Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

NFATC1

nuclear factor of activated T cells 1

Sammanfattning

Cytogenetisk position
18q23
Koordinater
Kromosom 18: 79 395 930–79 529 323 (GRCh38)
Exoner
10 exoner på 133,4 kb
Protein
943 aminosyror
Även känd som
NF-ATC, NFATc, NFAT2
MANE Select-transkript
ENST00000427363.7NM_001278669.2
Lokustyp
Proteinkodande
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser NFATC1 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är NFATC1 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 18, med en parentes där NFATC1 finns. NFATC1 och 5 gener i närheten på kromosom 18, från 78 962 627 till 79 962 626.Kromosom 1818q23p11.32p11.31p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q2379 Mb79,2 Mb79,4 Mb79,6 Mb79,8 MbSALL3: 78 979 419–79 002 677, framåt-strängSALL3ATP9B: 79 069 259–79 378 391, framåt-strängATP9BNFATC1: 79 395 930–79 529 323, framåt-strängNFATC1CTDP1: 79 679 781–79 756 608, framåt-strängCTDP1KCNG2: 79 797 904–79 900 184, framåt-strängKCNG2SLC66A2: 79 901 157–79 951 677, bakåt-strängSLC66A2Diagram över NFATC1: 10 exoner på framåt-strängen av kromosom 18Exon 1: 79 395 930–79 396 351, 422 baserExon 2: 79 410 403–79 411 501, 1 099 baserExon 3: 79 433 579–79 433 738, 160 baserExon 4: 79 448 782–79 448 984, 203 baserExon 5: 79 450 954–79 451 126, 173 baserExon 6: 79 451 676–79 451 816, 141 baserExon 7: 79 461 311–79 461 366, 56 baserExon 8: 79 467 450–79 467 582, 133 baserExon 9: 79 486 248–79 486 937, 690 baserExon 10: 79 527 528–79 529 323, 1 796 baser12468105′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 4,9 kb av genens 133,4 kb, och 2 832 av dessa baser kodar för proteinet.

Sekvensering av NFATC1

11Lätt

Hur svår NFATC1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100

Nästan alla exoner i NFATC1 ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.

Det som tillkommer: andelen av NFATC1s exoner i varje typ av svår region

  • Kartläggbarhet0 %
  • Homologi0 %
  • Delas med chrY0 %
  • Referenstäckning0 %
  • Repetitioner1,8 %
  • GC-innehåll55 %

Ett Dante Labs-poäng från egen forskning, baserat på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade regioner.Så poängsätts det

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). NFATC1-genen: nuclear factor of activated T cells 1. Hämtad 20 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/nfatc1

Vancouver

Dante Labs. NFATC1-genen: nuclear factor of activated T cells 1 [Internet]. [citerad 20 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/nfatc1

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test