Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

TGFBRAP1

transforming growth factor beta receptor associated protein 1

Sammanfattning

Cytogenetisk position
2q12.1-q12.2
Koordinater
Kromosom 2: 105 264 414–105 329 735 (GRCh38)
Exoner
12 exoner på 65,3 kb
Protein
860 aminosyror
Även känd som
TRAP-1, TRAP1, VPS3
MANE Select-transkript
ENST00000393359.7NM_004257.6
Lokustyp
Proteinkodande
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser TGFBRAP1 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är TGFBRAP1 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 2, med en parentes där TGFBRAP1 finns. TGFBRAP1 och 6 gener i närheten på kromosom 2, från 104 797 075 till 105 797 074.Kromosom 22q12.1-q12.2p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.3104,8 Mb105 Mb105,2 Mb105,4 Mb105,6 MbPOU3F3: 104 853 287–104 858 574, framåt-strängPOU3F3MRPS9: 105 037 968–105 099 960, framåt-strängMRPS9GPR45: 105 241 743–105 243 467, framåt-strängGPR45TGFBRAP1: 105 264 414–105 329 735, bakåt-strängTGFBRAP1TSLIG2: 105 337 516–105 360 776, framåt-strängTSLIG2FHL2: 105 352 159–105 438 585, bakåt-strängFHL2NCK2: 105 744 369–105 896 061, framåt-strängNCK2Diagram över TGFBRAP1: 12 exoner på bakåt-strängen av kromosom 2Exon 12: 105 264 414–105 267 559, 3 146 baserExon 11: 105 269 272–105 269 705, 434 baserExon 10: 105 272 855–105 273 014, 160 baserExon 9: 105 273 544–105 273 690, 147 baserExon 8: 105 275 560–105 275 703, 144 baserExon 7: 105 277 614–105 277 671, 58 baserExon 6: 105 280 382–105 280 723, 342 baserExon 5: 105 284 316–105 284 398, 83 baserExon 4: 105 296 356–105 296 510, 155 baserExon 3: 105 298 511–105 298 705, 195 baserExon 2: 105 307 614–105 308 318, 705 baserExon 1: 105 329 625–105 329 735, 111 baser1210864215′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 5,7 kb av genens 65,3 kb, och 2 583 av dessa baser kodar för proteinet.

Sekvensering av TGFBRAP1

5Lätt

Hur svår TGFBRAP1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100

Nästan alla exoner i TGFBRAP1 ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.

Det som tillkommer: andelen av TGFBRAP1s exoner i varje typ av svår region

  • Kartläggbarhet2,6 %
  • Homologi0 %
  • Delas med chrY0 %
  • Referenstäckning0 %
  • Repetitioner2,7 %
  • GC-innehåll6,5 %

Ett Dante Labs-poäng från egen forskning, baserat på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade regioner.Så poängsätts det

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). TGFBRAP1-genen: transforming growth factor beta receptor associated protein 1. Hämtad 19 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/tgfbrap1

Vancouver

Dante Labs. TGFBRAP1-genen: transforming growth factor beta receptor associated protein 1 [Internet]. [citerad 19 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/tgfbrap1

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test