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Gene

CATSPERD

catsper channel auxiliary subunit delta

Sintesi

Localizzazione citogenetica
19p13.3
Coordinate
Cromosoma 19: 5.720.637–5.778.734 (GRCh38)
Esoni
22 esoni su 58,1 kb
Proteina
798 amminoacidi
Noto anche come
MGC39581
Simboli precedenti
TMEM146
Trascritto MANE Select
ENST00000381624.4NM_152784.4
Tipo di locus
gene with protein product

Genoma di riferimentoGRCh38

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Struttura di CATSPERD

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 19, con una parentesi dove si trova CATSPERD. CATSPERD e 25 geni nelle vicinanze sul cromosoma 19, da 5.249.686 a 6.249.685.Cromosoma 1919p13.3p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.435,4 Mb5,6 Mb5,8 Mb6 Mb6,2 MbPTPRS: 5.158.495–5.340.941, filamento inversoPTPRSZNRF4: 5.455.417–5.456.856, filamento direttoZNRF4TINCR: 5.552.723–5.578.349, filamento inversoTINCRSAFB2: 5.586.981–5.624.046, filamento inversoSAFB2SAFB: 5.622.963–5.668.478, filamento direttoSAFBRPL36: 5.674.947–5.691.881, filamento direttoRPL36MICOS13: 5.678.414–5.680.940, filamento inversoMICOS13HSD11B1L: 5.680.604–5.688.524, filamento direttoHSD11B1LLONP1: 5.691.834–5.720.572, filamento inversoLONP1CATSPERD: 5.720.637–5.778.734, filamento direttoCATSPERDPRR22: 5.782.960–5.784.752, filamento inversoPRR22: 5.784.005–5.785.619, filamento inversoDUS3L: 5.784.832–5.791.225, filamento inversoDUS3LNRTN: 5.805.053–5.828.324, filamento direttoNRTNFUT6: 5.830.361–5.839.722, filamento inversoFUT6FUT3: 5.842.257–5.851.535, filamento inversoFUT3FUT5: 5.865.826–5.870.540, filamento inversoFUT5: 5.866.171–5.903.787, filamento inversoNDUFA11: 5.891.207–5.904.006, filamento inversoNDUFA11VMAC: 5.904.723–5.910.853, filamento direttoVMAC: 5.904.841–5.914.707, filamento direttoCAPS: 5.912.339–5.916.211, filamento direttoRANBP3: 5.916.138–5.978.288, filamento inversoRFX2: 5.993.164–6.199.572, filamento inversoRFX2ACSBG2: 6.135.247–6.193.094, filamento direttoACSBG2MLLT1: 6.210.377–6.280.029, filamento inversoMLLT1Diagramma di CATSPERD: 22 esoni sul filamento diretto del cromosoma 19Esone 1: 5.720.637–5.720.808, 172 basiEsone 2: 5.724.808–5.724.862, 55 basiEsone 3: 5.727.268–5.727.344, 77 basiEsone 4: 5.729.872–5.729.944, 73 basiEsone 5: 5.733.856–5.733.970, 115 basiEsone 6: 5.737.138–5.737.205, 68 basiEsone 7: 5.739.326–5.739.439, 114 basiEsone 8: 5.744.427–5.744.510, 84 basiEsone 9: 5.745.913–5.746.063, 151 basiEsone 10: 5.748.160–5.748.255, 96 basiEsone 11: 5.749.101–5.749.183, 83 basiEsone 12: 5.751.647–5.751.823, 177 basiEsone 13: 5.754.132–5.754.245, 114 basiEsone 14: 5.757.843–5.757.932, 90 basiEsone 15: 5.759.086–5.759.144, 59 basiEsone 16: 5.763.215–5.763.293, 79 basiEsone 17: 5.766.103–5.766.155, 53 basiEsone 18: 5.768.168–5.768.242, 75 basiEsone 19: 5.770.944–5.771.072, 129 basiEsone 20: 5.772.788–5.772.965, 178 basiEsone 21: 5.776.161–5.776.315, 155 basiEsone 22: 5.778.376–5.778.734, 359 basi12468101214161820225′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 2,6 kb dei 58,1 kb del gene; 2397 di queste basi codificano la proteina.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

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Dante Labs. (s.d.). Gene CATSPERD: catsper channel auxiliary subunit delta. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/catsperd

Vancouver

Dante Labs. Gene CATSPERD: catsper channel auxiliary subunit delta [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/catsperd

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