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Gene

LSM3

LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated

Sintesi

Localizzazione citogenetica
3p25.1
Coordinate
Cromosoma 3: 14.178.817–14.201.122 (GRCh38)
Esoni
4 esoni su 22,3 kb
Proteina
102 amminoacidi
Noto anche come
YLR438C, SMX4, USS2
Trascritto MANE Select
ENST00000306024.4NM_014463.3
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora LSM3. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di LSM3

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 3, con una parentesi dove si trova LSM3. LSM3 e 9 geni nelle vicinanze sul cromosoma 3, da 13.689.970 a 14.689.969.Cromosoma 33p25.1p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q2913,8 Mb14 Mb14,2 Mb14,4 Mb14,6 MbWNT7A: 13.816.157–13.880.104, filamento inversoWNT7ACHCHD4: 14.112.077–14.124.876, filamento inversoCHCHD4TMEM43: 14.124.998–14.143.681, filamento direttoTMEM43: 14.135.217–14.148.252, filamento direttoXPC: 14.145.145–14.178.767, filamento inversoXPCLSM3: 14.178.817–14.201.122, filamento direttoLSM3SLC6A6: 14.402.564–14.489.349, filamento direttoSLC6A6GRIP2: 14.489.107–14.556.075, filamento inversoGRIP2CCDC174: 14.651.746–14.674.940, filamento direttoCCDC174FAM149C: 14.675.141–14.773.036, filamento direttoFAM149CDiagramma di LSM3: 4 esoni sul filamento diretto del cromosoma 3Esone 1: 14.178.817–14.178.881, 65 basiEsone 2: 14.181.560–14.181.670, 111 basiEsone 3: 14.183.937–14.184.032, 96 basiEsone 4: 14.198.036–14.201.122, 3087 basi12345′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 3,4 kb dei 22,3 kb del gene; 309 di queste basi codificano la proteina.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

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Dante Labs. (s.d.). Gene LSM3: LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/lsm3

Vancouver

Dante Labs. Gene LSM3: LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/lsm3

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