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Gene

CLRN3

clarin 3

Sintesi

Localizzazione citogenetica
10q26.2
Coordinate
Cromosoma 10: 127.877.841–127.892.941 (GRCh38)
Esoni
3 esoni su 15,1 kb
Proteina
226 amminoacidi
Noto anche come
MGC32871, USH3AL1
Simboli precedenti
TMEM12
Trascritto MANE Select
ENST00000368671.4NM_152311.5
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora CLRN3. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di CLRN3

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 10, con una parentesi dove si trova CLRN3. CLRN3 e 5 geni nelle vicinanze sul cromosoma 10, da 127.385.391 a 128.385.390.Cromosoma 1010q26.2p15.3p15.2p15.1p14p13p12.33p12.32p12.31p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.31q23.32q23.33q24.1q24.2q24.31q24.32q24.33q25.1q25.2q25.3q26.11q26.12q26.13q26.2q26.3127,4 Mb127,6 Mb127,8 Mb128 Mb128,2 MbDOCK1: 126.905.388–127.453.803, filamento direttoDOCK1NPS: 127.549.309–127.553.540, filamento direttoNPSFOXI2: 127.737.118–127.741.183, filamento direttoFOXI2CLRN3: 127.877.841–127.892.941, filamento inversoCLRN3PTPRE: 127.906.800–128.085.856, filamento direttoPTPREMKI67: 128.096.659–128.126.458, filamento inversoMKI67Diagramma di CLRN3: 3 esoni sul filamento inverso del cromosoma 10Esone 3: 127.877.841–127.878.420, 580 basiEsone 2: 127.883.696–127.883.875, 180 basiEsone 1: 127.892.556–127.892.941, 386 basi3215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 1,1 kb dei 15,1 kb del gene; 681 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di CLRN3

0Bassa

Quanto è difficile sequenziare CLRN3 con letture corte, su 100

  • Mappabilità0%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni1,5%
  • Contenuto di GC0%
  • Copertura di riferimento0%

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene CLRN3: clarin 3. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/clrn3

Vancouver

Dante Labs. Gene CLRN3: clarin 3 [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/clrn3

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