Ailesel Adenomatöz Polipozis — APC geninin işlev kaybına bağlı olarak ortaya çıkan yüzlerce ila binlerce kolorektal polip; cerrahi müdahale yapılmazsa neredeyse kesin olarak kansere dönüşür.
Tüm genom dizilemesi, standart kalıtsal kanser panellerinin sistematik olarak tespit edemediği derin intronik bölgeler, büyük delesyonlar ve mozaik varyantlar da dahil olmak üzere APC geninin tam dizisini okur.
Ailesel Adenomatöz Polipozis
Ailesel adenomatöz polipozis (FAP), 5q22.2 kromozomundaki APC (adenomatöz polipozis coli) tümör baskılayıcı genindeki patojenik varyantların neden olduğu, otozomal dominant kalıtsal bir kolorektal kanser sendromudur. Klasik FAP, tipik olarak yaşamın ikinci on yılında ortaya çıkan ve kolorektumun genelinde yüzlerce ila binlerce adenomatöz polipin gelişmesiyle karakterizedir. Cerrahi müdahale yapılmazsa, 50'li yaşlara gelindiğinde kolorektal kanser neredeyse kaçınılmazdır — tedavi edilmeyen klasik FAP'de yaşam boyu kolorektal kanser riski %100'e yaklaşır. FAP, tüm kolorektal kanserlerin yaklaşık %0,5-1'ini oluşturur ve 5.000'de 1 ila 10.000'de 1 kişiyi etkilediği tahmin edilmektedir.
Attenüe FAP (AFAP), APC geninin belirli bölgelerindeki (5' ucu, ekson 9 veya 3' ucu) varyantların neden olduğu daha hafif bir fenotipik varyanttır ve daha az sayıda polip (10-100), daha geç başlangıçlı polipozis, daha düşük ancak yine de önemli ölçüde artmış kolorektal kanser riski ve daha değişken bir klinik tablo ile karakterizedir. FAP'de genotip-fenotip korelasyonları iyi bilinmektedir: 1250-1464 kodonlarındaki (özellikle kodon 1309) varyantlar yoğun polipozis ve daha erken kolorektal kanser ile ilişkilidir; kodon 1310-1330 ve 1445-1580'deki varyantlar, desmoid tümör riski artışı ile ilişkilidir; ve 5' ucundaki varyantlar AFAP ile ilişkilidir. Duodenal adenomlar (yaşam boyu risk %100), tiroid kanseri, hepatoblastom (çocuklarda), desmoid tümörler, konjenital retinal pigment epiteli hipertrofisi (CHRPE) ve osteomlar dahil olmak üzere kolon dışı belirtiler, APC varyantının konumuna göre değişiklik gösterir.
Klasik FAP vakalarının yaklaşık %20-30’u, polipozis aile öyküsü olmayan de novo APC varyantlarından kaynaklanmaktadır. FAP klinik kriterlerini karşılayan hastaların %7-10’unda ise standart sekanslama yöntemleriyle saptanabilir bir APC varyantı bulunmamaktadır; bu grupta, standart gen paneli testleriyle tespit edilemeyen derin intronik splaysing varyantları, büyük genomik yeniden düzenlemeler (delesyonlar, duplikasyonlar) veya somatik mozaiklik bulunabilir. Biallelik MUTYH varyantlarının neden olduğu MUTYH ile ilişkili polipozis (MAP), hafif FAP'den ayırt edilemeyen bir fenotip oluşturabilir ve APC negatif polipozis hastalarında eşzamanlı MUTYH genotipleme gerektirir.
Klasik FAP, atüye FAP (AFAP) ve MUTYH ile ilişkili polipozis (MAP), farklı genetik nedenlere ve cerrahi sonuçlara sahip olmakla birlikte birbiriyle örtüşen klinik tablolar ortaya çıkarır. APC genindeki varyantın konumu, kolon dışı belirtilerin ortaya çıkma riskini belirler.
Standart kalıtsal kanser panelleri, APC geninin kodlayıcı eksonlarını inceler. Bu paneller, derin intronik varyantları, büyük yeniden düzenlemeleri ve mozaik mutasyonları gözden kaçırır; oysa klinik olarak etkilenmiş ailelerde negatif panel sonuçlarının nedenini açıklayan varyantlar işte bunlardır.
Klinik olarak FAP tanısı konmuş hastaların %30'a kadarı standart test setlerinde APC negatif sonuç vermektedir
Standart kalıtsal kanser panelleri, APC kodlama bölgesini ve ekleme bölgelerini sekanslar. Bu paneller, birden fazla ekzonu kapsayan büyük genomik delesyonları veya duplikasyonları, anormal ekleme bölgeleri oluşturan derin intronik varyantları ya da APC varyantının hücrelerin sadece bir kısmında mevcut olduğu somatik mozaikliği güvenilir bir şekilde tespit edemez. Çalışmalar, tanımlanmış APC kodlama varyantı bulunmayan klasik FAP hastalarının %7-10'unun, yalnızca kapsamlı genomik analizle tespit edilebilen derin intronik veya yapısal yeniden düzenleme varyantları taşıdığını ortaya koymuştur. Ek bir alt grup ise somatik mozaik APC mutasyonları barındırır; burada %10-20 oranındaki varyant alel fraksiyonları, standart panel sekanslama derinlikleriyle gözden kaçabilir. Kopya sayısı varyant analizi ile 30X kapsama oranında yapılan tüm genom sekanslaması, tüm bunları çözer.
APC varyantının konumu, cerrahi stratejiyi ve izleme yoğunluğunu belirler
FAP’de kolorektal cerrahi tedavi yaklaşımı tek tip değildir. 1250-1464 kodonlarında varyantları bulunan ve yoğun polipozisi olan hastalar genellikle ileal kese-anal anastomozlu restoratif proktokolektomiye ihtiyaç duyar. AFAP veya seyrek polipozisi olan hastalar ise ileorektal anastomozlu segmental kolektomi ve endoskopik izleme ile tedavi edilebilir. İntraabdominal desmoid tümör riski olan hastalarda cerrahi planlama için kritik öneme sahip olan desmoid risk sınıflandırması, kodon 1310-1580'deki APC varyantının konumuna bağlıdır. Düzenleyici ve intronik bölgeler dahil olmak üzere genin tamamının sekanslanması gereken tam bir APC genotipi olmadan bu genotip-fenotip sınıflandırmalarının hiçbiri mümkün değildir.
DNA'nızın tamamı (sadece bir kısmı değil)
Geleneksel genetik testler, genomunuzun büyük bir kısmını göz ardı ederek sınırlı gen gruplarını inceler. Biz ise genomunuzun tamamını — her geni ve genler arasındaki her bölgeyi — dizilendiriyoruz.
Kapsamlı analizler ve uzmanlık raporları
Okuması kolay ve hem sizin hem de doktorunuzun harekete geçebileceği çözümler sunuyor. Yorumlanması gereken bir dosya değil — 200'den fazla klinik rapor, kategorilere göre düzenlenmiş.
Sınavınız her yıl daha da değer kazanıyor
DNA'nız değişmez, ancak genom bilimi hızla gelişiyor. Her ay, yeni varyant-hastalık ilişkileri keşfediliyor. Bu bulguları doğruluyor ve raporlarınızı otomatik olarak güncelliyoruz. Testiniz her yıl daha da değer kazanıyor.
Doktorların en zor vakalarında elde ettikleri sonuçlar.
Kırk yıllık belirsizlik. Tek bir test.
Bir hasta, Birleşik Krallık sağlık sisteminde onlarca yıl boyunca teşhis konulamadan yaşamıştı. Glasgow Queen Elizabeth Üniversite Hastanesi’ndeki NHS klinik ekipleri tarafından kabul edilen Dante verileri, Noonan Sendromu’nu ve daha önce tespit edilememiş bir RUNX1 lösemiye bağlı varyantını ortaya çıkardı. 40 yıl sonra, nihayet bir cevap buldular.
Kitabı baştan sona okumak, konuyla ilgili tam bir fikir verir.
Bir hasta, periyodik felç şikayetiyle Dante'ye başvurdu. Genomun tamamının incelenmesi sonucunda, eşzamanlı bir kalıtsal kalp bulgusu — Brugada sendromu — tespit edildi; hastanın doktoru da bunu bir EKG ile doğruladı. Bu sonuç, bir aile ferdinin açıklanamayan kalp öyküsünü de aydınlattı. Tek bir test. İçinde tüm cevaplar.
2019 yılında dizilendi. Veriler 2021 yılında işlendi.
Jennifer, meme kanseri teşhisi konmadan iki yıl önce Dante ile genom dizilimini yaptırdı. Tedaviye başlandığında, Dante’nin farmakogenomik verileri, kendisine reçete edilen kemoterapinin ciddi yan etkilere yol açacağını gösterdi. Doktoru alternatif bir tedavi yöntemi seçti ve Jennifer, ilk günden itibaren etkili bir tedaviye başladı.
Her genetik soru, kapsamlı bir yanıtı hak eder.
İster bugün cevaplar arıyor olun, ister yarın için sağlığınızı korumaya çalışıyor olun, başlangıç noktası ancak genomunuzun tamamını kapsamlı bir şekilde incelemektir.
Bu, ailenizde görülen bir durum. Artık bunun genlerinizde olup olmadığını öğrenebilirsiniz.
Genomunuzda kalp hastalıkları, kanser ve nörolojik rahatsızlıklar gibi tıbbi durumlarla ilişkili kalıtsal varyantlar bulunmaktadır. Sonuçlara anlam kazandıracak klinik derinlikte bir yaklaşımla bunların hepsini inceliyoruz.
Daha fazla bilgi edinin →Geleneksel laboratuvar testleri her şeyin yolunda olduğunu söylese de, siz durumun öyle olmadığını biliyorsunuz.
Standart tanı testleri, önceden belirlenmiş bir dizi yanıtı kontrol eder. Biz ise DNA’nızın tamamını diziliyoruz — hiçbir testin kontrol etmek üzere tasarlanmadığı kısımlar da dahil. Cevap genomunuzda saklıysa, onu bulmanıza yardımcı olacağız.
Daha fazla bilgi edinin →Teşhisiniz doğru olabilir. Tedavi planınız eksik olabilir.
Genleriniz, hangi tedavilerin işe yarama olasılığının yüksek olduğunu — ve hangilerinin yaramayacağını belirler. Biz, doktorunuza tedavi planınızı şekillendirmek için gerekli araçları ve bilgileri sağlıyoruz.
Daha fazla bilgi edinin →Bir şey seni bu soruyu sormaya zorlamadan önce bilmek istiyorsun.
Bazı insanlar harekete geçmek için bir tanı veya aile öyküsü beklemez. Tam genom dizilemesi size genetik durumun tam resmini hemen sunar — böylece siz ve doktorunuz durum acil hale gelmeden önce bilgiye dayalı kararlar alabilirsiniz.
Daha fazla bilgi edinin →Zaten bir DNA testi yaptırdınız. İşte bu testin size söyleyemediği şeyler.
Çoğu tüketiciye yönelik DNA testi, genomunuzun %0,1'inden azını analiz eder. Biz ise genomunuzun tamamını analiz ediyoruz.
Daha fazla bilgi edinin →Klinik düzeyde sonuçlar. Bireyler tarafından tercih edilen, doktorlar tarafından en karmaşık vakalarda güvenilen bir ürün.
Dante Genom Testi, Birleşik Krallık’taki bir ulusal acil hastanesindeki uzmanların Noonan Sendromu’nu ve daha önce tespit edilememiş, lösemiye bağlı nadir bir genetik varyantı tanımlamasına yardımcı oldu. Bu sonuç, hastanın tedavisini değiştirdi.
Onaylayan ve yayınlayan
Tüm genom dizilemesi hakkında sık sorulan sorular.
Tüm genom dizilemesi ile hedefli genetik test arasındaki fark nedir?
Hedefli genetik testler — standart kalıtsal kanser panelleri dahil — belirli bir gen grubundaki bilinen varyantların önceden tanımlanmış bir listesini inceler. Bu testler, önceden belirlenmiş hedefleri tespit etmek üzere tasarlanmıştır. Tam genom dizilemesi ise tüm genomunuzu inceler: 6 milyar baz çifti, her geni ve genler arasındaki her bölgeyi. JAMA Oncology dergisinde yayınlanan bir Mayo Clinic çalışması, standart test kılavuzlarının kalıtsal kanser mutasyonları olan hastaların yarısından fazlasını gözden kaçırdığını ortaya koydu. Genom Testi'nin sabit bir listesi yoktur.
Sonuçlarım hazır olduğunda ne alacağım?
Dante Genome, kalıtsal kanser, kalp rahatsızlıkları, nadir hastalıklar, farmakogenomik, taşıyıcı durumu ve daha fazlası gibi klinik kategorilere göre düzenlenmiş 200'den fazla hekimlere hazır rapor sunar. Raporlar, güvenli Genome Manager hesabınıza gönderilir ve doğrudan klinik kullanım için uygun biçimde düzenlenir. Genom verileriniz kalıcı olarak saklanır ve bilimsel gelişmeler doğrultusunda otomatik olarak yeniden analiz edilir.
Klinik açıdan önemli bir varyant tespit edilirse ne olur?
Patojenik veya patojenik olasılığı yüksek bir varyant tespit edilirse, bu durum klinik bağlam, yayınlanmış kanıtlar ve önerilen sonraki adımlarla birlikte doktorlara sunuma hazır raporunuzda açıkça belirtilecektir. Klinik açıdan önemli tüm bulguları, aile üyeleri için izleme, risk azaltma veya kaskad testlerine ilişkin kararlar konusunda size rehberlik edebilecek doktorunuzla veya bir genetik danışmanla paylaşmanızı öneririz.
Bu, 23andMe veya AncestryDNA gibi tüketici DNA testlerinden ne farkı var?
Tüketiciye yönelik DNA testleri, genomunuzun %0,1’inden daha azını okuyan genotipleme çipleri kullanır — bu, önceden seçilmiş, yaygın varyantlardan oluşan çok küçük bir kümedir. Bu testler, klinik genetik bulgular için değil, soy ve popülasyon düzeyindeki özellikler için optimize edilmiştir. Dante Genom Testi, genomunuzun %100'ünü 30X kapsama ile diziler; bu, klinik tanı ortamlarında kullanılan standartla aynıdır. Bu iki testin kapsamı, metodolojisi veya klinik yararı açısından karşılaştırılması mümkün değildir.
Sonuçların alınması ne kadar sürer ve nasıl iletilir?
Örnek alma setiniz, siparişinizden sonraki 48 saat içinde kargoya verilir. Örneğiniz CLIA sertifikalı laboratuvarımıza ulaştığında, dizileme ve analiz işlemleri 6–8 hafta sürer. Sonuçlar güvenli bir şekilde Genome Manager hesabınıza gönderilir; burada raporlarınıza erişebilir, bunları doktorunuzla paylaşabilir ve genomunuzla karşılaştırılarak doğrulanmış yeni bulgular hakkında otomatik güncellemeler alabilirsiniz.
Dünya çapında hasta hakları savunucusu gruplarla işbirliği yapıyoruz.
Dante Labs, her büyüklükteki hasta hakları savunuculuğu gruplarıyla işbirliği yapmaktadır — Ailesel Adenomatöz Polipozis ve diğer nadir ya da yaygın hastalıklar için. Sanal hasta hakları savunuculuğu grupları da dahil olmak üzere, her ülkedeki gruplara destek veriyoruz.
Üyelerinize özel raporlar, grup indirimleri ve paketler sunabiliriz. Lütfen formu kullanarak bize ulaşın; iki iş günü içinde sizinle iletişime geçeceğiz.
- Üyeleriniz için kişiye özel genom raporları
- Grup indirimleri ve kişiye özel paketler
- Herhangi bir ülke — sanal gruplar dahil
- Kapsam dahilindeki nadir ve yaygın hastalıklar
Mesaj alındı.
2 iş günü içinde sizinle iletişime geçeceğiz. Doğrudan takip etmek isterseniz: hello@dantelabs.com
Tek bir test.
Bir ömür boyu cevaplar.
Evinize gönderilen tek bir kit. Tüm genomunuz, tanı kararlarında kullanılan klinik standartlara göre dizilenir. 6–8 hafta içinde Genome Manager hesabınıza gönderilen 200'den fazla hekimlere uygun rapor — kalıcı ve bilimsel gelişmelerle birlikte güncellenir.
48 saat içinde gönderilir · 6–8 hafta içinde sonuçlanır
