Dante Omics AI, Rockefeller Üniversitesi, Giunta Lab ve küresel ortaklardan oluşan bir ağ ile birlikte, karmaşık hücre mühendisliği deneylerinde en yaygın olarak kullanılan standartlardan biri olan RPE-1 hücre hattı için en eksiksiz ve en doğru diploid referans genomunu oluşturdu.
Bu dönüm noktası, dünya çapındaki araştırmacılara gerçek bir “kaynak kodu” sunarak yapısal karmaşıklık, genomik stabilite ve CRISPR temelli mühendislik konusunda daha derin içgörüler elde etmelerini sağlıyor.
Bunun önemi nedir?
RPE-1 hücre dizisi, hücre biyolojisi, kanser araştırmaları ve genom düzenleme alanlarında dünya çapında bir referans niteliğindedir. Ancak bugüne kadar genom bilgisi eksik olduğundan, önemli bölgeler belirsiz kalmış ya da tamamen eksikti.
Yeni düzenlememiz bunu değiştiriyor:
► Diploid bütünlük – hem anne hem de baba kaynaklı haplotipler kromozomlar genelinde belirlenmiştir.► Ultra yüksek doğruluk – birden fazla kromozomda %99,9999'un üzerinde.► Karmaşık bölgelerin tam kapsamı – sentromerler, tekrarlanan diziler ve yapısal açıdan zorlu DNA dizileri artık haritalanmıştır.► Çoklu platform entegrasyonu – Illumina kısa okuma verileri, PacBio HiFi, Oxford Nanopore uzun okuma verileri ve tamamlayıcı kaynaklardan elde edilen veriler.► Açık erişim – RPE1v1.1 montajı artık NCBI ve UCSC Genom Tarayıcısı üzerinden erişilebilir.
Birlikte gerçekleştirilen bir başarı
Bu proje, aşağıdakileri içeren küresel bir konsorsiyumun bir araya getirdiği uzmanlık sayesinde gerçekleştirilebildi:
Rockefeller ÜniversitesiGiunta LaboratuvarıRoma Sapienza ÜniversitesiTennessee ÜniversitesiTrieste Bilim ParkıL’Aquila ÜniversitesiDante Omics AI
Dante Omics AI’nin CEO’su Andrea Riposati şöyle açıkladı: “Kaynak kodun bazı kısımları olmadan yazılım hatalarını gidermeyi hayal edin. Bu yapılandırma sayesinde araştırmacılar, RPE-1 hücreleri için nihayet eksiksiz ve doğru bir ‘kaynak koda’ sahip oldular – daha önce görünmez olan en karmaşık bölgelere kadar.”
Bilim ve tıp için sonuçları
Hücre mühendisliğinde yeni bir standart: CRISPR ve diğer düzenleme teknikleri artık daha güvenilir bir referans kaynağına dayanabilir.DNA’nın karmaşıklığının daha derinlemesine incelenmesi: Eskiden erişilemeyen sentromerler ve tekrarlanan diziler artık araştırma konusu haline gelmiştir.Araştırma alanlarında daha geniş etki: Onkolojiden sentetik biyolojiye kadar, bu genom dünya çapında deneylerin hassasiyetini artırmaktadır.Gelecekteki dizilimler için bir model: Bu yaklaşım, diğer hücre hatlarına ve türlere de genişletilebilir.
Sonuç
"Bulanıklıktan 4K'ya" başlığı, sadece bir manşetten ibaret değil; genomik araştırmalar için bir dönüm noktasıdır. Dante Omics AI ve ortakları, yapay zeka ile hızlandırılmış çoklu omik analizleri en son sekanslama teknolojileriyle birleştirerek, biyolojinin en önemli hücre modellerinden biri için bugüne kadarki en net genomik şemayı ortaya koydu.
➡ BusinessWire'daki basın bültenini okuyun
Dante Labs'tan yeni gönderileri alın
Genomik alanındaki gelişmeler, ürün güncellemeleri ve klinik bakış açıları — doğrudan e-posta kutunuza.
