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Gene

DUSP8

dual specificity phosphatase 8

Sintesi

Localizzazione citogenetica
11p15.5
Coordinate
Cromosoma 11: 1.554.051–1.572.271 (GRCh38)
Esoni
7 esoni su 18,2 kb
Proteina
625 amminoacidi
Noto anche come
HVH-5, HB5, FLJ42958
Simboli precedenti
C11orf81
Trascritto MANE Select
ENST00000397374.8NM_004420.3
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora DUSP8. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di DUSP8

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 11, con una parentesi dove si trova DUSP8. DUSP8 e 22 geni nelle vicinanze sul cromosoma 11, da 1.063.161 a 2.063.160.Cromosoma 1111p15.5p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q251,2 Mb1,4 Mb1,6 Mb1,8 Mb2 MbMUC2: 1.074.875–1.110.511, filamento direttoMUC2MUC5AC: 1.157.953–1.201.138, filamento direttoMUC5ACMUC5B: 1.223.066–1.262.172, filamento direttoMUC5BTOLLIP: 1.264.771–1.310.258, filamento inversoTOLLIPBRSK2: 1.389.899–1.462.689, filamento direttoBRSK2MOB2: 1.469.457–1.501.247, filamento inversoMOB2DUSP8: 1.554.051–1.572.271, filamento inversoDUSP8KRTAP5-1: 1.584.342–1.585.283, filamento inversoKRTAP5-1KRTAP5-2: 1.597.177–1.598.294, filamento inversoKRTAP5-2KRTAP5-3: 1.607.565–1.608.463, filamento inversoKRTAP5-3KRTAP5-4: 1.620.958–1.622.138, filamento inversoKRTAP5-5: 1.629.775–1.630.930, filamento direttoKRTAP5-6: 1.697.195–1.697.755, filamento direttoKRTAP5-6IFITM10: 1.732.406–1.750.607, filamento inversoIFITM10: 1.734.821–1.763.954, filamento inversoCTSD: 1.752.752–1.764.573, filamento inversoCTSDSYT8: 1.828.307–1.837.521, filamento direttoSYT8TNNI2: 1.838.971–1.841.680, filamento direttoTNNI2LSP1: 1.850.904–1.892.267, filamento direttoLSP1PRR33: 1.888.078–1.917.713, filamento inversoPRR33TNNT3: 1.919.456–1.938.711, filamento direttoTNNT3MRPL23: 1.947.278–2.014.943, filamento direttoMRPL23H19: 1.995.165–2.004.552, filamento inversoH19Diagramma di DUSP8: 7 esoni sul filamento inverso del cromosoma 11Esone 7: 1.554.051–1.557.574, 3524 basiEsone 6: 1.557.794–1.557.917, 124 basiEsone 5: 1.558.112–1.558.271, 160 basiEsone 4: 1.558.889–1.559.055, 167 basiEsone 3: 1.563.851–1.563.989, 139 basiEsone 2: 1.565.596–1.565.934, 339 basiEsone 1: 1.571.901–1.572.271, 371 basi76543215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 4,8 kb dei 18,2 kb del gene; 1878 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento DUSP8

31Difficile

Quanto è difficile sequenziare DUSP8 con letture corte, su 100

Gran parte di DUSP8 si trova in punti in cui le letture corte possono non rilevare o collocare in modo errato una variazione.

Cosa aggrava il quadro: la quota degli esoni di DUSP8 in ciascun tipo di regione difficile

  • Mappabilità1,6%
  • Omologia67%
  • Ripetizioni15%
  • Contenuto GC80%
  • Copertura del riferimento0%

Un punteggio Dante Labs basato su nostre ricerche, costruito sulle mappe delle regioni difficili da sequenziare Genome in a Bottle del NIST.Come viene calcolato il punteggio

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene DUSP8: dual specificity phosphatase 8. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/dusp8

Vancouver

Dante Labs. Gene DUSP8: dual specificity phosphatase 8 [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/dusp8

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