Vai al contenuto
Usa i fondi del tuo conto HSA o FSA
Sequenzia il tuo genoma (si apre in una nuova scheda)

Gene

COLGALT1

collagen beta(1-O)galactosyltransferase 1

Sintesi

Localizzazione citogenetica
19p13.11
Coordinate
Cromosoma 19: 17.555.649–17.583.157 (GRCh38)
Esoni
12 esoni su 27,5 kb
Proteina
622 amminoacidi
Noto anche come
FLJ22329
Simboli precedenti
GLT25D1
Trascritto MANE Select
ENST00000252599.9NM_024656.4
Tipo di locus
Protein-coding
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora COLGALT1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di COLGALT1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 19, con una parentesi dove si trova COLGALT1. COLGALT1 e 37 geni nelle vicinanze sul cromosoma 19, da 17.069.403 a 18.069.402.Cromosoma 1919p13.11p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4317,2 Mb17,4 Mb17,6 Mb17,8 Mb18 MbHAUS8: 17.049.729–17.075.625, filamento inversoHAUS8MYO9B: 17.075.728–17.214.537, filamento direttoMYO9BUSE1: 17.215.337–17.220.245, filamento direttoUSE1OCEL1: 17.226.198–17.229.219, filamento direttoOCEL1NR2F6: 17.229.207–17.245.953, filamento inverso: 17.235.940–17.255.448, filamento inversoUSHBP1: 17.249.171–17.282.786, filamento inversoBABAM1: 17.267.343–17.281.249, filamento diretto: 17.267.418–17.282.966, filamento direttoANKLE1: 17.281.645–17.287.649, filamento direttoABHD8: 17.292.131–17.310.236, filamento inversoABHD8MRPL34: 17.292.543–17.306.847, filamento direttoDDA1: 17.309.518–17.323.315, filamento direttoDDA1ANO8: 17.323.223–17.334.864, filamento inversoANO8GTPBP3: 17.334.920–17.342.735, filamento direttoGTPBP3PLVAP: 17.351.450–17.377.356, filamento inversoPLVAPCCDC194: 17.387.196–17.394.201, filamento inversoCCDC194BST2: 17.402.933–17.407.393, filamento inversoBST2MVB12A: 17.405.722–17.436.364, filamento direttoMVB12ATMEM221: 17.435.509–17.448.679, filamento inversoTMEM221: 17.436.611–17.460.804, filamento inversoNXNL1: 17.455.425–17.460.926, filamento inversoNXNL1SLC27A1: 17.467.666–17.506.190, filamento direttoSLC27A1PGLS: 17.511.607–17.521.288, filamento direttoPGLSNIBAN3: 17.523.301–17.553.839, filamento direttoNIBAN3COLGALT1: 17.555.649–17.583.157, filamento direttoCOLGALT1UNC13A: 17.601.327–17.688.382, filamento inversoUNC13AMAP1S: 17.719.242–17.734.515, filamento direttoMAP1SFCHO1: 17.747.701–17.788.572, filamento direttoFCHO1B3GNT3: 17.794.697–17.814.175, filamento direttoB3GNT3INSL3: 17.816.512–17.821.574, filamento inversoINSL3JAK3: 17.824.780–17.848.071, filamento inversoJAK3RPL18A: 17.859.868–17.871.283, filamento direttoRPL18ASLC5A5: 17.871.939–17.895.174, filamento direttoSLC5A5CCDC124: 17.932.588–17.944.914, filamento direttoCCDC124KCNN1: 17.947.484–18.000.085, filamento direttoKCNN1ARRDC2: 18.001.126–18.015.694, filamento direttoARRDC2IL12RB1: 18.058.995–18.098.944, filamento inversoIL12RB1Diagramma di COLGALT1: 12 esoni sul filamento diretto del cromosoma 19Esone 1: 17.555.649–17.555.973, 325 basiEsone 2: 17.559.311–17.559.421, 111 basiEsone 3: 17.560.348–17.560.465, 118 basiEsone 4: 17.567.406–17.567.540, 135 basiEsone 5: 17.568.509–17.568.713, 205 basiEsone 6: 17.572.483–17.572.602, 120 basiEsone 7: 17.577.195–17.577.271, 77 basiEsone 8: 17.577.361–17.577.467, 107 basiEsone 9: 17.577.957–17.578.089, 133 basiEsone 10: 17.579.482–17.579.609, 128 basiEsone 11: 17.580.699–17.580.905, 207 basiEsone 12: 17.581.177–17.583.157, 1981 basi1246810125′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 3,6 kb dei 27,5 kb del gene; 1869 di queste basi codificano la proteina.

Tratti collegati a COLGALT1

L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che COLGALT1 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.

Cita questa pagina

APA

Dante Labs. (s.d.). Gene COLGALT1: collagen beta(1-O)galactosyltransferase 1. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/colgalt1

Vancouver

Dante Labs. Gene COLGALT1: collagen beta(1-O)galactosyltransferase 1 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/colgalt1

Un solo test. Risposte per tutta la vita.

A partire da 449 $Spedizione gratuita · Risultati in 6–8 settimane

Ottieni il mio Genome Test