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Gene

GADL1

GAD like acidic amino acid decarboxylase 1

Sintesi

Localizzazione citogenetica
3p24.1-p23
Coordinate
Cromosoma 3: 30.726.197–30.894.661 (GRCh38)
Esoni
15 esoni su 168,5 kb
Proteina
521 amminoacidi
Trascritto MANE Select
ENST00000282538.10NM_207359.3
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora GADL1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di GADL1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 3, con una parentesi dove si trova GADL1. GADL1 e 1 gene nelle vicinanze sul cromosoma 3, da 30.310.429 a 31.310.428.Cromosoma 33p24.1-p23p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q2930,4 Mb30,6 Mb30,8 Mb31 Mb31,2 MbTGFBR2: 30.606.478–30.694.249, filamento direttoTGFBR2GADL1: 30.726.197–30.894.661, filamento inversoGADL1Diagramma di GADL1: 15 esoni sul filamento inverso del cromosoma 3Esone 15: 30.726.197–30.728.415, 2219 basiEsone 14: 30.778.179–30.778.268, 90 basiEsone 13: 30.786.355–30.786.406, 52 basiEsone 12: 30.800.889–30.801.088, 200 basiEsone 11: 30.833.853–30.833.934, 82 basiEsone 10: 30.834.217–30.834.281, 65 basiEsone 9: 30.838.997–30.839.113, 117 basiEsone 8: 30.844.210–30.844.264, 55 basiEsone 7: 30.844.387–30.844.466, 80 basiEsone 6: 30.849.996–30.850.111, 116 basiEsone 5: 30.850.835–30.850.941, 107 basiEsone 4: 30.854.699–30.854.789, 91 basiEsone 3: 30.857.015–30.857.141, 127 basiEsone 2: 30.861.593–30.861.765, 173 basiEsone 1: 30.894.578–30.894.661, 84 basi15141210864215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 3,7 kb dei 168,5 kb del gene; 1566 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento GADL1

3Facile

Quanto è difficile sequenziare GADL1 con letture corte, su 100

Quasi tutti gli esoni di GADL1 si trovano in punti in cui le letture corte si allineano in modo chiaro.

Cosa aggrava il quadro: la quota degli esoni di GADL1 in ciascun tipo di regione difficile

  • Mappabilità0%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni8%
  • Contenuto GC15%
  • Copertura del riferimento0%

Un punteggio Dante Labs basato su nostre ricerche, costruito sulle mappe delle regioni difficili da sequenziare Genome in a Bottle del NIST.Come viene calcolato il punteggio

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

Cita questa pagina

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Dante Labs. (s.d.). Gene GADL1: GAD like acidic amino acid decarboxylase 1. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/gadl1

Vancouver

Dante Labs. Gene GADL1: GAD like acidic amino acid decarboxylase 1 [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/gadl1

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