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Gene

PTPRJ

protein tyrosine phosphatase receptor type J

Sintesi

Localizzazione citogenetica
11p11.2
Coordinate
Cromosoma 11: 47.980.559–48.170.839 (GRCh38)
Esoni
25 esoni su 190,3 kb
Proteina
1337 amminoacidi
Noto anche come
DEP1, HPTPeta, CD148
Trascritto MANE Select
ENST00000418331.7NM_002843.4
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

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Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora PTPRJ. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di PTPRJ

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 11, con una parentesi dove si trova PTPRJ. PTPRJ e 15 geni nelle vicinanze sul cromosoma 11, da 47.575.699 a 48.575.698.Cromosoma 1111p11.2p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q2547,6 Mb47,8 Mb48 Mb48,2 Mb48,4 MbNDUFS3: 47.565.336–47.584.565, filamento direttoKBTBD4: 47.572.196–47.578.982, filamento inversoKBTBD4FAM180B: 47.586.207–47.589.195, filamento direttoFAM180BC1QTNF4: 47.589.666–47.595.642, filamento inversoC1QTNF4MTCH2: 47.604.339–47.642.698, filamento inversoMTCH2AGBL2: 47.659.591–47.715.389, filamento inversoAGBL2FNBP4: 47.716.494–47.767.460, filamento inversoFNBP4NUP160: 47.777.872–47.848.561, filamento inversoNUP160PTPRJ: 47.980.559–48.170.839, filamento direttoPTPRJOR4B1: 48.216.810–48.217.739, filamento direttoOR4B1OR4X2: 48.245.104–48.246.015, filamento direttoOR4X2OR4X1: 48.263.861–48.264.778, filamento direttoOR4X1OR4S1: 48.306.223–48.307.152, filamento direttoOR4S1OR4C3: 48.324.920–48.325.955, filamento direttoOR4C3OR4C5: 48.365.485–48.366.465, filamento inversoOR4C5OR4A47: 48.488.793–48.489.722, filamento direttoOR4A47Diagramma di PTPRJ: 25 esoni sul filamento diretto del cromosoma 11Esone 1: 47.980.559–47.981.008, 450 basiEsone 2: 48.110.058–48.110.076, 19 basiEsone 3: 48.112.747–48.112.983, 237 basiEsone 4: 48.121.003–48.121.266, 264 basiEsone 5: 48.123.613–48.123.870, 258 basiEsone 6: 48.124.968–48.125.186, 219 basiEsone 7: 48.127.780–48.128.043, 264 basiEsone 8: 48.130.459–48.130.716, 258 basiEsone 9: 48.136.039–48.136.296, 258 basiEsone 10: 48.137.003–48.137.281, 279 basiEsone 11: 48.139.486–48.139.776, 291 basiEsone 12: 48.142.919–48.143.050, 132 basiEsone 13: 48.144.675–48.144.885, 211 basiEsone 14: 48.145.000–48.145.124, 125 basiEsone 15: 48.146.876–48.146.963, 88 basiEsone 16: 48.149.447–48.149.488, 42 basiEsone 17: 48.149.990–48.149.998, 9 basiEsone 18: 48.150.096–48.150.183, 88 basiEsone 19: 48.153.796–48.153.886, 91 basiEsone 20: 48.155.801–48.155.874, 74 basiEsone 21: 48.155.985–48.156.119, 135 basiEsone 22: 48.159.930–48.160.049, 120 basiEsone 23: 48.163.458–48.163.618, 161 basiEsone 24: 48.164.380–48.164.515, 136 basiEsone 25: 48.167.204–48.170.839, 3636 basi15101520255′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 7,8 kb dei 190,3 kb del gene; 4014 di queste basi codificano la proteina.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.

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Dante Labs. (s.d.). Gene PTPRJ: protein tyrosine phosphatase receptor type J. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/ptprj

Vancouver

Dante Labs. Gene PTPRJ: protein tyrosine phosphatase receptor type J [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/ptprj

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