Дишенова мишићна дистрофија — најчешћа тешка дечја мишићна дистрофија, где специфична варијанта ДМД одређује за коју од нових терапија за прескакање ексона је дете подобно.
Секвенцирање целог генома очитава цео DMD ген - највећи ген у људском геному са 2,4 милиона базних парова - бележећи све тачке прекида делеције, дупликације и дубоке интронске варијанте које одређују и дијагнозу и подобност за лечење.
Дишенова мишићна дистрофија
Дишенова мишићна дистрофија (ДМД) је X-везани рецесивни неуромускуларни поремећај узрокован патогеним варијантама у гену ДМД на хромозому Xp21.2, који кодира дистрофин - структурни протеин неопходан за интегритет мембране мишићних влакана. Недостатак дистрофина доводи до прогресивне дегенерације мишићних влакана, хроничне упале и замене мишићног ткива фиброзним и масним ткивом. ДМД је најчешћа тешка дечја мишићна дистрофија, која погађа приближно 1 од 3.500-5.000 мушких рођених беба широм света. Почетак се обично јавља између 2. и 5. године живота са слабошћу проксималних мишића, што се манифестује као тешкоће у трчању, пењању уз степенице и устајању са пода (Гауерсов знак). Без лечења, губитак кретања се јавља до 12-13. године, а смрт од респираторне или срчане инсуфицијенције се обично јавља у касним тинејџерским годинама до средине двадесетих година.
Приближно 60-70% варијанти које изазивају ДМД су велике делеције које обухватају један или више ексона, концентрисане у два жаришта региона (егзони 2-20 и ексони 44-55). Велике дупликације чине 5-15% варијанти, а преосталих 20-30% су тачкасте мутације (нонсенс, померање оквира читања, место сплајсовања). Правило оквира читања разликује ДМД од блажег алелног стања Бекерове мишићне дистрофије (БМД): варијанте ван оквира читања које елиминишу функционалну производњу дистрофина узрокују ДМД, док варијанте унутар оквира читања које производе скраћени, али делимично функционалан дистрофин узрокују БМД. Ова корелација генотипа и фенотипа води прогнозу и све више усмерава избор лечења.
Лечење ДМД је трансформисано прецизним терапијама специфичним за генотип. Антисенс олигонуклеотиди који прескачу ексон — етеплирсен (ексон 51, ~13% пацијената са ДМД), голодирсен/вилтоларсен (ексон 53, ~8%) и казимерсен (ексон 45, ~8%) — обнављају оквир за читање како би произвели скраћени, али функционални дистрофин, конвертујући фенотип ДМД ка БМД. Аталурен циља бесмислене (преурањени стоп кодон) варијанте, које чине приближно 10-15% случајева. Терапија замене гена (деландистроген моксепарвовек, одобрен 2023.) користи микродистрофин који се испоручује путем ААВ вектора. Свака од ових терапија захтева дефинитивну карактеризацију варијанти ДМД како би се утврдила подобност — што генетску дијагнозу чини не само дијагностичком већ и директно терапијском.
Правило оквира читања одређује да ли варијанта ДМД производи Дишенову (тешку, ван оквира читања) или Бекерову (блажу, унутар оквира читања) мишићну дистрофију. Прецизна карактеризација тачака прелома одређује подобност за терапију прескакања ексона — одлука која зависи од познавања који су ексони погођени.
Стандардно тестирање делеције/дупликације идентификује укључене ексоне, али не и прецизне интронске тачке прекида. Дубоке интронске варијанте које узрокују абнормално сплајсовање су невидљиве за панеле фокусиране на ексоне. Секвенцирање целог генома пружа комплетну архитектуру варијанти.
Прецизне тачке прекида брисања одређују подобност за прескакање ексона - само тестирање на нивоу ексона није довољно
МЛПА (мултиплексна лигацијом зависна амплификација сонде) — стандардни ДМД дијагностички тест првог нивоа — идентификује који су ексони обрисани или дуплирани, али не може да разреши локације интронских тачака прекида са прецизношћу базних парова. За подобност за терапију прескакања ексона, тачна локација тачке прекида одређује да ли терапеутски прескок ексона може да обнови оквир за читање. Поред тога, сложена преуређења — инверзије, несуседне делеције и инсерције-делеције — нису поуздано детектована помоћу МЛПА. Секвенцирање целог генома мапира тачке прекида делеције на ниво нуклеотида у свих 79 ДМД ексона и посредних 2,2 милиона базних парова интронске секвенце.
20-30% варијанти ДМД су тачкасте мутације које захтевају потпуно секвенцирање гена да би се откриле
Једна трећина пацијената са ДМД има тачкасте мутације — бесмислене, померање оквира читања или варијанте места сплајсовања — уместо великих делеција или дупликација. МЛПА не детектује тачкасте мутације; овим пацијентима је потребно потпуно секвенцирање гена ДМД као други дијагностички корак. Међу пацијентима са тачкастим мутацијама, они са преурањеним варијантама стоп кодона (бесмислене) могу бити подобни за терапију аталуреном. Дубоке интронске варијанте које стварају криптична места сплајсовања представљају додатну категорију која се може детектовати само секвенцирањем изван кодирајућих ексона. Секвенцирање целог генома обухвата делеције, дупликације, тачкасте мутације и дубоке интронске варијанте у једном тесту — елиминишући секвенцијални дијагностички пут са више тестова.
Ваша пуна ДНК (не само њен део)
Традиционално генетско тестирање испитује уске скупове гена, изостављајући већину делова вашег генома. Ми секвенцирамо ваш цео геном - сваки ген и сваку регију између гена.
Свеобухватни увиди и специјализовани извештаји
Лако се чита и садржи одговоре на основу којих ви и ваш лекар можете деловати. Није датотека за тумачење — преко 200 клиничких извештаја, организованих по категоријама.
Ваш тест постаје вреднији сваке године
Ваша ДНК се не мења, али наука о геному се убрзава. Сваког месеца откривају се нове повезаности варијанти и болести. Ми валидирамо ове налазе и аутоматски ажурирамо ваше извештаје. Ваш тест постаје вреднији сваке године.
Резултати које лекари доносе у својим најтежим случајевима.
Четрдесет година неизвесности. Један тест.
Пацијент је провео деценије у здравственом систему Велике Британије без дијагнозе. Дантеови подаци, које су прихватили клинички тимови Националне здравствене службе (NHS) у Универзитетској болници краљице Елизабете у Глазгову, идентификовали су Нунанов синдром и варијанту RUNX1 повезану са леукемијом која је остала неоткривена. После 40 година, коначно су имали одговор.
Потпуно читање даје комплетну слику.
Пацијент је дошао код Дантеа да испита периодичну парализу. Читањем комплетног генома идентификован је истовремени наследни срчани налаз — Бругада синдром — који је њихов лекар потврдио ЕКГ-ом. Резултат је такође објаснио нерешену срчану историју члана породице. Један тест. Сви одговори у њему.
Секвенцирано 2019. Подаци су коришћени 2021. године.
Џенифер је секвенцирала свој геном помоћу Дантеовог метода две године пре него што јој је дијагнозиран рак дојке. Када је лечење почело, Дантеови фармакогеномски подаци су показали да ће јој прописана хемотерапија изазвати озбиљне нежељене ефекте. Њен лекар је изабрао алтернативу — и она је почела са ефикасним лечењем од првог дана.
Свако генетско питање заслужује потпун одговор.
Без обзира да ли тражите одговоре данас или штитите своје здравље за сутра, комплетно читање вашег целог генома је једино место за почетак.
То је у вашој породици. Сада можете знати да ли је у вашим генима.
Ваш геном садржи наслеђене варијанте повезане са медицинским стањима попут срчаних, канцерогених и неуролошких. Читамо их све — са клиничком дубином како бисмо резултату дали значење.
Сазнајте више →Када традиционални лабораторијски тестови кажу да сте добро. А ви знате да нисте.
Стандардни дијагностички тестови проверавају унапред одабрани скуп одговора. Секвенцирамо вашу комплетну ДНК — укључујући делове које ниједан тест није осмишљен да провери. Ако је одговор у вашем геному, помоћи ћемо вам да га пронађете.
Сазнајте више →Ваша дијагноза може бити тачна. Ваш план лечења може бити непотпун.
Ваши гени одређују који третмани ће највероватније деловати, а који неће. Ми пружамо вашем лекару алате и увиде који ће вам помоћи да информишете свој план лечења.
Сазнајте више →Желиш да знаш пре него што нешто наметне питање.
Неки људи не чекају дијагнозу или породичну историју да би деловали. Секвенцирање целог генома вам сада даје комплетну генетску слику — тако да ви и ваш лекар можете доносити информисане одлуке пре него што било шта постане хитно.
Сазнајте више →Већ си урадио ДНК тест. Ево шта ти није могао рећи.
Већина ДНК тестова потрошача чита мање од 0,1% вашег генома. Ми читамо цео геном.
Сазнајте више →Резултати клиничког нивоа. Бирају их појединци, лекари им верују за своје најсложеније случајеве.
Дантеов тест генома помогао је специјалистима у националној болници за акутне болести у Великој Британији у идентификацији Нунановог синдрома и ретке генетске варијанте повезане са леукемијом која је остала неоткривена. Тај резултат је променио медицинску негу пацијента.
Акредитовано од стране и објављено у
Честа питања о секвенцирању целог генома.
Која је разлика између секвенцирања целог генома и циљаног генетског теста?
Циљани генетски тестови — укључујући стандардне панеле за наследни рак — очитавају унапред дефинисану листу познатих варијанти у одређеном скупу гена. Они су дизајнирани да пронађу оно што већ знају да траже. Секвенцирање целог генома очитава цео ваш геном: свих 6 милијарди парова база, сваки ген, сваки регион између гена. Студија клинике Мајо објављена у часопису JAMA Oncology открила је да стандардне смернице за тестирање нису откриле више од половине пацијената са наслеђеним мутацијама рака. Тест генома нема фиксну листу.
Шта ћу добити када моји резултати буду спремни?
Ваш Данте Геном пружа преко 200 извештаја спремних за лекаре, организованих по клиничким категоријама - наследни рак, срчана обољења, ретке болести, фармакогеномика, статус носиоца и још много тога. Извештаји се достављају вашем безбедном Геном Менаџеру и форматирани су за директну клиничку употребу. Подаци вашег генома се трајно чувају и аутоматски поново анализирају како наука напредује.
Шта се дешава ако се пронађе клинички значајна варијанта?
Уколико се идентификује патогена или вероватно патогена варијанта, она ће бити јасно означена у вашем извештају спремном за лекара, заједно са клиничким контекстом, објављеним доказима и препорученим следећим корацима. Препоручујемо да сваки клинички значајан налаз поделите са својим лекаром или генетским саветником, који може да води одлуке о надзору, смањењу ризика или каскадном тестирању чланова породице.
По чему се ово разликује од ДНК теста потрошача као што су 23andMe или AncestryDNA?
ДНК тестови потрошача користе чипове за генотипизацију који очитавају мање од 0,1% вашег генома - мали унапред одабрани скуп уобичајених варијанти. Оптимизовани су за особине порекла и популације, а не за клиничке генетске налазе. Дантеов тест генома секвенцира 100% вашег генома са 30X покривеношћу, истим стандардом који се користи у клиничкој дијагностици. Ова два теста нису упоредива по обиму, методологији или клиничкој корисности.
Колико је времена потребно да се постигну резултати и како се они испоручују?
Ваш комплет за прикупљање узорка се испоручује у року од 48 сати од наручивања. Када ваш узорак стигне у нашу CLIA сертификовану лабораторију, секвенцирање и анализа трају 6–8 недеља. Резултати се безбедно достављају вашем менаџеру генома, где можете приступити својим извештајима, делити их са својим лекаром и примати аутоматска ажурирања како се нови налази потврђују у односу на ваш геном.
Сарађујемо са групама за заступање пацијената широм света.
Данте Лабс сарађује са групама за заступање пацијената било које величине — за Душенову мишићну дистрофију и друга стања, ретка и честа. Подржавамо групе у било којој земљи, укључујући виртуелне групе за заступање пацијената.
Можемо вам пружити прилагођене извештаје, групне попусте и пакете прилагођене вашим члановима. Контактирајте нас путем формулара и ми ћемо вас контактирати у року од два радна дана.
- Прилагођени геномски извештаји за ваше чланове
- Групни попусти и прилагођени пакети
- Било која земља — укључујући виртуелне групе
- Покривена ретка и уобичајена стања
Порука је примљена.
Контактираћемо вас у року од 2 радна дана. За директан контакт: hello@dantelabs.com
Један тест.
Читав живот пун одговора.
Један комплет, послат вам на кућну адресу. Ваш цео геном секвенциран по клиничком стандарду који се користи за дијагностичке одлуке. Више од 200 извештаја спремних за лекаре достављених вашем менаџеру генома за 6–8 недеља — трајни и ажурирани како наука напредује.
Шаље се у року од 48 сати · Резултати за 6–8 недеља
