Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

SYNDIG1

synapse differentiation inducing 1

Sammanfattning

Cytogenetisk position
20p11.21
Koordinater
Kromosom 20: 24 469 629–24 666 616 (GRCh38)
Exoner
4 exoner på 197 kb
Protein
258 aminosyror
Även känd som
FLJ14220, IFITMD5, DSPC2
Tidigare symboler
C20orf39, TMEM90B
MANE Select-transkript
ENST00000376862.4NM_024893.3
Lokustyp
Proteinkodande
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser SYNDIG1 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är SYNDIG1 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 20, med en parentes där SYNDIG1 finns. SYNDIG1 och 3 gener i närheten på kromosom 20, från 24 068 123 till 25 068 122.Kromosom 2020p11.21p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3324,2 Mb24,4 Mb24,6 Mb24,8 Mb25 MbSYNDIG1: 24 469 629–24 666 616, framåt-strängSYNDIG1CST7: 24 949 257–24 961 392, framåt-strängCST7APMAP: 24 962 924–24 992 784, bakåt-strängAPMAPACSS1: 25 003 364–25 058 980, bakåt-strängACSS1Diagram över SYNDIG1: 4 exoner på framåt-strängen av kromosom 20Exon 1: 24 469 629–24 469 753, 125 baserExon 2: 24 543 020–24 543 577, 558 baserExon 3: 24 584 856–24 584 993, 138 baserExon 4: 24 665 346–24 666 616, 1 271 baser12345′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 2,1 kb av genens 197 kb, och 777 av dessa baser kodar för proteinet.

Sekvensering av SYNDIG1

5Lätt

Hur svår SYNDIG1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100

Nästan alla exoner i SYNDIG1 ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.

Det som tillkommer: andelen av SYNDIG1s exoner i varje typ av svår region

  • Kartläggbarhet0 %
  • Homologi0 %
  • Delas med chrY0 %
  • Referenstäckning0 %
  • Repetitioner3,6 %
  • GC-innehåll22 %

Ett Dante Labs-poäng från egen forskning, baserat på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade regioner.Så poängsätts det

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). SYNDIG1-genen: synapse differentiation inducing 1. Hämtad 20 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/syndig1

Vancouver

Dante Labs. SYNDIG1-genen: synapse differentiation inducing 1 [Internet]. [citerad 20 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/syndig1

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test