda görülen özellikler olarak bunları listeler. Her özelliğin sayfasında, o özellikle bağlantılı diğer genler listelenir.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Extramedullary hematopoiesis
- Increased circulating hemoglobin concentration
- Increased hematocrit
- Increased number of platelets in blood
- Myelofibrosis
- Abnormal shape of platelets
- Acute blood cancer
- Bleeding gums
36 özellik daha göster
- Bleeding tendency
- Blood clot in artery
- Blood clot in vein
- Bloody nose
- Bone marrow disease
- Bruising susceptibility
- Increased megakaryocyte count
- Increased red blood cells
- Megakaryocyte nucleus hyperlobulation
- Myelodysplasia
- Platelet abnormalities
- Prolonged bleeding time
- Abnormal megakaryocyte morphology
- Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Blood clot in liver vein
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Low platelet count
- Abnormal blood clot
- Acute myeloid leukemia
- Blood clot in portal vein
- Blood spots
- Bone marrow hypercellularity
- Chronic myelogenous leukemia
- Ecchymosis
- Elevated white blood count
- Gastrointestinal bleeding
- Low blood cell count
- Petechiae
- Poikilocytosis
- Blood tumor
- Bleeding in brain
- Increased micromegakaryocyte count
- Increased red blood cell mass
- Myeloproliferative disorder
- Peripheral blood clot
- Thromboembolism
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bu bilgiler nereden geliyor
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- MANE Select v1.5, NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı: transkript, ekzonlar ve kodlayıcı dizi.
- GenCC ve ClinGen, 2026-10-23 sürümünde yayımlandı: genin hangi hastalık durumlarıyla ilişkili olduğu ve bu ilişkinin ne kadar güçlü olduğu.
- ACMG ikincil bulgular listesi, SF v3.2.
- ClinVar ve GIAB stratifikasyonları: bilinen hastalığa yol açan bölgeler ile kısa okumaların zorlandığı bölgeler.
- NIST'ten Genome in a Bottle genom stratifikasyonları: dizileme güçlüğü puanı.
- Human Phenotype Ontology, 2026-09-01 sürümü: genle bağlantılı özellikler. Daha fazla bilgi için hpo.jax.org adresini ziyaret edin.
- Google DeepMind ve EMBL-EBI kaynaklı AlphaFold DB modeli AF-O60674-F1, sürüm 6 (CC BY 4.0): AlphaFold'un tahmin ettiği haliyle proteinin yapısı, ölçülmüş hali değil, ve her bölümdeki güven düzeyi.
- Veri sürümü 2026.10.23-dc0c0517.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). JAK2 geni: Janus kinase 2. Erişim tarihi: 24 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/jak2
Dante Labs. JAK2 geni: Janus kinase 2 [Internet]. [alıntı tarihi 24 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/jak2
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde