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Gene

SNED1

sushi, nidogen and EGF like domains 1

Sintesi

Localizzazione citogenetica
2q37.3
Coordinate
Cromosoma 2: 240.998.618–241.095.568 (GRCh38)
Esoni
32 esoni su 97 kb
Proteina
1413 amminoacidi
Noto anche come
FLJ00133, SST3, Snep
Trascritto MANE Select
ENST00000310397.13NM_001080437.3
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

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Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora SNED1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di SNED1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 2, con una parentesi dove si trova SNED1. SNED1 e 19 geni nelle vicinanze sul cromosoma 2, da 240.547.093 a 241.547.092.Cromosoma 22q37.3p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.3240,6 Mb240,8 Mb241 Mb241,2 Mb241,4 MbANKMY1: 240.479.422–240.569.209, filamento inversoANKMY1DUSP28: 240.560.054–240.565.256, filamento direttoDUSP28RNPEPL1: 240.565.804–240.581.372, filamento direttoRNPEPL1CAPN10: 240.586.366–240.618.845, filamento direttoCAPN10GPR35: 240.605.404–240.633.159, filamento direttoGPR35AQP12B: 240.676.418–240.682.906, filamento inversoAQP12BAQP12A: 240.691.866–240.698.483, filamento direttoAQP12AKIF1A: 240.713.761–240.824.320, filamento inversoKIF1AAGXT: 240.868.543–240.881.531, filamento direttoAGXTMAB21L4: 240.886.048–240.896.894, filamento inversoMAB21L4CROCC2: 240.906.330–240.993.311, filamento direttoCROCC2SNED1: 240.998.618–241.095.568, filamento direttoSNED1MTERF4: 241.072.169–241.102.332, filamento inversoMTERF4PASK: 241.106.094–241.150.852, filamento inversoPASKPPP1R7: 241.149.549–241.183.652, filamento direttoPPP1R7ANO7: 241.188.509–241.227.338, filamento direttoANO7HDLBP: 241.227.264–241.317.061, filamento inversoHDLBPSEPTIN2: 241.314.923–241.354.030, filamento direttoSEPTIN2FARP2: 241.356.244–241.494.847, filamento direttoFARP2STK25: 241.482.075–241.509.730, filamento inversoSTK25Diagramma di SNED1: 32 esoni sul filamento diretto del cromosoma 2Esone 1: 240.998.618–240.999.050, 433 basiEsone 2: 241.030.284–241.030.571, 288 basiEsone 3: 241.033.735–241.033.875, 141 basiEsone 4: 241.034.568–241.034.730, 163 basiEsone 5: 241.036.790–241.036.915, 126 basiEsone 6: 241.037.240–241.037.353, 114 basiEsone 7: 241.040.075–241.040.188, 114 basiEsone 8: 241.040.300–241.040.413, 114 basiEsone 9: 241.048.315–241.048.440, 126 basiEsone 10: 241.048.662–241.048.766, 105 basiEsone 11: 241.049.022–241.049.135, 114 basiEsone 12: 241.049.817–241.049.933, 117 basiEsone 13: 241.051.744–241.051.860, 117 basiEsone 14: 241.052.041–241.052.157, 117 basiEsone 15: 241.052.355–241.052.468, 114 basiEsone 16: 241.053.153–241.053.326, 174 basiEsone 17: 241.062.791–241.062.904, 114 basiEsone 18: 241.063.587–241.063.700, 114 basiEsone 19: 241.064.012–241.064.125, 114 basiEsone 20: 241.064.844–241.064.957, 114 basiEsone 21: 241.065.299–241.065.595, 297 basiEsone 22: 241.067.764–241.067.947, 184 basiEsone 23: 241.068.911–241.069.023, 113 basiEsone 24: 241.069.920–241.070.201, 282 basiEsone 25: 241.071.576–241.071.720, 145 basiEsone 26: 241.071.796–241.071.878, 83 basiEsone 27: 241.073.266–241.073.364, 99 basiEsone 28: 241.081.677–241.081.793, 117 basiEsone 29: 241.082.277–241.082.364, 88 basiEsone 30: 241.087.392–241.087.475, 84 basiEsone 31: 241.088.365–241.088.402, 38 basiEsone 32: 241.091.638–241.095.568, 3931 basi151015202530325′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 8,4 kb dei 97 kb del gene; 4242 di queste basi codificano la proteina.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

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Dante Labs. (s.d.). Gene SNED1: sushi, nidogen and EGF like domains 1. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/sned1

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Dante Labs. Gene SNED1: sushi, nidogen and EGF like domains 1 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/sned1

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