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Gene

ECHDC2

enoyl-CoA hydratase domain containing 2

Sintesi

Localizzazione citogenetica
1p32.3
Coordinate
Cromosoma 1: 52.895.910–52.921.740 (GRCh38)
Esoni
10 esoni su 25,8 kb
Proteina
292 amminoacidi
Noto anche come
FLJ10948
Trascritto MANE Select
ENST00000371522.9NM_001198961.2
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora ECHDC2. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di ECHDC2

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 1, con una parentesi dove si trova ECHDC2. ECHDC2 e 14 geni nelle vicinanze sul cromosoma 1, da 52.408.825 a 53.408.824.Cromosoma 11p32.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4452,6 Mb52,8 Mb53 Mb53,2 Mb53,4 MbPRPF38A: 52.404.060–52.421.226, filamento direttoPRPF38ATUT4: 52.408.282–52.553.504, filamento inversoTUT4GPX7: 52.602.280–52.609.143, filamento direttoGPX7SHISAL2A: 52.633.168–52.670.143, filamento direttoSHISAL2ACOA7: 52.662.885–52.698.369, filamento inversoCOA7ZYG11B: 52.726.390–52.827.336, filamento direttoZYG11BZYG11A: 52.842.511–52.894.998, filamento direttoZYG11AECHDC2: 52.895.910–52.921.740, filamento inversoECHDC2SCP2: 52.927.255–53.051.708, filamento direttoSCP2PODN: 53.061.293–53.093.681, filamento direttoPODNSLC1A7: 53.087.179–53.142.638, filamento inversoSLC1A7CPT2: 53.196.770–53.214.197, filamento direttoCPT2CZIB: 53.214.099–53.220.657, filamento inversoCZIBMAGOH: 53.226.638–53.238.626, filamento inversoMAGOHLRP8: 53.242.364–53.328.469, filamento inversoLRP8Diagramma di ECHDC2: 10 esoni sul filamento inverso del cromosoma 1Esone 10: 52.895.910–52.896.597, 688 basiEsone 9: 52.897.437–52.897.484, 48 basiEsone 8: 52.899.174–52.899.224, 51 basiEsone 7: 52.904.646–52.904.833, 188 basiEsone 6: 52.905.034–52.905.090, 57 basiEsone 5: 52.906.519–52.906.611, 93 basiEsone 4: 52.907.868–52.907.954, 87 basiEsone 3: 52.911.566–52.911.653, 88 basiEsone 2: 52.911.723–52.911.790, 68 basiEsone 1: 52.921.553–52.921.740, 188 basi10864215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 1,6 kb dei 25,8 kb del gene; 879 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di ECHDC2

2Bassa

Quanto è difficile sequenziare ECHDC2 con letture corte, su 100

  • Mappabilità0%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni0,4%
  • Contenuto di GC20%
  • Copertura di riferimento0%

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene ECHDC2: enoyl-CoA hydratase domain containing 2. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/echdc2

Vancouver

Dante Labs. Gene ECHDC2: enoyl-CoA hydratase domain containing 2 [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/echdc2

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