Gen
ATM
ATM serine/threonine kinase
- HGNC 795↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000149311↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 472↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 11q22.3
- Koordinatlar
- Kromozom 11: 108.223.067–108.369.102 (GRCh38)
- Eksonlar
- 146 kb boyunca 63 ekson
- Protein
- 3.056 amino asit, 350,7 kDa
- Diğer adları
- TEL1, TELO1
- Önceki semboller
- ATA, ATDC, ATC, ATD
- MANE Select transkripti
- ENST00000675843.1NM_000051.4
- Lokus türü
- Protein kodlayan
Share this page
Bu sayfanın veri olarak görünümü
Veriyi JSON olarak okumak için sayfa adresinin sonuna .json ekleyin veya application/json isteyin.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/atm.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameATM ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili raporlar
Ataksi-Telanjiektazi
- Otozomal resesif
ATM'nin iki kopyasındaki değişikliklerin neden olduğu, ilerleyici serebellar ataksi, telanjiektazi, bağışıklık yetmezliği ve kanser yatkınlığı.
- ClinGen bu ilişkiyi kesin olarak değerlendiriyor
- 8 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
▶Eyleme geçirilebilirlik
Tanı; enfeksiyon önlemeye ve immünglobulin replasmanına, iyonize radyasyona, kansere maruziyetin en aza indirilmesine ve akciğer takibine, ayrıca yakınlarda taşıyıcılık testine yön verir.
Kadın İnfertilitesi
Bir kadının gebelik oluşturma yeteneğinin azalmış olması veya tamamen bulunmaması.
- ClinGen bu ilişkiyi kesin olarak değerlendiriyor
- 8 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
BRCA1/2 Dışındaki Meme ve Yumurtalık Kanseri Genleri
- ATM ile ilişkili kanser yatkınlığıOtozomal dominant
ATM'deki tek bir varyant meme kanseri riskini orta düzeyde artırır ve pankreas ile prostat kanseriyle ilişkilidir.
- ClinGen bu ilişkiyi kesin olarak değerlendiriyor
- 1 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
▶Eyleme geçirilebilirlik
Genellikle artırılmış meme taraması önerilir; ATM varyantı taşıyan bir partneri olan taşıyıcıların, çocuklarında ataksi-telanjiektazi riskini öğrenmek isteyebilir.
- Kalıtsal meme kanseriOtozomal dominant
Birkaç genden birindeki varyantların neden olduğu, meme kanserine kalıtsal yatkınlık.
- 2 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
▶Eyleme geçirilebilirlik
Gene bağlı olarak, MRI dahil olmak üzere daha erken ve daha yoğun meme taramaları önerilebilir.
Daha geniş gruplar
Diğer Doğuştan İmmün Yetmezlikler
- İmmün Yetmezlik Hastalığı
Buna bağlı 170 gen arasından biri
Hücresel veya humoral bağışıklık mekanizmalarında eksiklik ya da bozukluk bulunan hastalık.
- ClinGen bu ilişkiyi kesin olarak değerlendiriyor
- 8 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
▶Eyleme geçirilebilirlik
Ağır kombine immün yetmezlik (SCID) ve ağır primer immün yetmezlikler için HSCT; antikor eksikliklerinde immünoglobulin replasmanı (IVIG/SCIG); APDS için lenyolisib (Joenja, FDA 2023); ADA-SCID için gen tedavisi; CTLA4/LRBA eksikliği için abatasept; profilaktik antibiyotikler; KGH için G-CSF
Kalıtsal Nörodejeneratif Hastalıklar
- KIF5A ile İlişkili Nörodejeneratif HastalıkOtozomal dominant
Buna bağlı 372 gen arasından biri
KIF5A genindeki bir kopyadaki değişikliklerden kaynaklanır. Bu gen, yük bağlayıcı bir kuyruğa sahip motor bir proteini kodlar. Farklı tipteki değişiklikler farklı hastalıklara yol açar: herediter spastik paraplejinin 10. tipi, Charcot-Marie-Tooth hastalığının aksonal bir formu ve amyotrofik lateral skleroz (ALS).
- ClinGen bu ilişkiyi kesin olarak değerlendiriyor
- 8 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
▶Eyleme geçirilebilirlik
Tedavi semptomlara yöneliktir ve tabloya bağlıdır; fizyoterapi, antispastisite ilaçları ve multidisipliner ALS bakımını içerir. Etkilenmiş bir kişinin her çocuğunun bu değişikliği miras alma olasılığı 2'de 1'dir; genetik danışmanlık ailelerin bunu anlamasına yardımcı olur.
ATM geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Bilinen hastalığa yol açan bölgeler
- Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
- Sayfası olan varyantlar
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 146 kb uzunluğunun 12,9 kb'sini oluşturur; bu bazların 9.171 tanesi proteini kodlar.
ATM Dizilemesi
2Kolay
ATM geninin kısa okumalarla dizilenmesinin ne kadar zor olduğu, 100 üzerinden
0 · Kolay100 · Zor
ATM geninin ekzonlarının neredeyse tamamı, kısa okumaların temiz biçimde eşleştiği yerlerde bulunuyor.
Buna eklenen etken: ATM geninin ekzonlarının her bir zor bölge türündeki payı
- Eşlenebilirlik100 veya 250 bp'lik okumaların tek bir yere yerleştirilemediği bölgeler; bu bölgelerdeki bir çağrı eksik veya yanlış olabilir. Tek başına, tamamı bu türde bir bölgede bulunan bir gen 100 puan alırdı.%0,5
- HomolojiGenomun başka yerlerindeki, paralog ve psödogenler gibi, %90 veya daha yüksek özdeşlikle kopyalanmış segmental duplikasyonlar. Tek başına, tamamı bu türde bir bölgede bulunan bir gen 60 puan alırdı.%0
- chrY ile ortak bölgelerchrX ve chrY'nin aynı veya neredeyse aynı diziyi taşıdığı pseudoautosomal bölgeler ve X'e transpoze olmuş bölge; bu nedenle bir chrX okuması chrY'ye yerleştirilmiş olabilir. Tek başına, tamamı bu türde bir bölgede bulunan bir gen 60 puan alırdı.%0
- Referans kapsamıYakınlardaki referans birleştirmesindeki boşluklar; okumaların hizalanacağı bir dizinin bulunmadığı yerler. Tek başına, tamamı bu türde bir bölgede bulunan bir gen 50 puan alırdı.%0
- TekrarlarOkumaların kaydığı ve tamamını kapsayamayabildiği ardışık tekrarlar ve tek bazın tekrarladığı diziler. Tek başına, tamamı bu türde bir bölgede bulunan bir gen 30 puan alırdı.%2,1
- GC içeriğiG ve C oranı %25'in altında veya %65'in üzerinde olan pencereler; kütüphane hazırlığı bu pencereleri seyrek kapsar. Tek başına, tamamı bu türde bir bölgede bulunan bir gen 20 puan alırdı.%5,4
Dante Labs'in, NIST'in zor dizilenen bölgelerin Genome in a Bottle haritaları üzerine kurulu kendi araştırmasından elde edilen bir Dante Labs puanı.Puanın hesaplanma biçimiHer çubuk, ATM geninin ekzon bazlarının o zor bölge türündeki payını gösterir. Her tür tek başına bir geni zor hale getirebilir ve her ek tür daha az katkı yapar: hiçbir bazın hiçbirinde yer almadığı durumda 0, her bazın tek bir yere yerleştirilemediği bölgede olduğu durumda 100.
2.935
ClinVar'ın bir değişikliği patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı ATM içindeki konumlar
Bunların 11 tanesi (%0,4), kısa okumaların zorlandığı bölgelere düşüyor.
- Low mappabilityRegions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely. (11 konum)
Tam genom dizilemesi, intronlar dahil olmak üzere ATM geninin tamamını, yani 146 kb'ın tamamını kapsar; yalnızca 12,9 kb'lık ekzonları değil.
Sayfası olan varyantlar (811)
Burada sayfası bulunan ATM varyantları, en çok inceleme yıldızına sahip olanlar önce gelecek şekilde listelenmiştir. Her sayfa, varyantla ilgili ClinVar'ın kamuya açık kaydını açıklar; hiçbir zaman bir sonuç değildir.
| Varyant | HGVS c. | Ekzon veya intron | Konum (GRCh38) | ClinVar sınıflandırması | İnceleme durumu |
|---|---|---|---|---|---|
| A911Rfs*19 | c.2730_2731insAG | Ekzon 18 | 108.268.501 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| c.2T>C | Ekzon 2 | 108.227.626 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş | |
| c.332-1G>A | İntron 4 | 108.235.669 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş | |
| c.496+5G>A | İntron 5 | 108.235.839 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş | |
| c.1122_1123del | Ekzon 9 | 108.248.987 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş | |
| c.1607+1G>T | İntron 10 | 108.251.073 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş | |
| c.2251-2A>T | İntron 14 | 108.257.479 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş | |
| c.2251-4A>G | İntron 14 | 108.257.477 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş | |
| c.2466+5G>C | İntron 16 | 108.259.080 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş | |
| c.2639-23_2639-21del | İntron 17 | 108.268.386 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
ClinVar patojenik varyantlar (3.833)
ClinVar'ın ATM geninde patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı, herhangi bir hastalıkla ilişkili ve en az bir gönderen tarafından kriterlere göre incelenmiş varyantlar ile bunların arasında en çok incelenenler. Bu, ClinVar'ın genin herkese açık kaydıdır, hiçbir zaman bir test sonucu değildir.
- Patojenik 2.826
- Patojenik/muhtemelen patojenik 278
- Muhtemelen patojenik 729
| Varyant | Hastalıklar | ClinVar sınıflandırması | İnceleme durumu |
|---|---|---|---|
| NM_000051.4(ATM):c.2T>C (p.Met1Thr) | ATM-related cancer predisposition | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000051.4(ATM):c.67C>T (p.Arg23Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000051.4(ATM):c.217_218del (p.Glu73fs) | ATM-related cancer predisposition | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000051.4(ATM):c.332-1G>A | ATM-related cancer predisposition | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000051.4(ATM):c.387del (p.Asp130fs) | ATM-related cancer predisposition | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000051.4(ATM):c.467G>A (p.Trp156Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000051.4(ATM):c.480_484del (p.Gln161fs) | ATM-related cancer predisposition | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000051.4(ATM):c.496+5G>A | ATM-related cancer predisposition | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000051.4(ATM):c.748C>T (p.Arg250Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000051.4(ATM):c.790del (p.Tyr264fs) | ATM-related cancer predisposition | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000051.4(ATM):c.824del (p.Ser274_Leu275insTer) | ATM-related cancer predisposition | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000051.4(ATM):c.1122_1123del (p.Glu376fs) | ATM-related cancer predisposition | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000051.4(ATM):c.1158del (p.Lys387fs) | ATM-related cancer predisposition | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000051.4(ATM):c.1355del (p.Thr452fs) | ATM-related cancer predisposition | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000051.4(ATM):c.1396C>T (p.Gln466Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000051.4(ATM):c.1402_1403del (p.Lys468fs) | ATM-related cancer predisposition | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000051.4(ATM):c.1442T>G (p.Leu481Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000051.4(ATM):c.1564_1565del (p.Glu522fs) | ATM-related cancer predisposition | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000051.4(ATM):c.1607+1G>T | ATM-related cancer predisposition | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000051.4(ATM):c.1782del (p.Val595fs) | ATM-related cancer predisposition | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000051.4(ATM):c.2152dup (p.Cys718fs) | ATM-related cancer predisposition | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000051.4(ATM):c.2251-2A>T | ATM-related cancer predisposition | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000051.4(ATM):c.2284_2285del (p.Leu762fs) | ATM-related cancer predisposition | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000051.4(ATM):c.2413C>T (p.Arg805Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| NM_000051.4(ATM):c.2508dup (p.Ser837fs) | ATM-related cancer predisposition | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
Aynı durumlarla ilişkili genler
- FMR1fragile X messenger ribonucleoprotein 12 durumu paylaşıyor
- TWNKtwinkle mtDNA helicase2 durumu paylaşıyor
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 11 durumu paylaşıyor
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial1 durumu paylaşıyor
- ABCB7ATP binding cassette subfamily B member 71 durumu paylaşıyor
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 11 durumu paylaşıyor
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipase1 durumu paylaşıyor
- ACER3alkaline ceramidase 31 durumu paylaşıyor
- ACO2aconitase 21 durumu paylaşıyor
- ADAadenosine deaminase1 durumu paylaşıyor
- ADARadenosine deaminase RNA specific1 durumu paylaşıyor
- ADPRSADP-ribosylserine hydrolase1 durumu paylaşıyor
ATM ile bağlantılı özellikler
Human Phenotype Ontology, ATM geninin neden olabileceği nadir hastalıklarda görülen özellikler olarak bunları listeler. Her özelliğin sayfasında, o özellikle bağlantılı diğer genler listelenir.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Difficulty articulating speech
- Progressive cerebellar ataxia
- Abnormal gait
- Abnormal speech pattern
- Abnormality of movement
- Choreoathetosis
- Glioblastoma multiforme
29 özellik daha göster
- Tremor
- Anxiety
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Delayed speech and language development
- Depression
- Difficulty performing quick and alternating movements
- Epilepsy
- Inability to walk
- Intention tremor
- Irritability
- Migraine
- Rise in pressure inside skull
- Slurred speech
- Abnormal pyramidal sign
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Cognitive impairment
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
- Diminished deep tendon reflex
- Dystonia
- Jerking
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- B-cell lymphoma
- Decreased blood lymphocyte number
- Acute lymphoblastic leukemia
- Bone marrow disease
- Gastrointestinal bleeding
- Blood cancer
- Cancer of lymphatic system
- Decreased total CD4+ T cell proportion
3 özellik daha göster
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal fallopian tube morphology
- Ovarian cancer
- Polycystic ovaries
- Abnormality of the testis
- Prostate cancer
- Urinary tract neoplasm
- Uterine cancer
- Abnormal sperm development
1 özellik daha göster
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'den MANE Select v1.5: transkript, ekson ve kodlayan dizi.
- 2026-10-21 tarihli GenCC ve ClinGen: genin hangi durumlarla ilişkili olduğu ve bu ilişkinin ne kadar güçlü olduğu.
- ACMG ikincil bulgular listesi, SF v3.2.
- ClinVar ve GIAB tabakalandırmaları: bilinen hastalığa neden olan bölgeler ve kısa okumaların zorlandığı alanlar.
- NIST'ten Genome in a Bottle genom tabakalandırmaları: dizileme zorluk puanı.
- Human Phenotype Ontology, 2026-09-01 sürümü: genle bağlantılı özellikler. Daha fazla bilgi için hpo.jax.org adresini ziyaret edin.
- Veri sürümü 2026.10.21-c791e85a.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). ATM geni: ATM serine/threonine kinase. Erişim tarihi: 23 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/atm
Dante Labs. ATM geni: ATM serine/threonine kinase [Internet]. [alıntı tarihi 23 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/atm
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde