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Gene

CARF

calcium responsive transcription factor

Sintesi

Localizzazione citogenetica
2q33.2
Coordinate
Cromosoma 2: 202.912.275–202.988.263 (GRCh38)
Esoni
17 esoni su 76 kb
Proteina
725 amminoacidi
Noto anche come
FLJ21579, NYD-SP24
Simboli precedenti
ALS2CR8
Trascritto MANE Select
ENST00000438828.4NM_024744.17
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

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Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora CARF. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di CARF

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 2, con una parentesi dove si trova CARF. CARF e 8 geni nelle vicinanze sul cromosoma 2, da 202.450.269 a 203.450.268.Cromosoma 22q33.2p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.3202,6 Mb202,8 Mb203 Mb203,2 Mb203,4 MbBMPR2: 202.375.835–202.567.751, filamento direttoBMPR2FAM117B: 202.634.969–202.769.757, filamento direttoFAM117BICA1L: 202.773.150–202.872.103, filamento inversoICA1LWDR12: 202.874.261–203.014.798, filamento inversoWDR12CARF: 202.912.275–202.988.263, filamento direttoCARFNBEAL1: 203.014.608–203.226.378, filamento direttoNBEAL1CYP20A1: 203.238.952–203.306.026, filamento direttoCYP20A1ABI2: 203.328.213–203.447.728, filamento direttoABI2RAPH1: 203.394.345–203.535.478, filamento inversoRAPH1Diagramma di CARF: 17 esoni sul filamento diretto del cromosoma 2Esone 1: 202.912.275–202.913.102, 828 basiEsone 2: 202.917.877–202.918.043, 167 basiEsone 3: 202.924.297–202.924.415, 119 basiEsone 4: 202.941.860–202.941.980, 121 basiEsone 5: 202.942.740–202.942.967, 228 basiEsone 6: 202.952.559–202.952.679, 121 basiEsone 7: 202.954.005–202.954.134, 130 basiEsone 8: 202.955.674–202.955.758, 85 basiEsone 9: 202.961.237–202.961.426, 190 basiEsone 10: 202.966.978–202.967.098, 121 basiEsone 11: 202.969.919–202.970.062, 144 basiEsone 12: 202.971.505–202.971.738, 234 basiEsone 13: 202.974.334–202.974.496, 163 basiEsone 14: 202.977.269–202.977.332, 64 basiEsone 15: 202.981.555–202.981.685, 131 basiEsone 16: 202.982.072–202.982.441, 370 basiEsone 17: 202.983.506–202.988.263, 4758 basi1246810121416175′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 8 kb dei 76 kb del gene; 2178 di queste basi codificano la proteina.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

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Dante Labs. (s.d.). Gene CARF: calcium responsive transcription factor. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/carf

Vancouver

Dante Labs. Gene CARF: calcium responsive transcription factor [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/carf

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