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Gene

RTL4

retrotransposon Gag like 4

Sintesi

Localizzazione citogenetica
Xq23
Coordinate
Cromosoma X: 112.083.016–112.457.514 (GRCh38)
Esoni
5 esoni su 374,5 kb
Proteina
310 amminoacidi
Noto anche come
Mart4, Mar4, FLJ46608, SIRH11
Simboli precedenti
ZCCHC16
Trascritto MANE Select
ENST00000695839.1NM_001395362.2
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora RTL4. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di RTL4

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma X, con una parentesi dove si trova RTL4. RTL4 e 5 geni nelle vicinanze sul cromosoma X, da 111.708.517 a 112.832.013.Cromosoma XXq23p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q28111,8 Mb112 Mb112,2 Mb112,4 Mb112,6 Mb112,8 MbALG13: 111.665.811–111.766.130, filamento direttoALG13TRPC5: 111.768.011–112.082.776, filamento inversoTRPC5TRPC5OS: 111.876.051–111.903.990, filamento direttoTRPC5OSRTL4: 112.083.016–112.457.514, filamento direttoRTL4LHFPL1: 112.623.833–112.680.180, filamento inversoLHFPL1AMOT: 112.774.466–112.840.903, filamento inversoAMOTDiagramma di RTL4: 5 esoni sul filamento diretto del cromosoma XEsone 1: 112.083.016–112.083.117, 102 basiEsone 2: 112.130.983–112.131.101, 119 basiEsone 3: 112.306.361–112.306.520, 160 basiEsone 4: 112.431.114–112.431.168, 55 basiEsone 5: 112.454.500–112.457.514, 3015 basi123455′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 3,5 kb dei 374,5 kb del gene; 933 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di RTL4

0Bassa

Quanto è difficile sequenziare RTL4 con letture corte, su 100

  • Mappabilità0,4%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni0,1%
  • Contenuto di GC3%
  • Copertura di riferimento0%

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene RTL4: retrotransposon Gag like 4. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/rtl4

Vancouver

Dante Labs. Gene RTL4: retrotransposon Gag like 4 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/rtl4

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