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Gene

LRIG3

leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3

Sintesi

Localizzazione citogenetica
12q14.1
Coordinate
Cromosoma 12: 58.872.155–58.920.504 (GRCh38)
Esoni
19 esoni su 48,4 kb
Proteina
1119 amminoacidi
Noto anche come
FLJ90440, KIAA3016
Trascritto MANE Select
ENST00000320743.8NM_153377.5
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora LRIG3. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di LRIG3

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 12, con una parentesi dove si trova LRIG3. LRIG3 e 0 geni nelle vicinanze sul cromosoma 12, da 58.396.330 a 59.396.329.Cromosoma 1212q14.1p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3358,4 Mb58,6 Mb58,8 Mb59 Mb59,2 MbLRIG3: 58.872.155–58.920.504, filamento inversoLRIG3Diagramma di LRIG3: 19 esoni sul filamento inverso del cromosoma 12Esone 19: 58.872.155–58.872.816, 662 basiEsone 18: 58.874.055–58.874.330, 276 basiEsone 17: 58.874.430–58.874.573, 144 basiEsone 16: 58.876.445–58.876.603, 159 basiEsone 15: 58.877.400–58.877.852, 453 basiEsone 14: 58.878.824–58.879.105, 282 basiEsone 13: 58.880.581–58.880.901, 321 basiEsone 12: 58.882.869–58.883.032, 164 basiEsone 11: 58.883.520–58.883.591, 72 basiEsone 10: 58.885.831–58.885.902, 72 basiEsone 9: 58.886.810–58.886.890, 81 basiEsone 8: 58.887.789–58.887.932, 144 basiEsone 7: 58.888.329–58.888.472, 144 basiEsone 6: 58.888.819–58.888.962, 144 basiEsone 5: 58.889.996–58.890.139, 144 basiEsone 4: 58.890.665–58.890.796, 132 basiEsone 3: 58.913.982–58.914.056, 75 basiEsone 2: 58.914.265–58.914.336, 72 basiEsone 1: 58.920.000–58.920.504, 505 basi191816141210864215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 4 kb dei 48,4 kb del gene; 3360 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di LRIG3

2Bassa

Quanto è difficile sequenziare LRIG3 con letture corte, su 100

  • Mappabilità0%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni1,3%
  • Contenuto di GC22%
  • Copertura di riferimento0%

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene LRIG3: leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/lrig3

Vancouver

Dante Labs. Gene LRIG3: leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/lrig3

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